Tải bản đầy đủ (.pdf) (45 trang)

HƯỚNG DẪN SỬ DỤNG MÁY REALTIME PCR

Bạn đang xem bản rút gọn của tài liệu. Xem và tải ngay bản đầy đủ của tài liệu tại đây (5.22 MB, 45 trang )

CÔNG TY TNHH THIẾT BỊ B.D.E
HƯỚNG DẪN SỬ DỤNG

MÁY REALTIME PCR
Model:

DTPRIME 5M1
DTPRIME 4M1
DTLITE 5S1
DTLITE 4S1


PHẦN I – TỔNG QUAN
1. Tổng quan thiết bị

2. Hệ thống điều khiển và hiển thị
Hệ thống điều khiển và hiển thị bao gồm bàn phím điều khiển bằng tay và màn hình LCD hiển thị quy
trình chạy khuếch đại.
Push-button trên màn hình menu hiển thị các chức năng của Push-button và đưa ra chế độ hoạt động.
Push-button của bộ phận điều khiển gia nhiệt hoạt động theo chỉ dẫn bên dưới:


 Mở và đóng bộ phận gia nhiệt và đặt ống vào khay gia nhiệt trước khi chạy PCR. 
 Xác định chính xác vị trí các bộ phận gia nhiệt bên dưới.
Khi thiết bị hoạt động dưới sự điều khiển của máy tính, mở và đóng nắp có thể sử dụng.


nằm dưới phím
trong cửa sổ Running của phần mềm RealTime_PCR.



Màn hình LCD hiển thị thông tin chương trình khuếch đại và quy trình chạy như hình dưới:

Cài đặt phần mềm theo 2 bước:
1. Cài đặt driver thiết bị.
2. Cài đặt phần mềm.
2.1. Cài đặt Driver thiết bị

Bật PC và đợi cho hệ thống khởi động xong. 


Bỏ đĩa CD vào trong ổ đĩa CD-ROM. Trong trường hợp không có ổ đĩa CD-ROM, tải driver từ
website />

Bật thiết bị sử dụng phím nguồn phía sau thiết bị.


Hệ thống hoạt động chỉ ra thiết bị mới trong 1-2 phút (đợi tin nhắn 

Hiển thị trên màn hình máy tính) và bắt đầu quá trình cài đặt driver sử dụng
Found New Hardware Wizard
Chú ý! Khi cài đặt driver trên PC với Windows 7, Windows 8 hoặc Windows 10, Found New
Hardware Wizard sẽ không tự động xuất hiện. Thực hiện theo các chỉ dẫn bên dưới:





 Sau khi kết nối thiết bị với máy tính, mở cửa sổ Device Manager, sau đó click chuột phải vào
DT-964 và lựa chọn Update driver trong danh sách.
 Trong cửa sổ Driver Updating lựa chọn Manual driver search and installation, click

Browse, lựa chọn folder Drivers_DT96x_W32_2014 (cho phiên bản 32-bit) hoặc folder
Drivers_DT96x_W64_2014 (cho phiên bản 64-bit).
 Click Next và hoàn tất quá trình cài đặt driver như miêu tả bên dưới.


Hiển thị Wizard cho cài đặt driver
 Lựa chọn No, not this time và click



Lựa chọn loại cài đặt
 Lựa chọn Install from a list of specific location và click




Tìm folder Drivers_DT96x trên CD
 Chọn đường dẫn đến thư mục bằng cách chọn Add this location to the search và click


Lựa chọn folder Drivers_DT96x trên CD
 Trong cửa sổ Browse For Folder lựa chọn Drivers_DT96x folder trên CD và click
 Chắc chắn rằng các bước thực hiện là đúng và nhấn




Lựa chọn inf-file trên CD
Lựa chọn phiên bản cuối cùng của driver và bỏ qua tin nhắn xác nhận The driver has no digital
signature lựa chọn driver bằng nhấn


Thêm cài đặt cho Driver_DT96x
 Xác nhận lựa chọn driver bằng nhấn
 Lựa chọn đường dẫn đến file trên CD bằng nhấn





Lựa chọn đường dẫn đến file to Dt964R.sys trên CD

 Cửa sổ Locate file tìm thấy ở Drivers DT96x trên CD, lựa chọn và nhấn

Xác nhận lựa chọn file Dt964R.sys trên CD






 Chắc chắn rằng đường dẫn đến file trên cửa sổ là đúng, nhấn


Sau khi tin nhắn cài đặt driver hoàn tất hiển thị, nhấn

.
.

Hoàn thành cài đặt Driver
Nếu cài đặt driver hoàn tất, hệ thống hiển thị lời nhắn


2.2. Cài đặt phần mềm RealTime_PCR
Cài đặt phần mềm theo các bước:
 Lựa chọn ngôn ngữ Russian/English sử dụng trong suốt quá trình cài đặt và nhấn OK

Lựa chọn ngôn ngữ


 Cài đặt Wizard xuất hiện.

Cài đặt Wizard cho RealTime_PCR
Lựa chọn folder cài đặt phần mềm. Có thể lựa chọn cài đặt RealTime_PCR trong folder mặc định
hoặc lựa chọn folder trên ổ cứng bằng nhấn

Lựa chọn Folder để cài đặt phần mềm.


 Lựa chọn folder cài đặt nhấn

.

 Lựa chọn tên folder, đường tắt RealTime_PCR sẽ được tạo và nhấn

Lựa chọn folder để tạo đường dẫn

.


 Cửa sổ xác nhận sẽ xuất hiện, phần mềm sẵn sàng được cài đặt. Kiểm tra lựa chọn và nhấn
.


Cửa sổ xác nhận
Sau khi cài đặt hoàn tất, theo dõi cửa sổ bên dưới. Nhấn

để thoát khỏi cài đặt Wizard.

Hoàn tất quá trình cài đặt Wizard cho RealTime_PCR
Chú ý! TĐể đảm bảo điều kiện hoạt động của thiết bị, Server_RTDevice bao gồm phần mềm
RealTime_PCR. Phần mềm này bắt đầu bằng chế độ
với biểu
tượng

hiển thị trên màn hình PC.


Click chuột phải vào biểu tượng, màn hình hiên thị như bên dưới:

Show List_Device hiển thị danh sách các thiết bị kết nối với PC.

3. Hướng dẫn hoạt động
3.1. Bật nguồn thiết bị và hiển thị RealTime_PCR
Kiểm tra liệu tằng thiết bị đã được kết nối với máy tính thông qua cáp nối USB hay chưa. Sau đó bật thiết
bị và PC.
Bắt đầu phần mềm RealTime_PCR. Trong cửa sổ này lựa chọn chế độ hoạt động. Guest được mặc định
(không khuyến cáo sử dụng). Lựa chọn toán tử khác bằng cách lựa chọn phím chỉ hướng và thêm toán tử
(nhấn phím chỉ hướng và kéo xuống dòng cuối cùng). Gõ tên Operator và lựa chọn Directory ở file chạy
protocol và các kết quả khảo nghiệm sẽ được lưu trữ. Nhấn OK và lựa chọn Device operation.

Cửa sổ bắt đầu RealTime_PCR
RealTime_PCR is launched trong chế độ Device operation của cửa sổ chạy chương trình với việc chỉ ra

trạng thái thiết bị được hiển thị. Trong dòng trạng thái
, cửa sổ thiết bị có sẵn được
hiển thị trong List of devices


Cửa sổ kết nối các thiết bị
Lựa chọn thiết bị để bắt đầu bằng cách nhấn

.

Thiết bị sẽ kết nối với PC và đưa ra dòng trạng thái hoạt động bằng hiển thị
Sau quá trình tự kiểm tra, dòng trạng thái sẽ thay đổi thành
động.

.
và thiết bị đã sẵn sàng hoạt

Hướng dẫn chi tiết của quá trình bắt đầu và hoạt động của phần mềm RealTime_PCR được miêu tả trong
phần II của hướng dẫn sử dụng Software guidance.
Ý nghĩa dòng trạng thái hiển thị:
– thiết bị đã được bật và sẵn sàng hoạt động (nền xanh lá).
– thiết bị đã được bật, tuy nhiên nó chưa sẵn sàng hoạt động (nền vàng) – đây là quá
trình để máy ổn định. Sau quá trình làm ổn định máy (không quá 10 phút), màu nền sẽ chuyển từ vàng
sang xanh lá.
– thiết bị bị ngắt kết nối, nó không được kết nối với PC qua cáp USB2.0 A-B hoặc
không được lựa chọn trong cửa sổ List of devices.
Trong chế độ làm việc chỉ với 1 thiết bị, kết nối hoặc ngắt kết nối của thiết bị bằng cách nhấn

trong cửa sổ List of devices, nó hiển thị tự động trong RealTime_PCR,
và trong khi hoạt động, cửa sổ này có thể mở bằng cách nhấn Preferences/ List of devices ở thanh menu.

Trong chế độ làm việc với nhiều thiết bị, mỗi thiết bị yêu cầu đưa ra phần mền RealTime_PCR của nó
trong cửa sổ cá nhân. Trong trường hợp hoạt động của một số thiết bị có thể được điều khiển đồng thời.
Dòng trạng thái ngày giờ hiển thị
.

, số seri của thiết bị và phiên bản của phần mềm


3.2. Chuẩn bị thiết bị cho PCR
Thiết bị đã sẵn sàng chạy PCR và được kiểm tra mỗi lần sau khi bật nguồn thiết bị. Trong khi bộ tản
nhiệt, tấm gia nhiệt và nhiệt độ của nắp được kiểm tra giá trị thường xuyên.
3.2.1. Kiểm tra cài đặt hình học
Hướng dẫn chi tiết của các kiểm tra cài đặt hình học được miêu tả ở phần II của hướng dẫn sử dụng
Software guidance.
Hình ảnh của tấm giếng gia nhiệt phác thảo ranh giới của một vùng đo phải bao gồm các điểm sáng. Nếu
các vòng tròn bị dịch chuyển tương đối so với điểm sáng, việc hiệu chỉnh hình học cần phải được thực
hiện như hình dưới:

a)

Kiểm tra cài đặt hình học


3.2.2. Cài đặt đo quang

Cửa sổ cài đặt phơi sáng
Hướng dẫn cài đặt chi tiết được miêu tả ở phần II của Software guidance.
3.2.3. Kiểm tra độ sạch của tấm giếng gia nhiệt
Trong khi kiểm tra các thiết lập hình học, người ta phải tăng giá trị phơi sáng lên 2 lần so với giá trị hoạt
động. Không được có những điểm sáng trên hình ảnh của các tấm giếng gia nhiệt bị trống. Trong trường

hợp ngược lại, cần làm sạch giếng bị ô nhiễm bằng bông và cồn.
Nên kiểm tra độ sạch của các giếng trước khi đặt ống nghiệp, strip hoặc khay trộn PCR.
Người dùng phải tiến hành vệ sinh thường xuyên đối với thiết bị, theo dõi phần hướng dẫn bảo trì.
maintenance procedure
3.2.4. Đo độ cao của ống kiểm tra
Chú ý! Chiều cao của ống kiểm tra phải được đo mỗi lần khi sử dụng loại mới


 Nhấn

và đặt ống hoặc strip vào tấm nhiệt. 



Lựa chọn Preference/Device diagnostics/Measure chiều cao của ống trong thanh menu và đợi tin
nhắn hiển thị: 



Lưu giá trị đo bằng nhấn

.

Chú ý! Dể đo chiều cao ống, sử dụng ít nhất 32 ống hoặc 4 strips.


3.3 Tạo Protocol
3.3.1. Bổ sung protocol
Để chạy protocol thực hiện theo các bước:



 Bằng việc sử dụng hướng dẫn Test để lưu các thông số chuẩn. 
 Sử dụng RUN protocol để lưu mẫu trước đó. 

Trong trường hợp chạy protocol, nhập vào dữ liệu theo:







 Chỉ ra mã của mỗi ống thử nghiệm.
 Loại của mỗi ống thử nghiệm. (mẫu, chuẩn hoặc điều khiển +/- );
 Số bản sao của mỗi mẫu. 
 Nồng độ của mẫu hiệu chuẩn. 
 Nhãn huỳnh quang và mục đích của nó.
 Sắp xếp các ống thử nghiệm trong khay nhiệt. 
 Chạy protocol số:
 Tên người dùng.

Hướng dẫn tạo protocol được miêu tả chi tiết ở phần II của Software guidance.

Cửa sổ bổ sung protocol


3.3.2. Tạo/chỉnh sửa chương trình.
Nếu được yêu cầu, tiến hành theo các bước.
1. Mở chương trình bằng nhấn


.

2. Tạo chương trình mới nhấn
3. Chỉnh sửa chương trình bằng nhấn

Tạo chương trình sử dụng sao chép


3.4. Đặt ống kiểm tra với mẫu.
Đặt hoặc chuyển ống kiểm chuẩn cùng với mẫu, làm theo các bước:

a)

b)

1. Nhấn
đến khi nắp nhiệt mở.

trong bảng Start run hoặc nhấn phím điều chỉnh nhiệt bằng tay và đợi cho

2. Nếu là lần đầu sử dụng, sử dụng cồn lau sạch giếng được miêu tả như phần bảo trì.


3. Đặt mẫu vào trong giếng của tấm gia nhiệt.
4. Nhấn
trong cửa sổ Start run hoặc nhấn phím điều khiển thiết bị bằng tay, đợi
cho đến khi tấm gia nhiệt ổn định ở vị trí làm việc.
Chú ý! Chắc chắn cài đặt ít nhất 16 ống kiểm tra để tránh có sự hư hỏng. Nếu ít hơn số lượng đó, nên đặt
thêm các ống không chứa mẫu vào.


3.5. Bắt đầu chương trình
Sau khi thiết bị được kết nối với máy tính, trạng thái của thiết bị sẽ được hiển thị màu vàng
hoặc màu xanh
, bắt đầu chương trình bằng cách nhấn
.
Khi chạy chương trình, lựa chọn tên file và định dạng dữ liệu để lưu kết quả phép đo.
Chú ý! Nếu Start program được chọn trong khi thiết bị đang trong quá trình ổn định (chỉ thị màu vàng
trong dòng trạng thái
), trong cửa sổ Temperature Profile hiển thị lời nhắn nhấp nháy
xuất hiện.

Tin nhắn tương tự sẽ xuất hiện trên màn hình của thiết bị. Khi máy đã ổn định, thiết bị sẽ tự động
thực hiện chương trình.
Trong trường hợp cần thiết, thực hiện theo bước sau:
1. Trong cửa sổ Running:


2. Đóng cứa sổ chương trình bằng nhấn

ở góc trên bên phải.

Khi chương trình khuếch đại kết thúc, thiết bị sẽ bật sang chế độ nghỉ, đèn trên màn hình menu nhấp
nháy.

3.

3.6 Chạy chương trình khuếch đại
Chạy chương trình được điều khiển bằng phần mềm RealTime_PCR.
Nếu yêu cầu, bạn có thể:





 Ngưng chạy chương trình;
 Thêm bất kì số chu kì mong muốn. 
 Chỉnh sửa nhật kí đo đạc. 
 Khi chương trình khuếch đại chạy, có thể nhìn dữ liệu của phép đo qua cửa sổ Distribution of
optical measurements over theplate bằng

.

Cửa sổ Distribution of optical measurements over the plate
Nếu tùy chọn Turn off device after the run không được kích hoạt, khi chương trình khuếch đại
hoàn thành, sẽ nhìn thấy thông báo chuyển sang chế độ Holding
Trong trường hợp thông báo Holding… nhấp nháy và đánh dấu nhiệt độ lưu trữ sẽ xuất hiện trên
đồ thị thể hiện đường cong của ma trận nhiệt độ và thời gian thực hiện chương trình khuếch đại.


Thông báo hoàn tất quá trình khuếch đại.
Thông báo tương tự sẽ xuất hiện trên màn hình của thiết bị.
Khi nhiệt độ đạt tới giá trị gần của nhiệt độ giữ, cửa sổ xuất hiện trên màn hình thông báo rằng
quá trình đã hoàn thành và chuyển sang chế độ Holding.

Chế độ lưu trữ
Bằng cách nhấn ОК, bạn đã chuyển RealTime_PCR tới Archive viewer (bảng Data analysis).
Nếu tùy chọn Turn off device after the run không được kích hoạt, chương trình khuếch đại hoàn thành
sẽ chuyển đến chế độ nghỉ, đèn sẽ nhấp nháy trên menu hiển thị.
Để thoát chế độ này, chạy RealTime_PCR và kết nối thiết bị trong cửa sổ List of devices



HƯỚNG DẪN SỬ DỤNG

MÁY REALTIME PCR
Model: Dtprime 5M1

PHẦN II

1.

Giới thiệu

Phần mềm máy Realtime PCR được thiết kế để điều khiển phát hiện DTPrime máy luân nhiệt và DTLite.
Phần mềm máy Realtime PCR cho phép tạo chạy RUN và tổng hợp kết quả của đo đặc quang học.
Phần mềm máy Realtime PCR được thiết kế cho phòng thí nghiệm sử dụng trong thử nghiệm lâm sang, vì
vậy là lí do vì sao chức năng quản lý thiết bị và cài đặt kết quả phân tích được đơn giản hóa nhất có thể.
Cùng thời điểm, nếu ưu tiên, người dùng có thể đặt các thông số của hoạt động thiết bị và phân tích dữ liệu
với sự trợ giúp cài đặt thêm cảu Phần mềm máy Realtime PCR.

2.

Mục đích và điều kiện sử dụng

2.1

Mục đích Phần mềm máy Realtime PCR

Phần mềm này được thiết kế để điều khiển hoạt động phát hiện DTprime máy luân nhiệt và DTlite (dưới
đây là chuỗi thiết bị DT)
Hoạt động dưới đây được trình bày sử dụng Phần mềm máy Realtime PCR:
1.

Tạo công thức đĩa
2.
Kiểm tra tạo ra và chỉnh sửa;
3.
Tạo ra, giới thiệu và kiểm soát chương trình phóng đại;


4.
5.
6.
7.

Phân tích dữ liệu đo quang học;
Báo cáo dữ liệu phân tích;
Kiểm tra cấp số nhân và cài đặt quang học cho thiết bị;
Cài đặt và chuẩn đoán công cụ

2.2

Đặc điểm chính máy realtime PCR

1.
Phần mềm được thiết kế để điều khiền hoạt động của chuỗi công cụ DT. Phần mềm giao diện tự
động điều chỉnh công cụ được lựa chọn
2.
Có 2 loại phần mềm được thực hiện không phụ thuộc windows: Hoạt động thiết bị và tài liệu xem
cho phép hoạt động đồng thời với thiết bị (khởi động/bắt đầu/phân tích RUN chạy hiện tại) và phân tích kết
quả trước chạy.
3.
Khả năng làm việc với một vài thiết bị cùng một thời tiểm:phần mềm máy realtime PCR được khởi

động của sổ khác để điều khiển mỗi thiết bị bao gồm “mode nhiều cửa sổ”. Mode này cho phép kiểm soát
đồng thời hoạt động của một vài thiết bị.
4.
Trường hợp không thể bắt đồng mode nhiều của sổ windows , lựa chọn công việc ở “cửa sổ đơn”
là có thể. Đây là mode của phần mềm Realtime PCR, cho phép làm việc với nhiều thiết bị trong cùng 1 cửa
sổ. Nó có thể hữu ích trong các phòng thí nghiệm với nhiều thiết bị , cái mà không thể kết nối máy tích cùng
một lúc. Trong trường hợp, các thiết bị được bắt đầu qua phần mềm Realtime PCR, và sau đó không kết nối
với phần mềm và chạy độc lập.
5.
Khả khi giới thiệu độ giảm nhiệt độ đứng hoặc ngang qua hệ matrix cho thiết bị khuôn cứng.
6.
Khả khi cài đặt nhiệt độ không phụ thuộc nhiệt độ cho mỗ 6 phần cho thiết bị với 6 hệ matrix.
7.
Khả khi giới thiệu dôc đứng hoặc cài đặt không phụ thuộc nhietej độ mỗi 3 loại cho thiết bị với 3
matrix
8.
Hai phương pháp thay thế để phân tích đường cong tích lũy DNA trong PCR: Ngưỡng (Ct) và
Hình học (Cp), dựa trên các cách tiếp cận khác nhau để xác định chu trình chỉ thị khuếch đại. Theo mặc
định, khi phân tích phép đo quang học, RealTime_PCR sử dụng phương thức Hình học (Cp).

2.3 Yêu cầu về PC
Các yêu cầu của PC được mô tả trong phần 1.5 của Phần I hướng dẫn vận hành.

3 Chuẩn bị cho công việc
3.1 Cài đặt phần mềm RealTime_PCR.
Quy trình được mô tả trong Phần 3.3 của Phần I hướng dẫn vận hành.

3.2 Nâng cấp phần mềm.
3.3 Chuẩn bị thiết bị để vận hành.


Các nhà sản xuất bộ dụng cụ phải cung cấp các giá trị phơi sáng tối ưu.

Việc đo chiều cao ống phải được thực hiện trong trường hợp sử dụng các ống có độ cao khác nhau
trong phòng thí nghiệm.

Kiểm tra độ tinh sạch của các giếng đơn vị nhiệt phải được thực hiện định kỳ trong phòng thí
nghiệm để loại trừ khả năng thu được các kết quả không đáng tin cậy như là nguyên nhân của sự gia tăng
huỳnh quang nền.

3.4 Mô tả menu phần mềm RealTime_PCR


Hình 1. Cửa sổ RealTime_PCR trong chế độ vận hành Thiết bị
Mục lục chính của phần mềm RealTime_PCR (Hình 1) bao gồm bốn phần:

Chế độ

Kiểm tra (phần này dành cho hoạt động ở chế độ "Hoạt động thiết bị", trong chế độ "Trình xem kho
lưu trữ", phần này không có sẵn)

Tùy chọn

Trợ giúp
1.

Phần Chế độ được thiết kế để kiểm soát hoạt động của phần mềm và bao gồm các lệnh sau:








Chế độ hoạt động
Trình xem lưu trữ
Trình chỉnh sửa chương trình khuếch đại
Xem lưu trữ ảnh CCD
Thoát

2.
Phần kiểm tra được thiết kế để tạo và chỉnh sửa các kiểm tra và bao gồm các lệnh sau (phần này
dành cho công việc ở chế độ "Thao tác thiết bị", trong chế độ "Trình xem kho lưu trữ", phần này không có
sẵn):




Tạo / Chỉnh sửa kiểm tra
Sao chép nhóm kiểm tra


3.
Mục Tùy chọn được thiết kế để hiển thị và chỉnh sửa cài đặt công cụ. Chế độ "Hoạt động thiết bị"
bao gồm các lệnh sau:








Xem hình ảnh
Cài đặt tiếp xúc
Lần chạy cuối cùng trong thiết bị
Danh sách thiết bị
Chẩn đoán thiết bị

- Dòng lệnh
- Giám sát
- Đo chiều cao của ống
- Đọc thẻ SD

Xem lưu trữ ảnh CCD
- Kỹ sư dịch vụ

Tùy chọn

Phần khác.


×