1
I HC QUC GIA HÀ NI
I HC KHOA HC T NHIÊN
LUC
Hà Ni 2013
2
I HC QUC GIA HÀ NI
I HC KHOA HC T NHIÊN
Chuyên ngành:
Mã s: 60 44 02 28
LUC
NG DN KHOA HC:
Hà Ni 2013
3
LI C
Tc ht, em xin gi li cn PGS TS ,
ng dn em trong sut thi gian em thc hin lun . Ngoài
nhng kin thc quý báu mà thy ch dy, em còn nhc s ca thy v
tính toán.
Em xin gi li c n PGS. TS. Nguyn i
p cho em s liu và nhng kin thc b ích. i li c
ti ThS. Nguy tr em nhiu mt trong thi gian qua.
Cui cùng, em xin gi li ci các thng
Th Hc và các 2011
2013 u kin thun li cho em hoàn thành lun .
4
MC LC
DANH MC CÁC HÌNH 5
DANH M 7
M U 8
TNG QUAN V V NGHIÊN CU 10
1.1. Lch s phát trin mô hình sinh thái 10
1.2. Các công trình nghiên cu v t sinh hp khu vc Nam Trung
B 11
GII THIU MÔ HÌNH ROMS
SINH THÁI NPZD 12
2.1. Gii thiu mô hình ROMS 12
2.2. sinh thái NPZD trong ROMS 15
NG DNG MÔ HÌNH ROMS VÀ M SINH THÁI
SUT SINH HP
VÙNG BIN NAM TRUNG B 20
3.1.Gii thiu v khu vc bin Nam Trung B 20
3.1.1. V ta hình 20
u king h 21
c tin hành 26
26
3.2.2. Thit lp các thông s cho mô hình và chy mô hình 31
3.2.3. S nh ca mô hình 34
3.2.4. Hiu chnh và kinh mô hình 34
3.3. Kt qu và nhn xét 36
49
TÀI LIU THAM KHO 50
5
DANH MC CÁC HÌNH
i Arakawa-C. Phi ROMS theo
ng 14
NPZD a mung Ni trát (N), thc vt ni
ng vt ni (Z) và cht vn (D) 16
Hình 3. V a hình khu vc bin Nam Trung B trên b khu vc
Bi 20
Hình 4. Phân b bc x quang hp trên mt bin 22
Hình 5. Dòng chy tng mt và vùng hoc tri mùa hè 23
Hình 6. Phân b nhi c tng mt 24
Hình 7. Phân b khng ng vt ni 25
a hình khu vc tính toán và quan tâm 27
ng nhi c mt bin 28
27
c ngi qua mt bin (E-P). t mt tri 28
ng nhit tnh b mt bin 28
nhng nhit tnh b mi vi nhi b mt bin 28
ng ng sut gió trên mt bin 29
u kin biên mt v nhi và dòng chy 29
u kin biên bên v nhi 29
u kin biên mt v mui và dòng chy 29
u kin biên bên v mui 29
u kin biên mt v NO
3
và dòng chy 30
u kin biên bên v NO
3
30
u kin biên mt v Chlorophyl A và dòng chy 30
u kin biên bên v Chlorophyl A 30
u kin biên mt v thc vt ni và dòng chy 31
6
u kin biên bên v thc vt ni 31
th a s liu nhi trung bình lp mt bin tháng 12
2 chy mô hình sinh thái 34
Hình 27. Nhi trung bình lp mt bin tháng 1 trong tính toán 34
ng nhi trung bình b m tài Nghiên cu phát trin và
ng dng công ngh d báo hn ngng các yu t thn khu vc
Bi 35
a s liu nhi tính toán và MODIS trong tháng 8 (trái:
s liu MODIS, phi: s liu tính toán) 36
ng dòng chy trung bình lc mt tháng 1 Trái: t dòng
chng Phi: t dòng chng 36
Hình 31. Nhi trung bình lp mt bin tháng 1 37
mui trung bình lp mt bin tháng 1 38
Hình 33. N Chlorophyl A trung bình lp mt bin tháng 1 38
Hình 34. N NO
3
trung bình lp mt bin tháng 1 39
Hình 35. Sinh khi thc vt ni trung bình lp mt bin tháng 1 40
Hình 36. Sinh khng vt ni trung bình lp mt bin tháng 1 41
Hình 37. N cht vn trung bình lp mt bin tháng 1 42
ng dòng chy trung bình lc mt tháng 7
Trái: t dòng chng Phi: t dòng chng 42
Hình 39. Nhi trung bình lp mt bin tháng 7 43
mui trung bình lp mt bin tháng 7 44
Hình 41. N Chlorophyl A trung bình lp mt bin tháng 7 45
42. N NO
3
trung bình lp mt bin tháng 7 45
c vt ni trung bình lp mt bin tháng 7 46
44. Sng vt ni trung bình lp mt bin tháng 7 47
45. N cht vn trung bình lp mt bin tháng 7 48
7
DANH M
Bng 1. Các tham s ci vi mô hình
8
M U
t sinh hp mt h sinh thái bin là công vic có ý
ng trong nghiên cu h sinh thái ca mt vùng bin. Trong tính toán
t sinh hp, vic tính toán các yu t sinh thái, c th là n
NO
3
, sinh khi ca thc vt nng vt ni (zooplankton), nng
cht vn (detritus) ca mt khu vc bin là nhng công vic chính yu, song
song và làm ti t sinh hp. T các kt qu nghiên
cu, có th c nh ng bin, sc sn xup ca
thc vt nng vt nn v m và tin ca
sinh vt ti khu vc bin quan tâm.
Trong nghiên cu h sinh thái bing nghiên cu chính: thng
kê trên s liu th mô hình hóa. Hai ng nghiên cu c
quan tâm và áp dng ti Vi
dng hin nay do tính hiu qu và kinh t. Vùng bin Nam
Trung B c các nhà khoa ht sinh hp
t nha th k 20 theo c ng ng nghiên cu
mô hình hóa thích hp nhiu kin thc t c các kt qu kh quan,
ng nghiên cng này.
s dng nghiên cu mô hình hóa trong
tính toán các yu t sinh thái quan trng cho khu vc bin Nam Trung B, bao gm
n NO
3
, sinh khi ca thc vt nng vt ni, n cht vn, v
t sinh hp vùng bin Nam Trung B bng mô hình
c tiêu ca lu c phn mm tính toán thng
lc và sinh thái ca h thquy mô vùng (ROMS) và áp dng
ti vùng bin nghiên cu. Ni dung chính ca lu u v lý
thuyc tin hành chy mô hình và phân tích kt qu c t ROMS.
9
H thn phm nghiên cu
ci hi hc Rutgers (Hoa K) và t chc IRD (Pháp), là mt
mô hình hii có nhiu ng dng cho nghiên cu v mt khu vc bin. Lu
tp trung khai thác ng dng mô phng thng lng nhit mui
ng các yu t sinh thái ca khu vc bin Nam Trung B. Trên kt qu ca
vic ng dng ROMS, luc bc tranh thng lng
nhit mui và phân b ca các yu t sinh thái trên các tng sâu ca khu vc bin
Nam Trung B.
B cc lum b
Tng quan v v nghiên cu: n cái nhìn tng quát
v ng nghiên cu sinh thái bin hii hin nay, các thành tu ca th gii,
ca Vit Nam nói chung và ca khu vc Nam Trung B nói riêng.
Gii thi sinh thái trong
ROMS: Gii thiu v lý thuya mô hình ROMS và mô
sinh thái trong ROMS.
. ng d sinh thái trong
t sinh h p vùng bin Nam Trung B: gii
thiu v khu vc Nam Trung Bc tin hành chy mô hình và các kt qu
tính toán.
10
TNG QUAN V V NGHIÊN CU
1.1. Lch s phát trin mô hình sinh thái
Lch s phát tri n vi s m màn
u tiên là mô hình sinh thái ng dng Lotka Volterra và mô
hình Streeter Phelps trong nhn 2 kéo dài trong khong 30
p theo, th hic phát tring s xut hi
c thit l nh lut bo toàn khc
m chung cn 2 là mô phng nhng m
n v các quá trình sinh thái và cho nghim gii tích hay là mô
phng bin ng sc sn xup ca thc vt ni theo mt chiu. S phát trin
thc s v c th hin 3, t
1975. Nh có s h tr c lc ca máy tính nên vic phát trin các mô hình phc
t g pháp tính hii tr nên kh thi và mô hình sinh thái
c s dng làm công c gii quyt các v qung vì nó có th
ch ra mi quan h ging và nhi theo sau trong h sinh thái.
n 4, kéo dài t n 1980, có th xem là thi k ng thành ca mô
hình sinh thái. T kinh nghim ca vic phát trin nhiu mô hình mi cho thy, h
sinh thái khác xa các h thng vn ca h sinh thái cn
phc phc s phát trin theo chiu sâu. Giai
n 5 kéo dài trong kho i s hình
thành và phát trin mt s ng ln các loi mô hình sinh thái khác nhau trên rt
nhic khác nhau. n 6 bu t n nay, có th
là thi k phát trin rc r ca mô hình sinh thái v quy mô c chiu rng ln chiu
sâu. Hàng lot mô hình sinh thái hic phát trin và nhiu
tp chí mi t t sinh thái n
11
công ngh th
ng t s phát tring v mô hình sinh thái trong giai
n này [6].
1.2. Các công trình nghiên cu v t sinh h p khu vc Nam
Trung B
n nay, t s nghiên cu v t sinh hp ti các
khu vc bin nh trong vùng bin Nam Trung B, có th k n là các công trình
nghiên cu ca GS. TS. Nguyn Tác An (và cng s vt cht c
sut sinh hc p vùng bin ven b Phú Khánh, Thun Hi, Minh H
t sinh hp bin ven b Vi; t sinh h
cp và hiu ng sinh thái cc tri ca vùng bin Nam Trung Bvà
gt sinh h c-sinh thái ca thc vt
phù du v [6, 9]
Tuy nhiên, các công trình nói trên ch gii hn trong mt khu vc nh thuc
vùng bin Nam Trung B. Công trình nghiên cu v t sinh hp ca
P trong lun án TiMô hình hóa s phân b sinh vt ni
t sinh hp vùng bin Nam Trung Bbao quát c vùng
bin Nam Trung B c tính b [1].
12
GII THIU MÔ HÌNH ROMS
SINH THÁI NPZD
2.1. Gii thiu mô hình ROMS
H tht thành viên trong
lp mô hình s tr có h t thích a hình, mt thoáng, ba chiu. H thng
c nghiên cu và phát trin i hi hc Rutgers
(Hoa K) và t chc IRD (Pháp) vi m sinh thái và
các chu trình sinh-a-hóa hc trong các khu vc bic
duy trì và áp dng bi mt ci s dng, hin ti con s i hàng
p ci tin quan trng trong nhc thua hóa
hng lc hc, kt qu to ra mt h thng mô hình bin th
hin kh u quy mô không gian/thi gian và nhiu vn
ng. Nghiên cu này s dng kt qu nghiên cu t phiên bn ROMS ca t
chc IRD - c h tr bi b công c ROMSTOOLS cho các
c và sau chy mô hình ROMS [10].
ROMS gii h Stokes trung bình Reynolds s dng
xp x Boussinesq và xp x th ng lc ch o trong
dng, h t sâu trình bày theo
dng truyn th
0
( ' ' )
Z Z Z Z
Z
ZZ
Z
H u uH u vH u H u
H
p v u
fH v H g u w
t x y s x x s H s
13
0
( ' ' )
Z Z Z Z
Z
ZZ
Z
H v uH v vH v H v
H
p v v
fH u H g v w
t x y s y y s H s
00
1
0
z
pg
H
s
vc:
0
Z Z Z
H u H v H
t x y s
n chuyng:
( ' ' )
Z Z Z Z
source
Z
H C uH C vH C H C
vC
c w C
t x y s s H s
ng thành phn ca vn t
ng (theo h t c dâng
m sâu ci mc trung bình; H
z
là h s t l theo chiu thng và f là tham s Coriolis. Gch ngang trên th
hin trung bình thi gian và mt d hin nhing ri. Áp sut là p;
0
là m tng cng và m chun; g là gia tc tr s
nht phân t. C là mt yu t vt lý (ví d: mui, nhi và trng);
C
source
là nhng các thành phn ngun sinh/mt ca các yu t vt lý. Cui cùng,
mt hàm [
( , )f C p
] cn thi ng thái.
H c khép kín bi vic tham s hóa ng sut Reynolds
ng ri ca các yu t v
' ' ;
M
u
u w K
z
' ' ;
M
v
v w K
z
''
H
c w K
z
14
K
M
là h s nhi vng và K
H
là h s khuch tán xoáy
i vi yu t vt lý [10].
H t s dng trong mô hình là h t thích a hình vi
tính cu trúc. Ri rc hóa mô hình ti i tính
Arakawa-c gi
sai phân trung tâm [11].
Hình 1. T i Arakawa-C.
Phng [13]
* Khép kín ri
Trong nhng ng d
c gii bi mi tính mà khong cách gii là quá l
gii quyt mt cách thích hp nhng quá trình ri quy mô nh mc tiêu tán. Bi
vy, nhi vi xáo trng
cng (h s nht ri K
M
) và khng (h s khuch tán ri K
H
) phi
c tham s hóa s dng mt mô hình khép kín ri. ROMS cung c
khép kín ri: (i) dùng nhng biu thc ginh bi s
dng cho K
H
và K
M
; (ii) tn s xáo trn Brunt xáo trn
15
nh da trên tn s nh, và bi (iii) s tham s hóa K-profile, (iv)
Mellor Yamada cp 2.5, và (v) nhng quát [10].
Nghiên cu này s du tiên.
* ng lc l
ng lc lnh ng sut cng lên dòng
chy, làm h nh Navier Stokes trung bình Reynolds thành nhu
ki ng. ROMS thc hin c hai mô hình chi ti th hin
nhng quá trình l s din t h s n, và (ii) nhng
c t biu din li s a sóng và dòng chy lên
tr dch chuyn [10]. Nghiên cu này s dng loi mô hình th
nht.
sinh thái NPZD trong ROMS
t s các mô hình nh v sinh thái. Vi mn
ng sinh thái, ROMS bao gm: mt mô hình loi NPZD, mt mô hình loi
Fasham, mt mô hình loi hai loài phytoplankton, và mt mô hình lo
phytoplankton [10]. Mô hình loi NPZD có bn bin trng thái gm gii hn dinh
ng thy nhthc vt ni, ng vt ni và cht vn, tt
c gii hng (c th trong nghiên cu này là
mmolN.m
-3
). Nghiên cu này s dng mô hình lon nht, vi mc
u v ng dng tính toán h sinh thái trong h thng mô hình
ROMS.
Thc vt ni là các sinh vt t ng có kh ng hp cht h
các chng nh hp th ng ánh sáng mt tri và sng
trong tc mc tr lên), là b phn sn xut ch yu bi chúng
luôn chi c v khng và t tng hp cht hn.
Thc vt nng th yu cng vt nt
mng vt nt dng trong cùng mt không gian, mi
16
quan h t mi vt dm trong th cân bng, ph thuc cht ch
u kin vng [2].
NPZD a mung Ni trát (N),
thc vt nng vt ni (Z) và cht vn (D) [12]
Hình 2 cho thy ma 4 thành ph NPZD, qua
thn hóa các hp phn mt cách tn
không thc t, tuy nhiên vi vic tip cn th nghi
pháp này là mt bc khu tt cho vic tip cn các mô hình h sinh thái [12].
u din các quá trình ca mô hình c s dng trong
nghiên cu này c din gii vi phân
Ni trát (NO
3
)
N
Thc vt ni
P
Cht vn
D
ng vt ni
Z
Sn phm mi
Chìm
Chìm
Bài tit
Cht
Cht+bài
tit
S bù cht
khoáng
17
t
- Tt c các hàm ngun Q là các hàm vô hngc tính theo các công thc sau:
các tham s c tính theo các công thc:
18
L
vs
ph thuc s chìm lng ca thc vt ni và cht vn. -
PAR là bc x tích cc quang hp.
Vic tính toán các bin n hóa bng vic hng s hóa t và
vn tc ca các quá trình, c cho trong bng sau theo John Moisan:
Bng 1. Các tham s ci vi mô hình NPZD [15]
Bin
u
Giá tr
k
water
Hánh sáng
0.04
[m
-1
]
k
Chla
do Chlorophyl
0.025
[(m
2
mg Chla)
-1
]
I
4
[mgC(mgChlaWm
2
d)
-
1
]
r
C:N,phyto
T s i vi thc vt ni
6.625
[mMolC(mMol N)
-1
]
r
C:N,zoo
T s i vng vt ni
[mMolC(mMol N)
-1
]
m
T s gia t bào Chlorophyl ci
0.053
[mg Chla/mg C]
K
NO3
H s i vi thc vt ni,
theo NO3
1./0.5
[mmolN m
-3
]
K
NH4
H s i vi thc vt ni,
theo NH4
1./0.5
[mmolN m
-3
]
t
Pmort
T cht ca thc vt ni
0.07
[d
-1
]
t
Zgraze
T ng vt
ni
0.75
[d
-1
]
AE
N
Hiu sung hóa cng vt vi N
0.75
[-]
GGE
C
Hiu sung hóa cng vt vi N
0.75
[-]
AE
C
Hiu sut phát trin tng cng cng
vt ni
0.65
[-]
K
P
Hng s bán ng vt n
1
[mmolN m
-3
]
t
Zbmet
T bài ting vt ni
0.1
[d
-1
]
t
Zbmort
H s cht bc 2 cng vt ni
0.1
[d
-1
(mmolN m
-3
)
-1
]
t
SDremin
T cht vn nh chuyn thành NH4
0.01
[d
-1
]
t
coag
T tc t
0.01
[(mmolN m
-3
)
-1
d
-1
]
19
thc vt ni và cht vn nh)
t
LDremin
T a cht vn ln chuyn
thành NH4
0.01
[d
-1
]
w
SD
Vn tc chìm lng ca cht vn nh
0.1
[md
-1
]
w
LD
Vn tc chìm lng ca cht vn nh
10
[md
-1
]
w
phyto
Vn tc chìm lng ca thc vt ni
0.1
[md
-1
]
t
nitri
H s ni trát hóa ca NH4 thành N03
0.1
[d
-1
]
I
thNH4
Ni vi vin ni
trát hóa
0.0095
[Wm
-2
]
D
p5NH4
H s i vi vi
chn ni trát hóa
0.036
[Wm
-2
]
20
NG D SINH THÁI
T SINH HP
VÙNG BIN NAM TRUNG B
3.1.Gii thiu v khu vc bin Nam Trung B
3.1.1. V a hình
Khu vc bin Nam Trung B nm phía tây ca Bic khu vc
bin Nam Vit Nam, din tích khong 197522 km
2
, có v
: t b bin Vin 111
0
: t 9
0
n 14
0
c
Hình 3. V a hình khu vc bin
Nam Trung B trên b khu vc Bin
Khu vc
bin Nam
Trung B
21
thy a hình khu vc bin Nam Trung B i d
sâu ca khu vc Nam Trung B bii trong khong t n trên 3000m.
3.1.2. u king h
* Bc x quang hp
Vùng bin Nam Trung B thuc min ni chí tuyn bc có hai l
mt trnh (tháng 4 và tháng 8), vùng bin nghiên cng xuyên
nhc ngung bc x t nhiên dc gn b
nhn khong 130--
ng dài, trng quang mây, nhing mây tng quan
t quá cp 6-7. ng bc x t nhiên vào c 50-70 cal/m2.gi ng
có giá tr cao t n tháng 8, là nhng tháng có nhiu gi nt trên 250
gi/tháng vào các tháng 3, 4, 5 và trên 200 gi/tháng vào cc tháng 7, 8. Nu cho
rng bc x quang hp chim khong 50% tng bc x t nhiên thì
giá tr ca nó trên b mt vùng bit c 0.37-0.57 cal/cm2.phút
n nhing.
trong sut khá cao: khu vc gn b 4-
15-y bc x d dàng xâm nhp ti các lc sâu. Vi h
s suy gim bc x c bin vào c 0.05-0.08 là giá tr trung bình cho các
vùng bin nhii gn b thì chiu dày lp quang hp c có bc x
trên 0.003 cal/cm2.phút) có th c 80-100m [1].
22
Hình 4. Phân b bc x quang hp trên mt bin (cal/cm
2
)
- [1]
* H thng thng
Vùng bin Nam Trung B nm trn trong vùng nhii gió mùa, chu nh
ng trc tip ca 2 h tha khí quyc
hong ch yu t nh nht vào tháng 2 vi
tun sung NE và N chim trên 85%, tn sut t lm trên
70%; gió mùa Tây Nam hong ch yu t n tháng 9, mnh nahats
vào tháng 7-8 vi tn sung SW và W chim trên 70%, tn sut t l
6 m/s chim trên 60%. H thc tng mt khá thng nht vng
gió: khu vc gn b có dòng chy xit dc bc nhau trong 2 mùa và
t trung bình vào khong 50-70 cm/s; khu vc xa b dòng chy phâ
t vào khong 10-25 cm/s và nh [1].
23
Hình 5. Dòng chy tng mt và vùng
hoc tri mùa hè [1]
c tri là hic thù vùng bin Nam Trung B, xut hin trong
mùa gió Tây Nam. Khu vc tri mnh nm kho t
b t c 5-15.10
-3
sâu
xut phát tc khong 75-200 m. Phm vi hoc tri lan rng hu
khp vùng bi n kho vi c 1-5.10
-3
cm/s.
Hic tr i hàng lo c ca
vùng bin Nam Trung B trong mùa hè so vi nhng vùng k cn, to nên mt h
sinh thái trù phú [1].
3.1.3. Yu t lý hóa sinh hc
Phn ln thi gi c tng mt ti vùng bin nghiên
cu thi các vùng k cy lnh dc b o
24
nên c li 26
0
i 25
0
C, trong khi nn
nhit trung bình nam bii k này là 27
0
c tri xut
hin làm nhi c tng mt th-2
0
C so vi vùng ngoi vi (27-28
0
C so
vng nhit tng mt to thành vòng khép kín ti khu vc
c tri mnh vi 27.5
0
C, nhii 26
0
C. Lng nht nhit
có chiu dày khong 50--40m trong mùa hè và nh
10m c tri.
Hình 6. Phân b nhi c tng mt (
0
C)
- [1]
Do vt chc b ng xuyên t ca sông Cu Long, t các vùng
bin phía bc và t các lc sâu nh n thng, nht là
hoc tri mùa hè, vùng bin Nam Trung B thuc loi vc nhit
ng. Phân b mt rng ca các hp chng nói chung có
s phân hóa mnh trong mùa hè: nhng khu v ng cao
ng tp trung gn b, ca sông và khu vc tri mnh, phù hp vi v trí
25
các ngun b mt rng các hp chng
[1].
Hình 7. Phân b khng vt ni 7-1979 [1]
là quy lut ph bin ca qun th
sinh vt ni vùng bin nhii. vùng bin nghiên cu có trên 220 loài to vi s
ng trung bình có bc 105-106 t bào/m3 và 212 loài tng vt ni (không k
ng vt nguyên sinh) vi sinh vng trung bình 32 mg/m3. Vùng tp trung
sinh vt nng gn lin vi các khu vng. Sc sn xut bc 1
gn b và khu vc tri mnh có th n trên 80 mgC/m3.ngày, là giá
tr n nhii có sc sn xut bc 1 cao.
Kh khong 111
0
E tr i thông thoáng vi
nam Bi ca hu ht các yu t lý, hóa, sinh hc i