XÁC ĐỊNH KIỂU GEN VI RÚT VIÊM GAN B VÀ CÁC ĐỘT BIẾN KHÁNG THUỐC BẰNG KỸ THUẬT GIẢI TRÌNH TỰ CHUỖI docx

XÁC ĐỊNH KIỂU GEN VI RÚT VIÊM GAN B
VÀ CÁC ĐỘT BIẾN KHÁNG THUỐC BẰNG
KỸ THUẬT GIẢI TRÌNH TỰ CHUỖI

I, NHỮNG TIẾN BỘ CỦA XÉT NGHIỆM TRONG CHẨN ĐOÁN BỆNH
VIÊM GAN SIÊU VI B
Mặc dù chương trình tiêm ngừa vi rút viêm gan B (HBV) đã làm giảm đáng kể tỷ
lệ bệnh viêm gan do vi rút B, nhưng HBV vẫn còn là một “tên sát nhân giấu mặt”
vì đôi khi triệu chứng của bệnh rât mơ hồ làm cho ta lầm tưởng với một trường
hợp rối loạn tiêu hóa hay gặp, và đa số trường hợp không có triệu chứng lâm sàng
ở những trường hợp viêm gan vi rút B mãn tính mà chỉ có xét nghiệm máu chúng
ta mới chẩn đoán được bệnh. Do đó, vai trò của xét nghiệm trong chẩn đoán viêm
gan do vi rút B giữ một vai trò cực kỳ quan trọng. Có nhiều loại xét nghiệm khác
nhau được xử dụng trong chẩn đoán viêm gan vi rút B, mỗi loại có một ý nghĩa
khác nhau tùy vào từng giai đoạn của bệnh mà người bác sĩ sẽ lựa chọn xét
nghiệm thích hợp.
Có 5 xét nghiệm hay được dùng trong chẩn đoán, đánh giá vi rút viêm gan siêu vi
B trước đây là HBsAg, AntiHBs, HBeAg, AntiHBe, AntiHBc IgM và AntiHBc
IgG. Các xét nghiệm này là những xét nghiệm cơ bản, dùng phương pháp miễn
dịch để phát hiện nhưng vẫn có một số hạn chế.
Vào những năm cuối thế kỷ 20, kỹ thuật sinh học phân tử ra đời và có tốc độ phát
triển nhanh chóng đã mở ra một kỷ nguyên mới về chẩn đoán gen nên chúng ta đã
có thể chẩn đoán được vi rút viêm gan B ở mức độ phân tử (Đó là các xét nghiệm
phân tích trên phân tử di truyền của HBV là DNA). Nhờ ứng dụng các kỹ thuật về
phân tích DNA của HBV mà chúng ta có thể giải quyết được các hạn chế của các
kỹ thuật miễn dịch kinh điển cũng như phân tích DNA vi rút giúp chúng ta có
những cơ sở đánh giá tình trạng bệnh, khả năng diễn tiến của bệnh, theo dõi điều
trị bệnh và lựa chọn phương thuốc điều trị thích hợp. Cho đến nay chúng ta có thể
thực hiện được một số xét nghiệm sinh học phân tử ở HBV như sau:
F Xác định được tình trạng đang tăng sinh của vi rút trong những trường hợp có
đột biến ở vùng trước lõi (Pre Core) để từ đó có quyết định điều trị đặc trị không.

Đó là xét nghiệm HBVDNA, và kỹ thuật thường dùng để xác định HBVDNA là
kỹ thuật PCR (Là một kỹ thuật khuếch đại DNA đích, rất nhạy và đặc hiệu, được
xử dụng phổ biến không chỉ ở Việt Nam mà cả trên thế giới).
F Đếm số lượng vi rút B trong máu để theo dõi trong điều trị. Nhờ xác định được
số lượng vi rút trước khi điều trị mà chúng ta có thể theo dõi số lượng vi rút trong
quá trình điều trị: Tăng giảm như thế nào để có sự thay đổi điều trị kịp thời và hiệu
quả. Hai kỹ thuật thường dùng để định lượng vi rút viêm gan B là Real Time PCR
(Khuếch đại DNA đích với thời gian thật) và bDNA (Khuếch đại tín hiệu).
F Xác định được loại vi rút (Định kiểu gen vi rút HBV: HBV Genotype).
F Phân tích được các trường hợp đột biến kháng thuốc để từ đó chúng ta có cơ sở
lựa chọn các loại thuốc điều trị thích hợp, đặc biệt các đột biến kháng với
Lamivudine (Là thuốc uống đầu tiên và được xử dụng rộng rãi cho điều trị HBV,
tuy nhiên có một nhược điểm duy nhất là rất dễ bi đột biến kháng thuốc ở vi rút).
Nhờ đó mà người bác sĩ sẽ tránh được những trường hợp dùng thuốc không hiệu
quả, giảm sự tốn kém cho bệnh nhân.
Cho đến nay, 2 vấn đề mới nổi lên và đang được quan tâm trong việc chẩn đoán
HBV là vai trò thực sự của kiểu gen vi rút viêm gan B và sự đột biến của vi rút B
trong quá trình diễn tiến tự nhiên của bệnh cũng như dưới tác động của thuốc đặc
trị: Kháng thuốc như thế nào và hiệu quả của các thuốc điều trị.
II, PHƯƠNG PHÁP XÁC ĐỊNH KIỂU GEN VÀ ĐỘT BIẾN KHÁNG THUỐC
CỦA VI RÚT B.
Trước đây, HBV được phân ra làm 4 kiểu huyết thanh (Serotypes): adr, adw, ayr,
và ayw dựa trên việc xác định các kiểu kháng nguyên của kháng nguyên bề mặt vi
rút B, các kiểu huyết thanh này có thể phân loại thêm ra 9 chi kiểu (Subtypes) là
ayw1, ayw2, ayw3, ayw4, ayr, adw2, adw4, adrq+, và adrq Nghiên cứu dịch tể
cho thấy sự phân bố của các serotypes khác nhau trên các vùng khác nhau trên thế
giới. Tuy nhiên, cho đến nay có rất ít dữ liệu về vai trò của HBV Serotypes.
Những tiến bộ của kỹ thuật sinh học phân tử vào những năm cuối thế kỹ 20 đã
giúp khám phá ra sự đa dạng trong trình tự chuỗi của vi rút viêm gan B, và từ đó
một dấu ấn (marker) mới của HBV ra đời là HBV genotype. Tám kiểu gen của

HBV đã được xác định (Từ A đến H) dựa vào sự khác nhau trên 8% của toàn bộ
trình tự chuỗi của bộ gen HBV, và sự phân bố của các kiểu gen khác nhau ở các
châu lục, các nước khác nhau.
Tuy nhiên sự phân loại các HBV genotypes có thể chỉ cần dựa trên trình tự chuỗi
(sequence) của một đoạn gen nào đó của HBV như trên một phần trình tự chuỗi
của gen pre-S; S. Có nhiều phương pháp đã được nghiên cứu và dùng trong việc
xác định HBV genotypes như giải trình tự chuỗi (sequencing), RFLP (Restriction
Fragment Length Polymorphism), LiPA (Line Probe Assay), phản ứng miễn dịch
men (Enzyme-linked Immunoassay). Mỗi phương pháp có những ưu và nhược
điểm khác nhau, tuy nhiên phương pháp giải trình tự chuỗi có thể xem như có
nhiều ưu điểm nổi bật vì bên cạnh việc xác định được trình tự chuỗi các
Nucleotids trong bộ gen của HBV để từ đó so sánh với thư viện gen và xác định
được HBV genotypes mà còn dựa vào kết quả giải trình tự này chúng ta có thể xác
định được một số dạng đột biến kháng thuốc của HBV để từ đó có phát đồ điều trị
tối ưu.
Hiên nay, tại trung tâm y khoa MEDIC TP Hồ chí Minh xử dụng hệ thống giải
trình tự Trugen của hãng Bayer (Đức). Đây là hệ thống giải trình tự xác định được
cùng một lúc kiểu gen và các đột biến kháng thuốc của HBV và lần đầu tiên xử
dụng như một xét nghiệm thường qui. Ngoài HBV, hệ thống này còn dùng cho xác
định kiểu gen vi rút viêm gan C (HCV genotype) cũng như xác định các đột biến
kháng thuốc vủa HIV.
1, KHÁI NIỆM VỀ CẤU TRÚC PHÂN TỬ DNA:

Nguyên tắc bổ sung trong cấu tạo phân tử DNA: DNA là một chuỗi xoắn kép, hai
mạch đơn được nối với nhau bằng liên kết Hydro. Mối liên kết này có thể bị phá
vỡ bởi nhiệt độ cao (Thường là trên 90 o C, và ứng dụng thực tế là 94 o C), làm
cho phân tử DNA biến thành 2 mạch đơn. Có 4 loại Nucleotid (Nu ) căn bản cấu
tạo nên DNA: A(Adenine), T(Thymine), G(Guanine), C(Cytosine).

Và ở phân tử RNA là A, U, G, C. Các Nu này bắt cặp với nhau theo nguyên tắc

bổ sung: A (Hoặc U ) gắn với T, G gắn với C (Xem hình minh họa).
Việc xác định được thứ tự các Nu gắn kết với nhau dọc theo chiều dài
của bộ gen (DNA) gọi là việc giải trình tự chuỗi (Sequencing), và trình tự gắn kết
nhau của các Nu gọi là trình tự chuỗi (Sequence).


2, CẤU TẠO BỘ GEN HBV:
HBV có bộ gen là phân tử DNA, chiều dài khoảng 3200 bases. Hoạt động nhân
đôi của HBV nhờ hoạt tính của men polymerase (P protein), đây là một Protein
lớn, phức tạp, và đa chức năng. Trên vùng gen P (Polymerase) được chia làm 4
vùng, mỗi vùng có một chức năng riêng: Terminal protein, Spacer, RT domains và
RNAase H (Xem hình). Trong đó, vùng sao mã ngược (RT domains: Reverse
Transcription) chịu trách nhiệm cho việc tổng hợp men RNA-dependent DNA và
DNA-dependent DNA được chia ra thành 7 vùng đặt tên từ A – G (Xem hình cấu
tạo RT). Vì vùng RT là đích tác động của thuốc Lamivudine nên những đột biến
của vùng này trong quá trình phát triển tự nhiên của siêu vi B cũng như dưới tác
động của thuốc điều trị sẽ dẫn tới vấn đề đột biến kháng thuốc.



CẤU TẠO BỘ GEN HBV






CẤU TẠO GEN P VÀ VÙNG RT

3, QUI TRÌNH THỰC HIỆN GIẢI TRÌNH TỰ CHUỖI TRÊN HỆ THỐNG

SEQUENCING TRUGENE
Để thực hiện được kỹ thuật giải trình tự chuỗi, chúng ta phải thực hiện 3 bước
chính sau: (1) Thực hiện PCR; (2) Thực hiện phản ứng cắt; (3) Điện di và phân
tích kết quả.

3.1, THỰC HIỆN PCR.
Để khuếch đại gene của HBV ta dùng kỹ thuật PCR. Mục đích của giai đoạn này
là khuếch đại đoạn gen đặc hiệu cho HBV có ở trong máu bệnh nhân: Từ một
phân tử ban đầu thành hàng tỷ bản sao DNA, từ đó mới thực hiện được giải trình
tự chuỗi của HBV. Đây là giai đoạn quan trọng, quyết định cho sự thành công khi
thực hiện giải trình tự chuỗi.
Kỹ thuật này gồm có 4 bước chủ yếu sau đây (Theo thứ tự từng bước thực hiện):
1, Lấy mẫu, bảo quản mẫu & cách gửi mẫu.
2, Ly trích và tinh sạch DNA của HBV.
3, Khuếch đại DNA vi rút bằng phản ứng PCR trong máy luân nhiệt.
4, Kiểm tra & phát hiện sản phẩm khuếch đại (Amplicon) trên gel Agarose.
Sau đây là chi tiết và ý nghĩa của mỗi bước thực hiện.
3.1.1, Lấy mẫu, bảo quản mẫu & cách gửi mẫu.
Yêu cầu của mẫu máu:
Serum, plasma (tuyệt đối không dùng Heparin)
Tách serum hoặc plasma trong vòng 4 giờ sau khi lấy máu
Nếu chưa thực hiện ly trích DNA thì mẫu phải được lưu ở –20oC. Nếu gửi mẫu
phải giữ mẫu trong đá khô là tốt nhất.
Tránh hiện tượng phải rả đông mẫu máu nhiều lần.
Máu tĩnh mạch, lấy lúc đói và buổi sáng là tốt nhất
Dụng cụ lấy máu: Vô trùng, loại dùng một lần, thao tác đúng nguyên tắc vô trùng,
có bao tay.
3.1.2, Ly trích và tinh sạch DNA của HBV.
Phương pháp ly trích của chúng tôi chọn là hấp thụ DNA lên các hạt silica, rửa
bằng Ethenol 70%.

3.1.3, Khuếch đại DNA virus bằng phản ứng PCR trong máy luân nhiệt.
Áp dụng kỹ thuật PCR (Polymerase Chain Reaction: Phản ứng trùng hợp chuỗi).
Đây là kỹ thuật khuếch đại một đoạn gen mà chúng ta cần khuếch đại, sau khi
khuếch đại chúng ta có một số lượng rất nhiều DNA để ứng dụng vào các lĩnh vực
mà ta quan tâm.
Một chu kỳ của phản ứng PCR gồm có 3 giai đoạn:
(1) GIAI ĐOẠN BIẾN TÍNH:
Nhiệt độ của ống mẫu sẽ được tăng lên đến 94o C, ở nhiệt độ này sẽ làm cho phân
tử DNA biến tính tách ra làm đôi hoàn toàn, tất cả hoạt động của các men đều
dừng lại (Ví dụ hoạt động kéo dài ở chu kỳ trước). Mục đích của giai đoạn này
làm cho phân tử DNA tách ra làm đôi và được duỗi thẳng ra hoàn toàn, từ đó dễ
dàng cho việc bắt cặp và gắn các Nu vào mạch đơn đó theo nguyên tắc bổ sung.
Hình minh họa giai đoạn biến tính:


(2) GIAI ĐOẠN BẮT CẶP:
Các Primer (Các đoạn mồi) có gắn Biotin là các đoạn Nu ngắn (Khoảng 20-25 Nu)
có sẵn trong ống mẫu sẽ bắt cặp vào các chuỗi đơn DNA sau khi biến tính theo
nguyên tắc bổ sung. Sự bắt cặp này sẽ có 2 ý nghĩa đặc hiệu: Đặc hiệu theo
nguyên tắc bổ sung với đoạn gen mà ta cần khuếch đại và đặc hiệu theo chiều dài
của đoạn gen khuếch đại. Ví dụ như ta cần khuếch đại đoạn gene của HBV thì chỉ
các primer cho HBV mới bắt cặp được với các gen của HBV có trong ống mẫu,
còn các gen của các loài khác sẽ không được bắt cặp (Đồng nghĩa với việc không
khuếch đại được).
Hình minh họa giai đoạn bắt cặp:

(3) GIAI ĐOẠN KÉO DÀI:
Sau khi primer bắt cặp đặc hiệu với các mạch đơn DNA, nhờ tác dụng của men
Taq polymerase ở điều kiện thích hợp sẽ gắn các Nu có sẵn trong ống nghiệm vào
các primer theo nguyên tắc bổ sung, từ đó làm cho đoạn mồi dài ra và hình thành

nên một mạch đơn mới bổ sung với mạch đơn cũ. Và một bản sao DNA mới đã
được hình thành. Như vậy, sau giai đoạn này ta có được hai phân tử DNA có cấu
trúc giống hệt như phân tử DNA ban đầu.
Cả ba giai đoạn biến tính, bắt cặp và kéo dài thuộc một chu kỳ của khuếch đại
DNA. Như vậy, sau mỗi chu kỳ khuếch đại thì từ một phân tử DNA ban đầu sẽ
thành 2 phân tử DNA giống hệt nhau, và sau 30 chu kỳ khuếch đại sẽ có khoảng
230 phân tử DNA giống hệt nhau (Khoảng 1 tỷ DNA). Như vậy khi số lượng
DNA trong mẫu là vài triệu thì chỉ sau 30 chu kỳ khuếch đại (Thời gian khoảng 2-
3 giờ) ta đã có hàng nghìn tỷ bản sao, lượng DNA này đủ để ta làm phản ứng cắt
cho giải trình tự chuỗi.
Hình minh họa giai đoạn kéo dài:


3.1.4, Kiểm tra & phát hiện sản phẩm khuếch đại (Amplicon) trên gel Agarose.
Sau khi đã thực hiện phản ứng PCR, ta điện di trên gel agarose 2%, mục đích chủ
yếu của bước này là xem có sản phẩm của PCR không và đánh giá kích thước của
sản phẩm khuếch đại có đúng là đoạn dài như ta đã biết (Có nghĩa là có bắt cặp
của primer và chiều dài của amplicon đúng cho HBV).
3.2, THỰC HIỆN PHẢN ỨNG CẮT (CLIP).
Về nguyên tắc của phản ứng này giống hệt phản ứng PCR (Cũng gồm có 3 bước:
Biến tính, bắt cặp và kéo dài). Tuy nhiên có một điểm khác biệt cực kỳ căn bản là
thành phần các Nu trong Clip buffer để khuếch đại ngoài A, T, G, C còn có thêm
dd Nucleotides. Như vậy trong ống nghiệm của phản ứng clip sẽ có các thành
phần sau:
DNA đích cần cho phản ứng clip
2 cặp mồi chuyên biệt.
A, C, G, T Deoxynucleotides Triphosphate
A, C, G, T DiDeoxynucleotides Triphosphate
DNA Polymerase
Trong giai đoạn kéo dài của phản ứng clip (Giống giai đoạn kéo dài của phản ứng

PCR), lúc các Nu dưới tác động của men Polymerase gắn vào cặp mồi sẽ có sự
gắn ngẫu nhiên của các dd Nucleotides, khi đó thì sự kéo dài sẽ lập tức ngừng lại ở
vị trí đó (Là vị trí ta đã biết). Ví dụ ở ống cho vào A DiDeoxynucleotides
Triphosphate thì sự kéo dài sẽ dừng lại ở vị trí A, như vậy sau phản ứng Clip ta sẽ
có các phân tử dài ngắn khác nhau mà có đuôi tận cùng là Adenine. Khi điện di
trong gel có độ ly giải cao (Có thể phân biệt sự dài ngắn khác nhau chỉ 1 Nu) ta sẽ
có các trình tự của Nu, dựa vào phần mềm của máy sẽ cho ra được trình tự chuỗi
của DNA HBV. So sánh trên thư viện gen của máy tính se cho ta biết kiểu gen của
vi rút này là kiểu gen nào và các đột biến đã được công bố của HBV (Bao gồm các
đột biến kháng thuốc).

HỆ THỐNG GIẢI TRÌNH TỰ CHUỖI TRUGENE


ĐIỆN DI RA CÁC VẠCH DÀI NGẮN KHÁC NHAU



HÌNH MINH HỌA CỦA CÁC ĐOẠN DNA VỚI SỰ NGƯNG KÉO DÀI Ở VỊ
TRÍ ADENINE. TỪ ĐÓ TA BIẾT TRÌNH TỰ TRONG CHUỖI DNA CỦA
ADENINE. TƯƠNG TỰ TA BIẾT TRÌNH TỰ CHUỖI CỦA T, G, C


KẾT QUẢ TRÌNH TỰ CHUỖI CÓ ĐƯỢC SAU KHI KẾT HỢP CẢ 2 CHIỀU
ĐIỆN DI, TỪ KẾT QUẢ NÀY SẼ ĐƯỢC SO VỚI THƯ VIỆN GEN CỦA MÁY
ĐỂ CÓ KIỂU GEN VÀ CÁC ĐỘT BIẾN



III, VAI TRÒ CỦA KIỂU GEN VI RÚT B.

Không giống như kiểu gen của vi rút viêm gan C, vai trò của kiểu gen vi rút viêm
gan B cho đến nay vẫn chưa được biết rõ ràng. Nhiều câu hỏi về vai trò của kiểu
gen HBV đã được đặt ra và các nhà chuyên môn vẫn đang cố gắng để trả lời:
(1) Có hay không sự liên quan giữa kiểu gen HBV và khả năng nhân đôi của vi
rút, hoạt tính của bệnh gan, sự khỏi bệnh, và đáp ứng với điệu trị.
(2) Kiểu gen nào chủ yếu ở các nước. Sự phân bố kiểu gen HBV theo các
vùng địa lý có liên quan với dịch tể nhiễm HBV.
(3) Anh hưởng của kiểu gen HBV trong diễn tiến đến viêm gan B mạn tính.
(4) Khi nhiễm với một kiểu gen này thì có được bảo vệ khỏi nhiễm với kiểu gen
khác không.
Cho đến hiện nay, các nghiên cứu về kiểu gen HBV vẫn còn rải rác, số liệu không
được nhiều cũng như các kết quả chưa được thống nhất hoàn toàn.
Kiểu gen HBV ở vùng Đông Nam Á, trong đó có Việt Nam, chủ yếu là kiểu gen B
và C. Có nhiều nghiên cứu cho thấy có mối liên quan giữa kiểu gen HBV và các
đột biến ở vùng Precore và Core Promoter: Kiểu gen B, C và D thường có đột biến
hơn kiểu gen A.
Về độ thanh thải HBeAg và kiểu gen HBV, các nghiên cứu trên bệnh nhân Châu Á
cho thấy ở kiểu gen B có sự thanh thải HBeAg cao hơn so với kiểu gen C.
Mối quan hệ giữa kiểu gen vi rút viêm gan B và diễn tiến của bệnh cũng được
nhiều nhà nghiên cứu quan tâm. Rối loạn chức năng gan hình như ít gặp ở kiểu
gen B so với kiểu gen C, và kiểu gen C thì thường gặp ở bệnh nhân xơ gan.
Vai trò của kiểu gen HBV và đáp ứng điều trị cũng được quan tâm. Trong điều trị
với Interferon, kiểu gen A có đáp ứng điều trị tốt nhất, kiểu gen B có đáp ứng điều
trị tốt hơn kiểu gen C. Đối với Lamivudine, kiểu gen B dễ phát triển kháng thuốc
hơn.
IV, CÁC ĐỘT BIẾN CỦA VI RÚT B
Hơn một thập kỷ nay, nhiều kiểu đột biến của HBV đã được nhận diện. Đa số các
đột biến này là thầm lặng hoặc không có một ý nghĩa lâm sàng nào, tuy nhiên có
một số đột biến có ý nghĩa trong quá trình diễn tiến của bệnh từ việc tiêm chủng
phòng ngừa (S escape mutants), diễn tiến tự nhiên của bệnh (Pre-core, Core

promoter, Core mutations), đến đột biến gây kháng thuốc đặc trị (DNA
Polymerase mutations) và đột biến liên quan đến ung thư tế bào gan (X mutants).
1, Đột biến trên gen S (S mutants): Một số đột biến trên gen S có ý nghĩa là đột
biến “thoát”, ví dụ như đột biến G145A, làm cho việc tiêm ngừa không có hiệu
quả và bệnh nhân vẫn nhiễm bệnh.
2, Đột biến vùng trước lõi (Pre-core) và Core promoter: Đột biến hay gặp là đột
biến Pre core (G1896A), từ đó làm không tạo ra HBeAg cho nên dù tình trạng vi
rút đang tăng sinh nhưng HBeAg (-) và chỉ có thể đánh giá tình trạng vi rút tăng
sinh qua xét nghiệm tìm HBVDNA.
3, Đột biến vùng DNA Polymerase: Đột biến vùng này càng ngày càng được quan
tâm, lý do vùng này là đích tác động của thuốc Lamivudine (Là thuốc uống được
lựa chọn đầu tiên trong điều trị HBV). Đột biến kháng Lamivudine hay được gọi
dưới tên là YMDD.
Nhóm Các đột biến trên vùng Polymerase
1 rtL180 và rtM204V
2 rtM204I
3 rtL80V/I và rtM204I
4 rtL180M và rtM204I
5 rtV173L, rtL180M và rtM204V
6 rtL180M và rtM204S
Bảng các kiểu của đột biến kháng Lamivudine .
Khi kết quả có đột biến thì người BS sẽ biết bệnh nhân này có kháng với thuốc
nào và cần phải thay đổi chế độ thuốc cho bệnh nhân ra sao để từ đó đạt kết quả
điều trị được tốt nhất.
4, Đột biến trên gen X (HBX): Dữ liệu về đột biến cũng như vai trò của các đột
biến này cho đến nay vẫn còn hạn chế, tuy nhiên những kết quả nghiên cứu bước
đầu cho thấy các đột biến này có liên quan đến ung thư tế bào gan.
Với việc thực hiện kỹ thuật giải trình tự chuỗi trên hệ thống Trugene, sau khi có
trình tự chuỗi thì máy sẽ tự động so sánh trình tự chuỗi của mẫu với thư viện gen
có sẵn trong máy, từ đó phần mềm sẽ tính cho ta biết kiểu gen của mẫu là gì với

độ tương đồng là bao nhiêu so với gen gốc, và các đột biến đã được công bố của
HBV. Nhờ việc thực hiện xét nghiệm này, cho đến nay chúng ta có thể nói đã giải
quyết cơ bản những xét nghiệm cần thiết trong vấn đề chẩn đoán và điều trị HBV
Nhờ các kỹ thuật sinh học phân tử mà cho đến nay người bác sĩ có thể đánh giá và
biết chi tiết, toàn diện vi rút viêm gan B ở mỗi người bệnh nhân để từ đó có một
phác đồ điều trị tối ưu. Tuy nhiên, cuộc chiến chống lại vi rút viêm gan B vẫn
chưa có hồi kết, HBV cũng như mọi vi rút nói chung luôn luôn biến đổi cấu trúc di
truyền của nó để tránh được tác động của các thuốc đặc trị.