BÀI TẬP LỚN DỊCH VỤ ENTREZ-TUTOR CỦA NCBI

BÀI TẬP LỚN
DỊCH VỤ ENTREZ/TUTOR
CỦA NCBI
Nhóm 2

Entrez là dịch vụ quản lý và liên kết thông tin của cơ
sở dữ liệu NCBI

Dịch vụ này đảm nhiệm vai trò kết nối liên thông giữa
các mảng thành một tổng thể
tìm kiếm nhanh và dễ dàng
Giao diện trang chủ của dịch vụ Entrez:
Giao diện của dịch vụ: Entrez/tutor
Các ứng dụng của cở sở dữ liệu
Entrez/tutorial

Nhận dạng một đặc trưng,đặc điểm trình tự mRNA
trong hàng tỷ chuỗi nằm trong ngân hàng dữ liệu
nucleotide của Entrez.

Lấy được những thông tin liên quan và ghi chép về
một protein

Nhận dạng những vùng bảo thủ của protein

Nhận dạng những đột biến trong gen hoặc protein

Tìm cấu trúc 3 chiều của protein hoặc sự vắng mặt
của nó; nhận biết cấu trúc của các chuỗi tương đồng


Xem xét biểu hiện gen và download những vùng trình
tự cần xác định
Giao diện của Entrez Help

Nguyên tắc khi tìm kiếm trong Help sẽ sử dụng các tài
liệu thành phần của Entrez được biết như là PubMed,
sử dụng đường link tới PubMed Help

Việc tìm kiếm trong Entrez Help được thực hiện bằng
cách gõ từ khóa; có thể tìm trong tập sách đang tìm,
trong tất cả các quyển sách, trong cơ sở PubMed, hay
trong tất cả các trang Help của NCBI (tick vào cơ sở
dữ liệu bạn muốn tìm)
Giao diện của Entrez Databaes

Có thể gõ trực tiếp từ khóa vào cửa sổ tìm
kiếm hoặc sử dụng những đường link ở
dưới

Tìm kiếm bản gốc và những sửa chữa
được cập nhật.

Dữ liệu bao gồm Nucleotide và trình tự,
cấu trúc protein, bộ gen đã được giải trình
tự, phân loại và các lĩnh vực khác…
Ví dụ sử dụng đường link:
Khi di chuyển chuột tới
mục cần tìm kiếm, sẽ xuất

hiện đường link tới các
mục liên quan
Kích chuột vào phần bạn
quan tâm
- Gõ từ khóa bạn quan tâm
- Nếu bạn không nhớ chính xác từ đó,và bạn gõ sai thì
chương trình sẽ tìm từ có cấu trúc gần đúng nhất và yêu
cầu bạn xác nhận lại
Gõ từ khóa
vào đây
Kích đây để hiển
thị kết quả tìm
kiếm
Kết quả tìm kiếm:
Giao diện của Batch Entrez
Sử dụng Batch Entrez để tải một file của Gls hoặc
bổ xung dữ liệu về Nucleotide hoặc Protein; hoặc tải
lên một danh sách bản ghi tương tự từ cơ sở dữ liệu
khác của Entrez
Giao diện của Entrez Utilitise
Entrez Utilitise là công cụ cung cấp phương tiện
đến các cơ sở dữ liệu bên ngoài Entrez trên giao diện
câu hỏi của các trang Web hợp thức khác; và có thể
giúp cho việc lấy ra kết quả tìm kiếm sử dụng trong
tương lai trong một môi trường khác
Giao diện của LinkOut

LinkOut là một dịch vụ của Entrez, cho phép truy cập
từ PubMed và bất cứ cơ sở dữ liệu Entrez tới một
phạm vi mở rộng thông tin và dịch vụ vượt qua ngoài

giới hạn Entrez

Chỉ áp dụng cho một hồ sơ dữ liệu đặc trưng, cụ thể

Thông qua các đương link làm thuận tiện tiếp cận các
nguồn dữ liệu mở rộng, dễ hiểu, bổ xung đã được tìm
thấy bằng Entrez