Sự đa dạng di truyền trong bộ gene thứ cấp cryptomonads doc

Sự đa dạng di
truy
ền trong bộ gene
thứ cấp
cryptomonads


Nhóm tảo
cryptomonads
được coi là nhóm
tảo kỳ bí trong số
các nhóm tảo đơn
bào nước ngọt và
nước mặn mà


plastid của chúng có được
thông quá tiến trình "nuốt"
và "giữ lại" một thể cộng sinh
thứ cấp (tức thể cộng sinh
eukaryote).

Cùng với nhóm tảo
chlorarachniophyte,
cryptomonads biểu hiện sự bất
thường trong cấu trúc thành
ph

ần của chúng ở chỗ chúng giữ
lại nhân của thể cộng sinh dưới
dạng thu gọn tối đa gọi là
nucleomorph (nuleo - nhân;
morph- hình thái - tạm dịch
nucleomorph là nhân thứ cấp
dựa trên ngữ nghĩa và cấu trúc
tế bào nhóm tảo này). Bộ gene
nhân thứ cấp của một lòai
cryptomonads Guillardia
theta đã được đọc trọn vẹn năm
2001, và với 3 nhiễm sắc thể có
chiều dài tổng cộng 551 kb cho
thấy đây là một hình m
ẫu của sự
nét chặt bộ gene trong nhân. Sử
dụng bộ gene thứ cấp
của Guillardia theta như là
điểm mốc, các nhà khoa học
Canada đã tiến hành nghiên cứu
về cấu trúc và thành phần của 9
lòai cryptomnads khác. Bản
thảo của công trình này đã được
tạp chí Molecular Biology and
Evolution chấp nhận và chờ
công bố chính thức (MBE
Advance Access published o
nline o n November 23,
2005, Molecular Biology and
Evolution,

doi:10.1093/molbev/msj066)


Trong công trình này, các tác
giả đọc trình tự của các
gene 18S rDNA của 9 lòai
cryptomonads và 4
mảnh hsp90, đồng thời sử dụng
kỹ thuật điện di trên trường đi
ện
xung cũng như kỹ thuật lai
Southern để ước tính kích
thước 9 bộ gene nhân thứ cấp
của 9 lòai này. Ngòai ta nhóm
tác giả còn sử dụng kỹ thuật
PCR dài (long PCR) để
khuếch đại mảnh genome nhân
thứ cấp của hai chủng Hanusia
phi
CCMP325 vàProteomonas
sulcata CCMP704, hai mảnh
này được cho là có liên
quan đền vùng cận cuối của
nhiễm sắc thể số 1 nhân thứ
cấp G. theta.

Kết quả cho thấy rằng:

a- Bộ gene thứ cấp luôn chứa 3
nhiễm sắc thế, cho thấy đây

là đặc tính chung của bộ gene
thứ cấp ở cryptomonads.

b- Tuy nhiên kích thư
ớc của các
nhiễm sắc thể này biến
thiên mạnh mẽ giữa các lòai
cryptomonads dùng trong thí
nghiệm.

c- Trong số đó chủng không tên
CCMP1178 mang bộ gene thứ
cấp lớn nhất, khỏang 845 kb,
được biết cho đến nay.

d- Việc giảm kích thước bộ
gene nhân thứ cấp có vẻ đã xảy
ra rất nhiều lần và hòan tòan đ
ộc
lập với nhau trong suốt tiến
trình tiến hóa của
cryptomonads.

e- Mặc dù kích thước bộ gene
nhân thứ cấp thay đổi nhưng tr
ật
tự gene, ít nhất khi xét quan hệ
thứ tự 18S
rDNA, ubc4 và hsp90, cho thấy
là không thay đổi.

f- Các tác giả còn lý gi
ải rằng sự
tái tổ hợp nội nhiễm sắc thể có
thể làm thay đổi kích thước và
trình tự vùng phụ cận cuối lặp
lại nằm giữa locus 18S
rDNA và ubc4.

Các kết quả này hé mở tính đa
dạng di truyền c
ủa bộ gene nhân
thứ cấp cryptomonads đ
ồng thời
thúc đẩy nghiên cứu tòan bộ
trình tự bộ gene này ở những
lòai tương cận xa và gần.