Trình tự ADN ppt

Trình tự ADN





Electropherogram printout from
automated sequencer showing part
of a DNA sequence
Một trình tự ADN hay trình tự di
truyền là chuỗi các kí tự liên tiếp
nhau nhằm biểu diễn cấu trúc
chính của một dải hay phân
tử ADN thực hoặc tổng hợp, mà có
khả năng mang thông tin.


Để tương ứng với 4 loại nucleotide,
người ta dùng 4 kí tự để phân
biệt A, X (dùng ở Việt Nam,
chữ C được dùng ở các tài liệu
tiếng Anh), G, và T- tương ứng với
tên của 4
gốc Adenin, Xitosin (Cytosine), Gu
anin, Timin được liên kết hóa trị
với mạch chính phốtpho. Trong
trường hợp chung, các chuỗi được
ghi lên kế nhau không có khoảng
trống (gap) chèn vào, ví dụ chuỗi

AAAGTXTGAX, đi từ đầu 5' đến
3' tính từ trái sang phải. Nếu có
khoảng trống, người ta dùng kí hiệu
gạch ngang (-) để làm đại diện, ví
dụ ATX-G X. Bất cứ chuỗi kí tự
nào của các nucleotide mà dài hơn
4 đều có thể gọi là trình tự ADN.
Mặt khác, tùy vào chức năng sinh
học, và ngữ cảnh, mà một trình tự
có thể mang mang mã hoặc không
mang mã(noncoding DNA). Các
trình tự DNA cũng có thể chứ
"ADN rác" (junk DNA).
Việc xác định trình tự ADN là tâm
điểm của dự án bản đồ gene
người
[1]
. Các trình tự/chuỗi này có
thể được trích rút ra từ dữ liệu thô
trong sinh học thông qua quá trình
gọi là Phương pháp sắp xếp chuỗi
ADN (DNA sequencing).
Trong một số trường hợp, trong
chuỗi có thể xuất hiện các kí tự
khác A, T, X, và G. Chúng biểu
diễn cho sự đại diện không rõ ràng,
có nghĩa là tại vị trí đó, có thể có
hơn 1 loại nucleotide. Đây là qui
ước của Hiệp hội Hóa học thuần
túy và Hóa học ứng dụng Quốc

tế (IUPAC - International Union of
Pure and Applied Chemistry):
A = adenine
C = cytosine
G = guanine
T = thymine
R = G A (purine)
Y = T C (pyrimidine)
K = G T (keto)
M = A C (amino)
S = G C (strong bonds)
W = A T (weak bonds)
B = G T C (all but A)
D = G A T (all but C)
H = A C T (all but G)
V = G C A (all but T)
N = A G C T (any)
[sửa]Xem thêm