nhóm 10 báo cáo sáng24 10 ppt

<span class="text_page_counter">Trang 1</span><div class="page_container" data-page="1">

<b>BÁO CÁO TIỂU LUẬN MÔN HỌC</b>

<i><b>Đề tài: PHÁT HIỆN Salmonella spp. TRONG THỊT GÀ</b></i>

<b>BẰNG PHƯƠNG PHÁP IC-LAMP </b>

(MAGNETIC IMMUNOCAPTURED LOOP MEDIATED ISOTHERMAL AMPLIFICATION)

TRƯỜNG ĐẠI HỌC NƠNG LÂM THÀNH PHỐ HỒ CHÍ MINH

<b>KHOA KHOA HỌC SINH HỌC</b>

Sinh viên thực hiện

Võ Thị Bích Đào - 21126298

Nguyễn Thị Hồng Hạnh - 21126330 Nguyễn Thị Minh Hạnh - 21126331

Giảng viên: TS. Huỳnh Văn Biết Trương Quang Toản

Thủ Đức, ngày 24 tháng 10 năm 2023

<b>Môn thiết bị và kỹ thuật Công nghệ sinh học</b>

</div><span class="text_page_counter">Trang 2</span><div class="page_container" data-page="2">

<b>Nội dung </b>

<b>1. Đặt vấn đề</b>

<b>2. Nội dung nghiên cứu</b>

<b>3. Vật liệu và phương pháp nghiên cứu4. Kết quả dự kiến</b>

2

</div><span class="text_page_counter">Trang 3</span><div class="page_container" data-page="3">

<b>1. Đặt vấn đề</b>

<i>• Là nguồn lây truyền Salmonella spp.</i>

→ gây viêm dạy dày-ruột, nhiễm trùng huyết, sốt thương hàn,…

• Thịt gà có giá trị dinh dưỡng đối với sức khỏe con người, đồng thời mang lại nguồn thu nhập đáng kể cho người nơng dân

Chẩn đoán nhanh, đáng tin cậy, ít tốn kém

</div><span class="text_page_counter">Trang 4</span><div class="page_container" data-page="4">

<b>2. Nội dung nghiên cứu</b>

➢<b>Thiết kế hạt từ tính</b>

</div><span class="text_page_counter">Trang 5</span><div class="page_container" data-page="5">

<b>3. Vật liệu và phương pháp</b>

<b>Thu mẫu</b>

▪Mẫu thịt gà tươi được lấy ở chợ đầu mối và các địa điểm giết mổ trong chợ Thủ Đức trong điều kiện vô trùng.

▪Bảo quản mẫu ở nhiệt độ 1ºC đến 5ºC.

<b>Hình 1. Mẫu thịt gà thu ở chợ.</b>

5

</div><span class="text_page_counter">Trang 6</span><div class="page_container" data-page="6">

<b>Chuẩn bị magnetic IC</b>

Hạt từ tính + protein A/G + dung dịch

<b>Sự tương tác giữa hạttừ tính và mẫu thịt gà</b>

<i><b>Hình 3. Mẫu xuất hiện Salmonella spp.</b></i>

<b>3. Vật liệu và phương pháp</b>

</div><span class="text_page_counter">Trang 7</span><div class="page_container" data-page="7">

10 𝜇𝑙 dung dịch A (125 mM NaOH,

1 mM EDTA 0,1% Tween 20) ủ ở 65°C trong 10 phút ly giải tế bào vi khuẩn.

</div><span class="text_page_counter">Trang 8</span><div class="page_container" data-page="8">

<b>PrimerTrình tự</b>

FIP_{GCGCGGCATCCGCATCAATA-TGCCCGGTAAACAGATGAGT} BIP_{GCGAACGGCGAAGCGTACTG-TCGCACCGTCAAAGGAAC}

<b>Bảng 1. Trình tự đoạn primer của LAMP</b>(Nguyen Pham Truc Phuongvà ctv, 2022).

<b>3. Vật liệu và phương phápPhản ứng LAMP</b>

</div><span class="text_page_counter">Trang 9</span><div class="page_container" data-page="9">

<b>Bảng 2. Thành phần của phản ứng LAMP </b>(

Nguyen Pham Truc Phuong và ctv, 2022

).

<b>3. Vật liệu và phương pháp</b>

<b>TênNơi sản xuấtNồng độ ban đầuNồng độ cuối cùng</b>

Primer FIP BIPIDT, Mỹ₄₀μM1,6 μM Primer F3 B3IDT, Mỹ5 μM0,2 μM

H

₂

O

</div><span class="text_page_counter">Trang 10</span><div class="page_container" data-page="10">

•Cho cácchất vào ủ ở 65°C trong 60 phút →Tăng nhiệt độ lên 80°C trong 10 phút để kết thúc phản ứng LAMP.

<b>3. Vật liệu và phương pháp</b>

<b>Phản ứng LAMP</b>

</div><span class="text_page_counter">Trang 11</span><div class="page_container" data-page="11">

<b>4. Kết quả dự kiến</b>

<b>Hình 4. Kết quả của mẫu sau khi quan sát dưới tia UV </b>(Zhang, L. và cộng sự, 2020)<i>. (1),(2) Dương tính; (3),(4),(5),(6),(7),(8) Âm tính.</i>

11

</div><span class="text_page_counter">Trang 12</span><div class="page_container" data-page="12">

<b>TÀI LIỆU THAM KHẢO</b>

1. Nguyen Pham Truc Phuong, Doan Thi Quynh Huong, Nguyen Van Luong. (2022). DETECTION OF Salmonella spp. IN FOOD BY LAMP (LOOP-MEDIATED ISOTHERMAL AMPLIFICATION) METHOD. TNU Journal of Science and Technology 227(01), 92-101.

<i>2. Abd El-Aziz NK, Tartor YH, Gharieb RMA, et al. (2021). Extensive Drug-Resistant Salmonella enterica Isolated From Poultry and Humans: Prevalence and Molecular Determinants Behind the Co-resistance to Ciprofloxacin and Tigecycline. Front </i>

<i>Microbiol 12: 738784.</i>

3. Andreoletti O, Budka H, Buncic S, et al. (2008). Microbiological risk assessment in feeding stuffs for food-producing animals

<i>Scientific Opinion of the Panel on Biological Hazards. European Food Safety Authority 720, 1-84.</i>

4. Hara-Kudo, Y., Yoshino, M., Kojima, T., Ikedo, M. (2005). Loop-mediated isothermal amplification for the rapid detection of

<i>Salmonella. FEMS Microbiol Lett 253(1), 155-161.</i>

5. Jiang, K., Lv, Q., Zhang, D., et al. (2012). A novel, sensitive, accurate multiplex loop-mediated isothermal amplification

<i>method for detection of Salmonella spp., Shigella spp. and Staphylococcus aureus in food. J Food Agric Environ </i>

6. Kirk MD, Pires SM, Black RE, et al. (2015). World Health Organization estimates of the global and regional disease burden of 22

<i>foodborne bacterial, protozoal, and viral diseases, 2010: a data synthesis. PLoS Med</i> 12(12): e1001921.

12

</div><span class="text_page_counter">Trang 13</span><div class="page_container" data-page="13">

<b>TÀI LIỆU THAM KHẢO</b>

7. Notomi, T., Okayama, H., Masubuchi, H., Yonekawa, T., Watanabe, K., Amino, N., et al. (2000). Loop-mediated isothermal

<i>amplification of DNA. Nucleic Acids Reseach vol 28 (12): 63. doi: 10.1093/nar/28.12.e63.</i>

8. Savan, R., Igarashi, A., Matsuoka, S., and Sakai, M. (2004). Sensitive and rapid detection of edwardsiellosis in fish by a

<i>loop-mediated isothermal amplification method. Appl. Environ. Microbiol 70: 621-624. doi: 10.1128/aem.70.1.621-624.2004.</i>

9. Zhang, L., Du, X., Chen, C., Han, Q., Chen, Q., Zhang, M., Xia, X., Song, Y., & Zhang, J. (2020). Development of a rapid,

<i>one-step-visual method to detect Salmonella based on IC-LAMP method. Iranian journal of veterinary research 21(1), 20-25.</i>

<i>10. Zhang, L., Wei, Q., Han, Q., Chen, Q., Tai, W., Zhang, J., Song, Y., Xia, X. (2018). Detection of Shigella in Milk and Clinical Samples by Magnetic Immunocaptured-Loop-Mediated Isothermal Amplification Assay. Original Research vol 9: 94.</i>

11. Zahraei Salehi, T., Mahzounieh, M., and Saeedzadeh, A. (2005). Detection of InvA Gene in Isolated Salmonella from Broilers

<i>by PCR Method. International Journal of Poultry Science 4 (8): 557-559.</i>

12. Malmarugan, S., Thenmozhi, V., Johnson, R. (2011). Inv A gene specific PCR for detection of Salmonella from broilers.

<i>Research vol 4(12): 562-564.</i>

13. Rahn, K., De Grandis, S. A., Clarke, R. C., McE en, S. A., Galan, J. E., Ginocchio, C., Curtiss, R., 3rd, and Gyles, C. L. (1992).

<i>Amplification of an invA gene sequence of Salmonella typhimurium by polymerase chain reaction as a specific method of detection of Salmonella. Molecular and cellular probes 6(4): 271–279. </i>