khảo sát vi khuẩn gram âm đường ruột kháng kháng sinh

B GIÁO DC VÀ ÀO TO
TRNG I HC S PHM TP. H CHÍ MINH



Nguyn Th Yn Chi




KHO SÁT
S KHÁNG KHÁNG SINH
CA CÁC VI KHUN GRAM ÂM NG
RUT THNG GP TRONG BNH VIN
SINH ESBL

Chuyên ngành: Vi Sinh hc
Mã s: 60 42 40


LUN VN THC S SINH HC


NGI HNG DN KHOA HC
PGS – TS CAO MINH NGA
`
Thành ph H Chí Minh – nm 2011

LI CAM OAN

Tôi xin cam đoan đây là công trình nghiên cu ca riêng tôi.
Các s liu và kt qu nghiên cu trong lun vn là trung thc và cha tng đc ai
công b trong bt kì công trình nào khác



Tác gi

LI CM N


Tôi xin chân thành cám n s hng dn tn tình ca cô PGS - TS Cao
Minh Nga trong sut quá trình làm lun vn này.
ng thi, tôi cng xin chân thành cám n Ban ch nhim B môn, các cán
b phòng thí nghim b môn Vi sinh trng i hc Y Dc Thành ph H Chí
Minh đã h tr tích cc cho tôi trong vic thc nghim đ tài.
MC LC

Chú thích các ch vit tt
Danh mc các bng
Danh mc các hình, biu đ
3TM U3T 1
3TChng 1. TNG QUAN TÀI LIU3T 4
3T1.1. Tng quan v vi khun3T 4
3T1.1.1. Vi khun3T 4
3T1.1.2. Trc khun Gram âm3T 4
3T1.2. Các kháng sinh thuc nhóm -lactam3T 9
3T1.2.1. Phân loi các kháng sinh thuc nhóm -lactam3T 10
3T1.2.2. C ch tác dng3T 12
3T1.3. Hin tng kháng kháng sinh3T 13

3T1.3.1. Tng quan3T 13
3T1.3.2. Bn Cht di truyn và phng thc truyn ti gen3T 14
3T1.3.3. C ch kháng kháng sinh ca vi khun3T 15
3T1. 4. Tng quan v ESBL3T 17
3T1.4.1. S lc v -lactamase3T 17
3T1.4.2. ESBL3T 20
3TChng 2. I TNG VÀ PHNG PHÁP NGHIÊN CU3T 33
3T2.1. i tng nghiên cu3T 33
3T2.2. Phng pháp chn mu3T 33
3T2.3. Phng pháp tin hành3T 33
3T2.3.1. Vt liu3T 33
3T2.3.2. Thit b và dng c3T 34
3T2.3.3. Quy trình thc hin3T 34
3T2.4. X lý s liu3T 37
3TChng 3. KT QU NGHIÊN CU VÀ THO LUN3T 38
3T3.1. T l vi khun đng rut sinh ESBL3T 38
3T3.2. T l các chng vi khun Gram âm đng rut thng gp sinh ESBL3T 39
3T3.3. T l kháng kháng sinh ca vi khun Gram âm đng rut thng gp
sinh ESBL
3T 42
3T3.4. T l kháng kháng sinh ca vi khun Gram âm đng rut không sinh
ESBL
3T 54
3TChng 4. KT LUN VÀ KIN NGH3T 72
3TTÀI LIU THAM KHO3T 75
3TPH LC3T

DANH MC CÁC CH VIT TT


AN
Amikacin
AMC
Amox - acid clavulanic
AM
Ampicillin
ASTS
Antibiotic Susceptibility Test Surveillance (Chng trình theo dõi s
nhy cm kháng sinh)
ATM
Aztreonam
BHI
Brain - Heart Infusion Agar (Thch tim - óc hm)
CZ
Cefazolin

FEP
Cefepime
CFP
Cefoperazone
CCTX
Cefotaxime-acid clavulanic
FOX
Cefoxitin
CAZ
Ceftazidime
CCAZ
Ceftazidime – acid clavulanic
CTX
Ceftotaxime
CRO
Ceftriaxone
CXM
Cefuroxime
CIP
Ciprofloxacin
CTI
Citrate
CLSI
Clinical and Laboratory Standards Institute (Vin các chun mc lâm
sàng và xét nghim)
C
Cloramphenicol
EMB
Eosin Methylene Blue Agar
ESBL

Extended – Spectrum Beta Lactamase
GM
Getamicin
G
Glucose

IPM
Imipenem
IND
Indol
LVX
Levofloxacin
LYS
Lysine
MC
Mac Conkey Agar (Thch Mac Conkey)
MEM
Meropenem
MR
Methyl Red
MIC
Minimum Inhibitory Concentration (Nng đ c ch ti thiu)
MOT
Motility (Di đng)
MHA
Mueller Hinton Agar (Thch Mueller Hinton)
NCCLS
National Committee for Clinical Laboratory Standards
NET
Neltimicin

FT
Nitrofurantoin
NOR
Norffloxacin
NA
Nutrien Agar (Môi trng dinh dng)
PAD
Phenylalanine Deaminase
TZP
Piperacillin-tazobactam
Tg
Tác gi
TE
Tetracyline
Tp.
Thành ph
TCC
Ticarcilin acid clavuanic
TM
Tobramycin
SXT
Trimethoprim –sulfamethoxazole
TSI
Triple Suger Iron
VKDR
Vi khun đng rut
VP
Voges Proskauer

DANH MC CÁC BNG

3TUBng 1.1. Tính cht sinh hóa ca mt s loi vi khun đng rut thng gpU3T 5
3TUBng 1.2. Các nhân c bn ca kháng sinh thuc nhóm -lactamU3T 10
3TUBng 1.3. C ch kháng thuc ca vi khunU3T 17
3TUBng 1.4. Xp loi -lactamase theo chc nngU3T 18
3TUBng 1.5. Các lp ESBL chínhU3T 22
3TUBng 1.6. Các type ESBLs CTX-MU3T 24
3TUBng 1.7. Các type ESBL- OXAU3T 25
3TUBng 1.8. Các loi ESBL khácU3T 25
3TUBng 1.9. Mt s phng pháp phân t xác đnh ESBLU3T 29
3TUBng 3.1. T l các loi vi khun đng rut phân lp đc U3T 38
3TUBng 3.2. T l các vi khun Gram âm đng rut thng gp sinh ESBLU3T 39
3TUBng 3.3. T l kháng kháng sinh ca các vi khun Gram âm đng rut thng gpU3T
42
3TUBng 3.4. T l kháng kháng sinh ca tng loài vi khun đng rut thng gp
sinh ESBL
U3T 46
3TUBng 3. 5. So sánh t l kháng kháng sinh ca E. coli sinh ESBL vi mt s tác gi
nghiên cu trc đây
U3T 48
3TUBng 3. 6. So sánh t l kháng kháng sinh ca Klebsiella spp. sinh ESBL vi mt s
tác gi nghiên cu trc đây
U3T 53
3TUBng 3.7. So sánh t l kháng kháng sinh ca vi khun Gram âm đng rut thng
gp không sinh ESBL vi các tác gi nghiên cu trc đây

U3T 55
3TUBng 3. 8. T l kháng kháng sinh ca tng loài vi khun Gram âm đng rut
thng gp không sinh ESBL
U3T 59
3TUBng 3.9. So sánh t l kháng kháng sinh ca E. coli không sinh ESBL vi các tác
gi nghiên cu trc đây
U3T 62
3TUBng 3.10. T l kháng kháng sinh ca vi khun E. coli sinh ESBL và không sinh
ESBL
U3T 63

3TUBng 3. 11. So sánh t l kháng kháng sinh ca vi khun Klebsiella spp. vi các tác
gi nghiên cu trc đó
U3T 68
3TUBng 3.12. So sánh t l kháng kháng sinh ca vi khun Klebsiella spp. sinh ESBL
và không sinh ESBL
U3T 69