TUYỂN CHỌN ĐỊNH HƯỚNG CÁC NHÓM VI SINH VẬT ĐẤT
CÓ KHẢ NĂNG CHỐNG CHỊU VỚI NỒNG ĐỘ MUỐI CAO
VÀ CHUYỂN PHÈN GÂY ĐỘC VỚI THỰC VẬT ĐỂ SỬ DỤNG
TRONG CÁC VÙNG ĐẤT CANH TÁC BỊ TÁC ĐỘNG
BỞI BIẾN ĐỔI KHÍ HẬU
Đoàn Kim Hạnh
1
, Nguyễn Viết Hiệp
1
,
Đặng Thương Thảo
1
.
Summary
Orient selection of soil microorganism groups that having ability to alleviate salt
stress (up to 6%) and convert sulfidic materials for use in agriculture production
areas which will be affected by climate changes
This study was carried out to deal with subjunctive effects of climate change on the Mekong River
Delta (MRD) and the Southeast of MRD in the future when almost agriculture production area will
be flooded with sea water and formed sulfidic materials. Base on soil microorganism population
adapting to unfavourable environment changes. From 2006 to 2007, 114 soil samples were
collected from 2 soil groups (saline soils and acid sulphate soils) of 6 provinces in the Mekong
River Delta (MRD) and the Southeast of MRD to isolate microorganism strains. 28 AMF strains, 36
bacteria strains, 11 actinomyces strains, 8 yeast strairs, 11 mold strains that having ability to
alleviate salt stress (up to 6%) and convert sulfidic materials (>35%) were selected. The sulfidic
materials converting and salt - alleviating property of these isolates can be applied for dealing with
effects of climate change
Keywords: Acid sulphate soils, climate change, microorganisms, saline soils, sea level rise,
sulfidic materials.
I. ĐẶT VẤN ĐỀ
Hội nghị thượng đỉnh toàn cầu về phát
triển bền vững tại Johannesburg (Cộng hòa
Nam Phi) năm 2002 đã nhận định rằng những
hậu quả của biến đổi khí hậu toàn cầu trực
tiếp tác động đến sự sinh tồn của loài người,
cụ thể đến tài nguyên nước, năng lượng, sức
khỏe con người, nông nghiệp và an ninh
lương thực và đa dạng sinh học.
Đứng thứ 5 về khả năng dễ tổn thương
do tác động của biến đổi khí hậu, Việt Nam
đã được Liên hiệp quốc chọn là quốc gia để
tiến hành nghiên cứu điển hình về biến đổi
khí hậu và phát triển con người. Theo đó,
sinh kế của người Việt đang bị đe dọa
nghiêm trọng bởi những thay đổi khí hậu
toàn cầu. Quá trình xâm nhập mặn và thay
đổi lưu lượng chảy của hệ thống sông Cửu
Long sẽ làm thay đổi thành phần cơ giới, độ
phì của đất, tăng diện tích đất bị nhiễm
phèn, ảnh hưởng trực tiếp đến năng suất và
sản lượng cây trồng.
Trước khi con người kịp đưa ra các
biện pháp ứng phó với biến đổi khí hậu, đã
và đang có một quá trình tiến hóa mới của
sinh vật nhằm tự thích nghi và điều chỉnh
với quá trình này. Sự tiến hóa, thích nghi
này mở màn cho những thay đổi có tính
chất quyết định đến khả năng sinh tồn của
mọi sinh vật về sau.
1
Viện Thổ nhưỡng Nông hóa.
Một số loài vi sinh vật đất sống trong
vùng rễ thực vật ở các khu vực đất mặn
thông qua quá trình tự biến đổi gen đã nâng
cao tính chống chịu mặn của mình, tự làm
cho chúng tồn tại, sinh trưởng và phát triển
được trong điều kiện môi trường sống có
những thay đổi bất lợi (như gia tăng nồng
độ muối trong đất, ).
Fe
2+
có trong đất phèn hoạt động đã
được chứng minh là có tính gây độc với
thực vật. Cây trồng muốn tồn tại trong đất
phèn hoạt động thì hoặc là hệ rễ phải tiết ra
các phức chất hoặc quần thể vi sinh vật hội
sinh trong vùng rễ phải hoạt động đủ mạnh
để chuyển F
2+
thành dạng Fe
3+
không độc
với cây. Khi quần thể vi sinh vật trong đất
có khả năng chuyển hóa F
2+
thành Fe
3+
hoạt
động mạnh sẽ làm tăng mức độ sống sót
của thực vật sống trên đất phèn hoạt động.
Tận dụng tính chất “đi trước” thích nghi
của thế giới sống (đặc biệt là vi sinh vật đất)
để xây dựng các biện pháp khác nhau để đối
phó và thích ứng với hệ quả của biến đổi khí
hậu là điều tất yếu hiện nay.
II. VẬT LIỆU VÀ PHƯƠNG PHÁP
NGHIÊN CỨU
1. Vật liệu
Các mẫu đất thuộc nhóm đất mặn và
đất phèn khu vực Đông Nam bộ cũng như
đồng bằng sông Cửu Long.
2. Phương pháp
Lấy mẫu đất:
Mẫu đất được lấy theo chỉ dẫn của
FAO (1967) và Richard Bardgett, Michael
Usher, David Hopkins (2005).
Phân lập chủng
Bằng phương pháp Koch trên đĩa Petri
có chứa môi trường tương ứng. Phân lập vi
khuNn s dng 2 môi trưng: Thch dinh
dưng và Molongoski - Klug. Phân lp x
khuNn s dng môi trưng Kuster - William.
Phân lp nm men s dng môi trưng
Czapek - Dox - propionat. Phân lp nm
mc s dng môi trưng Czapek - Dox
(Atlas M. Ronald, 2005). Riêng phân lp bào
t nm r cng sinh: K thut sàng ưt và ly
tâm trong thang nng Sucarose 50%
(Brundrett Mark và cng s, 1996).
Kỹ thuật tuyển chọn:
ánh giá mc chng chu nng
mui bng k thut th nghim nng liên
tip ca Pepper I. L. và Gerba C. P. (2005).
Xác nh kh năng chuyn nguyên liu
sinh phèn gây c theo hưng dn ca
Donahue L. R., Miller W. R. và Shickluna
C. J. (1998); King M. G. và Garey A. M.
(1999); Wang T và Peverly H. J. (1999).
III. KT QU VÀ THO LUN
1. Lấy mẫu
T năm 2006, nhóm tài ã tin hành
ly tng cng 114 mu t thuc 2 nhóm
t là nhóm t mn và nhóm t phèn trên
a bàn 6 tnh khu vc ông N am b cùng
vi ng bng sông Cu Long là: Thành
ph H Chí Minh, Bà Ra - Vũng Tu, Trà
Vinh, Bc Liêu, Sóc Trăng và Long An.
Các v trí ly mu là nhng v trí ang
tin hành canh tác nông nghip, không nm
trong din quy hoch phát trin công nghip
- dch v - du lch, ưc xác nh s b nh
hưng khi nưc bin dâng trong thi gian
ti (hoc là b nhim mn thêm hoc là
chuyn sang trng thái phèn hot ng).
Các mu t sau khi ly ưc bo qun
4 - 5
0
C và vn chuyn ngay v phòng thí
nghim B môn Vi sinh vt, Vin Th
nhưng N ông hóa tin hành phân tích.
2. Phân lập
Trên môi trưng thch dinh dưng và
Molongoski - Klug ã phân lp ưc tng
s 377 chng vi khuNn trong ó có 256
chng vi khuNn phân lp t t mn, 121
chng phân lp ưc t t phèn.
Có 144 chng x khuNn phân lp ưc
trên môi trưng Kuster - William. Trong s
này 95 chng phân lp t t mn và 49
chng phân lp t t phèn.
S dng môi trưng Czapek - Dox -
propionat ã phân lp ưc 202 chng nm
men (151 chng t t mn và 51 chng t
t phèn). 243 chng nm mc (203 chng
t t mn và 40 chng t t phèn) phân
lp ưc trên môi trưng Czapek - Dox.
Bng k thut sàng ưt và ly tâm trong
thang nng Sucarose 50% ã tách ưc
127 chng nm r ni cng sinh (AMF)
trong s ó 85 chng là t mu t mn và
42 chng là t mu t phèn.
Các chng sau khi phân lp ưc làm
sch và to dòng thun (vi vi khuNn, x
khuNn, nm men, nm mc bng cách pha
loãng và cy gt liên tip trên ĩa petri có
cha môi trưng tương ng vi khi phân lp,
riêng nm r ni sinh bng cách cho ny mm
bng k thut màng kép sau ó lây nhim ch
ng vào r cây ký ch tương ng).
N hng chng này ưc s dng như là
ngun vt liu cho công tác tuyn chn
nh hưng v sau.
Bảng 1. Số chủng vi sinh vật phân lập được ban đầu trên các nguồn mẫu đất khác nhau
Stt Nhóm vi sinh vật
Nguồn mẫu đất
Tổng số
Đất mặn Đất phèn
1 Vi khuẩn (chủng) 256 121 377
2 Xạ khuẩn (chủng) 95 49 144
3 Nấm men (chủng) 151 51 202
4 Nấm mốc (chủng) 203 40 243
5 Nấm rễ (chủng) 85 42 127
Tổng số (chủng) 790 303 1093
Ảnh 1. Khun lạc vi khun (ảnh trái) và nấm men (ảnh phải) phân lập từ đất mặn
Ảnh 2. Bào tử nấm rễ nội cộng sinh (AMF) phân lập từ đất mặn (ảnh trái)
và đất phèn (ảnh phải)
3. Tuyển chọn
Theo kịch bản biến đổi khí hậu, các khu
vực đất mặn ở Đông Nam bộ sẽ có nguy cơ bị
mặn hóa cao hơn so với hiện nay, khu vực đất
phèn tiềm tàng ở đồng bằng sông Cửu Long
sẽ chuyển thành phèn hoạt động vì vậy hướng
chọn lọc ở đây là chọn lọc theo định hướng.
Các chủng phân lập từ đất mặn sẽ chọn lọc
theo hướng chịu mặn cao, các chủng phân lập
từ đất phèn chọn lọc theo hướng chuyển phèn
gây độc (từ Fe
2+
thành Fe
3+
).
Tuyển chọn theo hướng chịu mặn:
Kết quả tuyển chọn theo hướng chống
chịu mặn (bảng 02) cho thấy:
Mức chống chịu của vi sinh vật tỷ lệ
nghịch với nồng độ muối tan có trong đất.
Điều này là hoàn toàn hợp lý vì ở một mức
nồng độ nào đấy trong môi trường sống các
cation (như Na
+
) và anion (Cl
-
) đóng vai trò
như nhân tố kìm hãm sự phát triển của vi sinh
vật (Tortora J. Gerard và cộng sự, 2002).
Ở nồng độ muối cao, đa số các chủng vi
sinh vật thử nghiệm đều không biểu hiện
khả năng chống chịu tuy nhiên một số
chủng vẫn tồn tại và phát triển được. Khả
năng tồn tại ở nồng độ muối cao của các
chủng này được quyết định nhờ sự phát
triển mạnh mẽ các “bơm” proton chủ động
phân bố dày đặc trên bề mặt màng sinh chất
của chính tế bào đó hoặc khả năng sinh và
tiết các chất trao đổi bậc 1, bậc 2 vào môi
trường sống (Bruce Alberts, 2004).
Với nồng độ muối tan trong đất cao
nhất ở dãy thử nghiệm là 6,4%, có 15 chủng
vi khuNn, 9 chng x khuNn, 6 chng nm
men, 7 chng nm r có kh năng chng
chu ưc.
mc nng mui tan trong t là
3,2% (nng mà theo d oán ca
Bernard P. K. Yerima và E. Van Ranst năm
2005 có khong 30% din tích t các nưc
khu vc ven bin b xâm mn n ngưng
như vy) có 17 chng vi khuNn, 13 chng
x khuNn, 13 chng nm men, 18 chng
nm mc và 24 chng nm r có biu hin
kh năng chng chu tt.
N u tính v t l % các chng vi sinh
vt tham gia tuyn chn v tính chng chu
nng mui d dàng nhn thy kh năng
chng chi ca các chng nm r và x
khuNn là tương i tt. Chính bn cht mi
quan h cng sinh c bit gia nm r và
thc vt quyt nh tính cht chng chu
cao ca chúng trong các iu kin môi
trưng bt li (Brundrett Mark và cng s,
1996). Mc tn thương t bào ca nm
men và vi khuNn cao hơn rt nhiu.
Bảng 2. Khả năng chống chịu nồng độ muối trong đất của các chủng vi sinh vật phân lập
trên nhóm đất mặn
STT
Nhóm vi sinh vật
Nồng độ NaCl trong đất (%)
0,05 0,1 0,2 0,4 0,8 1,6 3,2 6,4
1 Vi khuẩn (chủng) 212 134 81 77 43 26 17 15
2 Xạ khuẩn (chủng) 75 44 36 29 22 17 13 9
3 Nấm men (chủng) 127 92 76 49 34 22 13 6
4 Nấm mốc (chủng) 177 95 86 49 37 26 18 7
5 Nấm rễ (chủng) 77 68 59 49 38 30 24 20
Tuyển chọn theo hướng chuyển đổi
nguyên liệu sinh phèn gây độc cho thực vật:
Nghiên cứu về điều kiện hình thành
phèn người ta nhận thấy trong phạm vi
10.000 năm trở lại đây, sau sự kiện dâng
lên của nước biển (biển tiến) lớn nhất gần
đây. Khi mực nước biển dâng lên và làm
ngập đất, sulfat trong nước biển trộn lẫn
với các trầm tích đất chứa các ô-xít sắt và
các chất hữu cơ. Trong các điều kiện hiếm
khí này, các vi khuNn ưa phân hy các cht
vô cơ như Thiobacillus ferrooxidans to ra
các sulfua st (ch yu là dng pyrit). Ti
mt thi im nht nh, nhit m hơn
là iu kin thích hp hơn cho các vi
khuNn này, to ra mt tim năng ln hơn
cho s hình thành ca các sulfua st
(Brock D. T. và cng s, 1984). Các môi
trưng ngp nưc vùng nhit i, chng
hn các khu rng ưc hay các khu vc
ca sông, có th cha hàm lưng pyrit cao
hơn so vi các môi trưng tương t nhưng
vùng ôn i. Pyrit là n nh cho ti khi
nó b l ra ngoài không khí, t thi im
này thì pyrit b ôxi hóa và sinh ra axít
sulfuric. N hư vy phèn tim tàng chuyn
thành phèn hot ng.
chuyn i nguyên liu sinh phèn
gây c cho thc vt có nhiu cách khác
nhau, mt trong s ó là s dng iu kin
ôxi hóa kh chuyn Fe
2+
thành Fe
3+
không c vi sinh vt, c bit là thc vt.
ánh giá hiu qu chuyn i Fe
2+
thành
Fe
3+
là hưng chn lc th 2 ca tài.
Kt qu chn lc theo hưng này (bng 3)
cho thy:
Trong tng s 303 chng vi sinh vt (vi
khuNn, x khuNn, nm men, nm mc, nm
r) kim tra ch có 21 chng vi khuNn, 2
chng x khuNn, 2 chng nm men, 4 chng
nm mc và 8 chng nm r biu hiu kh
năng chuyn nguyên liu sinh phèn gây c
cho thc vt >35% (lưng Fe
2+
b chuyn
thành Fe
3+
>35% sau 9 ngày mu).
N hóm vi khuNn là nhóm chim ưu th
cao trong s các chng kim tra có kh
năng chuyn c tính nguyên liu sinh phèn
cao (>35%). iu này nói lên tính thích ng
cao ca chúng trong hot ng sinh phèn
cũng như c ch hình thành nguyên liu
phèn gây c (Bernard P. K. Yerima, E.
Van Ranst, 2005).
Tortora J. Gerard và cng s (2002) thì
cho rng 90% các hot ng liên quan n
quá trình sinh phèn và chuyn nguyên liu
sinh phèn gây c là do vi khuNn và x
khuNn quyt nh. N hóm sinh vt nhân tht
như nm mc, nm men và nm r ít có vai
trò quyt nh mà ch óng nhân t ph tr
thúc Ny quá trình sinh hoc kìm hãm phèn
xy ra.
N gưi ta bit rt rõ rng nhóm vi
khuNn kh Fe
3+
thành Fe
2+
hot ng mnh
trong iu kin vi hiu khí n ym khí,
nhit cao, t b ngp nưc (Begg C và
cng s, 1994; Bernard P. K. Yerima, E.
Van Ranst, 2005). X khuNn, nm mc,
nm men và nm r thưng hot ng
mnh trong iu kin t vi hiu khí n
hiu khí (Paul Alvin Elldor và cng s),
chính vì vy s lưng chng biu hin hot
tính chuyn nguyên liu phèn cao các
nhóm này là ít.
Mc dù là nhóm yêu cu ôxy trong iu
kin sinh trưng và phát trin nhưng các
chng nm r vn biu hin kh năng
chuyn nguyên liu sinh phèn cao (nm r
có 8 chng trong khi ó x khuNn, nm men
ch có 2 chng, nm mc ch có 4 chng)
iu này có th là do h qu mi quan h
cng sinh gia nm r và thc vt ch
(Donahue L. R., Miller W. R. và Shickluna
C. J., 1983).
Mt s chng vi sinh vt kim tra
không biu hin kh năng chuyn nguyên
liu phèn (không biu hin hot tính) ví
d như vi khuNn có ti 77/121 chng
kim tra không có hot tính. iu này liên
quan n hot ng trao i cht ca
chúng vi các chu trình lưu huỳnh cũng
như st trong t nhiên (Richard Bardgett,
Michael Usher, David Hopkins, 2005).
Hay nói cách khác vi sinh vt có kh
năng kh Fe
+3
rt a dng, nhưng ch
yu vn thuc v h Geobacteraceae (ví
d in hình là Geobacter metallireducen,
G. sulfurreducens) ngoài ra mt s loài
thuc Shewanella, Ferrimonas, Aeromonas,
Proteobacteria, Geothrix, Geovibrio và
Ferribacter cũng có kh năng này. Bên
cnh kh năng kh Fe
3+
, mt s trong s
loài thuc nhóm này còn có kh năng kh
Mn
2+
(Lovley, 2006).
N ghiên cu ca Gareth M. Evans và
Judith C. Furlong (2003) cho thy, thông
thưng mc chuyn nguyên liu phèn
trong t khu vc nhit i dao ng
trong khong 5 - 20% sau t 5 - 10 ngày
. Mun ng dng nhng chng vi sinh
vt có hot tính kiu tương ương như th
này trong công ngh sinh hc áp dng
ci to t òi hi hot lc ca chúng phi
>35%. N hng sinh vt chuyn gen phi
t ưc mc ý nghĩa >45%. N hư vy nu
căn c theo nhng nh hưng tiêu chuNn
ca Gareth M. Evans và Judith C. Furlong
(2003) chúng ta có th có 37 chng vi
sinh vt ng dng trong ci to t phèn.
Bảng 3. Mức độ chuyển nguyên liệu sinh phèn (FeS
2
) của các chủng tuyển chọn
sau 9 ngày ủ mẫu
STT
Nhóm vi sinh vật
Khả năng chuyển nguyên liệu sinh phèn
Không có hoạt tính Hoạt tính < 35% > 35%
1 Vi khuẩn (chủng) 77 23 21
2 Xạ khuẩn (chủng) 40 7 2
3 Nấm men (chủng) 35 14 2
4 Nấm mốc (chủng) 26 10 4
5 Nấm rễ (chủng) 34 0 8
T¹p chÝ khoa häc vµ c«ng nghÖ n«ng nghiÖp ViÖt Nam
7
IV. KẾT LUẬN VÀ Đ N GHN
1. Kết luận
1 T 114 mu t thuc 2 nhóm t là nhóm t mn và nhóm t phèn trên a
bàn 6 tnh khu vc ông N am b cùng vi ng bng sông Cu Long ã phân lp
ưc 377 chng vi khuNn, 144 chng x khuNn, 202 chng nm men, 243 chng nm
mc và 127 chng nm r làm ngun nguyên liu cho quá trình chn lc chng.
2. Trên cơ s các chng phân lp ưc, chn lc theo hưng chu mn ã xác nh
ưc 15 chng vi khuNn, 9 chng x khuNn, 6 chng nm men, 7 chng nm mc, 20
chng nm r có kh năng chng chu ưc nng mui tan trong t là 6,4%. Tuyn
chn theo hưng chuyn nguyên liu sinh phèn gây c vi thc vt ã tìm ưc 21
chng vi khuNn, 2 chng x khuNn, 2 chng nm men, 4 chng nm mc và 8 chng
nm r có kh năng chuyn i nguyên liu sinh phèn gây c cho thc vt > 35%.
2. Đề nghị
- Xác nh mc an toàn sinh hc ca các chng tuyn chn ưc (an toàn cho
ngưi, ng vt và thc vt) theo quy nh ca FAO và WHO.
- Th nghim ng rung ánh giá úng hiu qu chn lc và xác nh các gii
pháp nhm nâng cao kh năng hot ng ca các nhóm vi sinh vt này trong iu kin
ng rung (iu kin môi trưng ngoài phòng thí nghim).
TÀI LIU THAM KHO
1 Atlas M. Ronald, 2005. Handbook of Media for Environmental Microbiology. CRC
Press. Taylor & Francis Group.
2 Begg C et al., 1994. Root - Induced Iron Oxidation and pH Changes in the Lowland
Rice Rhizosphere. New Phytologist, Vol. 128, No. 3, pp. 469 - 477.
3 Bernard P. K. Yerima, E. Van Ranst, 2005. Introduction to Soil Science: Soils of the
Tropics. Trafford Publishing.
4 Brock D. T., et al, 1984. Biology of microorganisms. PHI.
5 Bruce Alberts, 2004. Mulecular Biology of the Cells. Taylor & Francis Group
6 Brundrett Mark et al, 1996. Working with Mycorrhiza in Forestry and Agriculture.
Canberra, Australia, pp 141 - 252.
7 Donahue L. R., Miller W. R., and Shickluna C. J., 1983. Soil: An introduction to
soils and plant growth. PHI.
8 FAO, 1967. A practical manual of siol microbiology laboratory methods. Rome.
9 Gareth M. Evans, Judith C. Furlong, 2003. Environmental Biotechnology: Theory
and Application. John Wiley & Sons Ltd, West Sussex, England.
T¹p chÝ khoa häc vµ c«ng nghÖ n«ng nghiÖp ViÖt Nam
8
10 King M. G., and Garey A. M., 1999. Ferric iron reduction by bacteria associated with
the roots of freshwater and marine macrophytes. Applied and Enviroment
Microbiology. Vol. 65, No. 10, Oct. 1999, pp. 4393 - 4398.
11 Lovley R. Derek, 2006. Environmental Microbe - Metal Interactions. ASM Press,
Washington, D.C. 2000. Lu Yahai et al - Structure and activity of bacterial
community inhabiting rice roots and the rhizosphere. Environmental Microbiology,
Volume 8, Issue 8/2006, pp. 1351.
12 Okalebo R. J., et al., 1993. Laboratory methods of soil and plant analysis: A working
manual. TSBF Program. Kenya 1993.
gười phản biện: Hồ Quang Đức