SAO CHÉP ADN
Mục tiêu
Trình bày được quá trình sao
chép chính xác ADN
Tóm tắt cách thức sao
chép của acid nucleic ở virus
Mô tả được quá trình sửa
chữa ADN
Nội
dun
g
• Khái niệm
• Sự sao chép của ADN
Thí nghiệm của Meselson và Stahl
Các yếu tố cần thiết cho sự sao cheùp ADN
Sao cheùp ADN prokaryote (E. coli)
Sao cheùp ADN eukaryote
Sao chép ADN virus
• Sửa sai khi sao chép và khi không
sao chép
Khái niệm
Các sinh vật giống nhau ở mức phân tử
dù là có vẻ rất khác nhau
• ADN là vật liệu di truyền (ở hầu hết sinh vật )
• Cùng mã di truyền
• Có cùng cơ chế tổng hợp ADN, ARN, protein
• So sánh các trình tự ADN cho phép suy ra các mối
quan hệ của sự tiến hóa
Khái niệm
• Học thuyết trung tâm (Central
Dogma)
– Các phân tử và các quá trình
Khái niệm
ADN-ARN-Protein
ADN (ATGC):
thơng tin di truyền
ARN (AUGC):
tiến hành và
vận chuyển
Protein (20-mã chữ):
thực hiện chức
năng sinh học
Nhân
nguyên
thủy
(prokaryote)
Nhân thật
(eukaryote)
Khái niệm
Cấu trúc xoắn kép cơ bản của ADN
. 2 chuỗi đường-phosphat ở mặt ngoài
. các base nitơ ở bên trong nối với nhau bằng các liên kết hydro
Khái niệm
Cấu trúc chung của
nucleotide - đơn vị cơ sở của
acid•nucleic
base dị vịng có nitơ
• pentose
• acid phosphoric
Có năm base chính trong acid
Khái niệm
nucleic
A, G, T, C có trong ADN
A, G, U, C có trong ARN
Khái niệm
Các tiểu đơn vị nucleotide
nối với nhau bởi liên kết
phosphodiester
Khái niệm
DNA tự nhiên là xoắn kép
của chuỗi đối song gắn bổ
sung vào nhau bằng:
Liên kết Hydrogen bổ
sung nhau giữa các cặp
base (A-T or G-C)
Tương tác kỵ nước giữa
các base hai chiều
Các dạng hình học khác nhau của chuỗi xoắn kép
Dạng "B" của chuỗi xoắn kép
DNA xoay 360° cho mỗi 10.6
bp mà không chịu sức căng
nào
Dạng "A" thường
xuất hiện trong các
mẫu DNA mất
nước và có thể
trong dạng lai
DNA-RNA
Cấu trúc ADN
DNA trong tế
bào được
methyl hóa
cho các mục
tiêu điều hịa
có thể mang
dạng “Z”
Cấu trúc ADN
Các dạng hình học khác nhau của chuỗi xoắn kép
Dạng hình học
Chiều xoắn
Dạng A
Dạng B
Dạng Z
phải
phải
trái
Đơn vị lặp lại
1 bp
1 bp
2 bp
Góc quay/bp
33.6°
35.9°
60°/2
Số bp trung bình/vịng xoay
10.7
10.0
12
Độ nghiêng của bp so với trục
+19°
-1.2°
-9°
Độ dài dốc/bp dọc theo trục
0.23 nm 0.332 nm
0.38 nm
Bước/vòng xoay
2.46 nm
3.32 nm
4.56 nm
+18°
+16°
0°
Mean propeller twist
Glycosyl angle
Sugar pucker
Đường kính
anti
anti
C: anti,
G: syn
C3'-endo C2'-endo C: C2'-endo,
G: C2'-exo
2.6 nm
2.0 nm
1.8 nm
Cấu trúc ADN
Chuỗi ADN viết theo hướng 5’ 3’
Đầu 3’
Đầu 5’
pTpApCpG
Đầu 5’
Đầu 3’
TACG
Cấu trúc ADN
ADN vòng
Nhân thật:
ADN ty thể (mitochondria)
ADN lục lạp (chloroplast)
Vi khuẩn:
ADN nhiễm sắc thể
ADN plasmid
Sao chép
ADN
Cơ
chế
Bán bảo
thủ ?
Matthew
Meselson
Frank Stahl
Bảo thủ ?
Xen kẽ ?
Thí nghiệm Meselson &
Stahl
Nuôi E. coli, nguồn N là amoni
N14/N15
N15 vài
thế hệ
N14 một
thế hệ
Chiết ADN và ly
tâm
Thí nghiệm Meselson và Stahl
Thí nghiệm Meselson và Stahl
Các yếu tố cần
thiết cho sự sao chép
ADN
• Khuôn mẫu (đoạn phân tử ADN ban
đầu)
• Ion Mg2+
• 4 loại desoxyribonucleotid triphosphat
(dNTPs)
• Enzyme ADN polymerase
Sự hình thành liên kết
phosphodiester giữa
desoxy-ribonucleotid và 3’OH của chuỗi ADN đang sao
chép
DNA
H
H
H
H
d(NMP)n + dNTP d(NMP)n+1 +
PPi
Incoming
dNTP
PPi
2P
Các bước trong tổng hợp ADN ở
tế bào nhân nguyên thủy
A. Tách hai sợi ADN bổ sung
B. Tạo chạc ba sao chép
C. Hướng sao chép
D. Mồi ARN
E. Kéo dài chuỗi
F. Cắt mồi ARN và thay thế bằng ADN
G.ADN ligase
Quá trình sao chép ở E.coli
Quá trình sao chép ADN ở E. c
A. Tách hai sợi ADN bổ sung
- Bắt đầu khi protein B nhận biết được
điểm khởi sự sao chép (Ori) trên ADN
B. Tạo chạc ba sao chép
Chạc ba sao chép
Hướng
Hướng
Chạc ba sao chép
Quá trình sao chép ADN ở E. c
B. Tạo chạc ba sao chép
Các protein cần để tách sợi ADN
- DnaA protein
20-25 DnaA protein gắn vào làm sợi kép ADN tách nhau
- Các protein căng mạch (SSB protein) gắn vào các mạch đơn
- DNA helicase (Rep-protein 3’ 5’); Helicase II, III 5’—3’)
gắn vào các mạch đơn gần chạc ba và di chuyển về vùng kề sợi kép,
cắt các liên kết hydro giữa các base nitơ chạc ba sao chép