Bài tập Tinh Sinh học
Đề tài: Tìm vùng bảo thủ, thiết kế mồi tách
dòng gen sinh PEROXIDASE từ củ cải trắng
Dự đoán kết quả trước khi biến nạp gen
Nhóm 2
Khái quát
Peroxidase có ứng dụng như:
Xử lý nước thải công nghiệp
Xác định hàm lượng thủy ngân trong nước ô
nhiễm.
Phần 1: tìm vùng bảo thủ để thiết kế mồi
Tìm vùng bảo thủ
Tìm vùng bảo thủ
Chạy chương trình ClustalW
Chạy chương trình ClustalW
Chạy chương trình ClustalW
Tìm vùng bảo thủ theo protein
Tìm vùng bảo thủ theo protein
Tìm đoạn bảo thủ để tách dòng gen
Chọn chủng sau tìm đoạn bảo thủ
Thiết kế mồi tách dòng
Thiết kế mồi tách dòng
Thiết kế mồi tách dòng
Thiết kế mồi tách dòng
Kiểm tra sự bắt cặp của mồi
Kiểm tra sự bắt cặp của mồi
Kết luận.
Vậy cặp mồi cấn thiết kế cho việc tách dòng
gen là:
1 CGAAAACCACCAAAAACCTC
2 CCAACTTCACCATGCCTTCT
Kết quả chạy iPCR
Kết quả chạy iPCR
Thiết kế vector tách dòng
Chạy NEB
Chọn vector tách dòng pet
Chọn Enzyme giới hạn
EcoRI :GAATTC
SacI :GAGCTC
Thiết kế vector tách dòng
Thiết kế vector tách dòng