Li Cm n
hoàn thành khóa lun tt nghip này, bên cnh s c gng ca bn thân, em
đã nhn đc s hng dn vƠ giúp đ nhit tình ca thy cô, gia đình, bn bè.
Li đu tiên, con xin cm n ba m và các anh ch đã luôn bên cnh ng h
tinh thn, tip sc cho con trong nhng lúc khó khn, luôn to mi điu kin tt
nht đ con an tâm thc tp.
Em xin chân thành cm n thy cô trong Khoa Công ngh Sinh hc, trng i
hc M Thành ph H Chí Minh đã truyn đt nhng kin thc nn tng vô cùng
quý giá, to tin đ đ em tip tc hc tp, nghiên cu. Em xin gi li cm n chơn
thành nht đn thy Nguyn Thanh Thun, thy Nguyn Vn Minh, cô Dng Nht
Linh, cm n thy cô luôn bên cnh đnh hng truyn đt kinh nghim, đng viên
em hoƠn thƠnh đ tài.
Em xin cm n thy an Duy Pháp, ch Võ Ngc Yn Nhi, ch Nguyn Th M
Linh, anh Hà Ch Linh và các anh, ch, các bn, các em phòng vi sinh đã ng h,
giúp đ em trong sut thi gian em thc hin đ tài.
Cui cùng em xin chân thành cm n nhng ngi thơn đã luôn bên cnh ng h
em v mi mt và là ngun đng viên tinh thn rt ln đ em có th yên tâm thc
hin đ tài.
Em xin chân thành cm n.
Sinh viên thc hin
Lê Th Ho
Tháng 5/2014
BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP
SVTH: LÊ TH HO
DANH MC CH VIT TT
CFU Colony Forming Unit
đ m đc
H Gi
IAA Indole Acetic Acid
MS Minimal Salt
NA Nutrient Agar
NB Nutrient Broth
OD Optical Density
ppm Parts per milion
TSA Tryticase Soy Agar
TSB Tryticase Soy Brot
BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP
SVTH: LÊ TH HO
DANH MC BNG
Bng 2.1 Xây dng đng chun phospho 21
Bng 2.2 Xây dng đng chun IAA 23
Bng 3.1 Kt qu quan sát đi th ca các chng đc phân lp 35
Bng 3.2 Kt qu quan sát vi th 37
Bng 3.3 Kt qu đnh lng phân gii lân ca các chng 41
Bng 3.4 Kt qu đnh lng sinh IAA ca các chng 44
Bng 3.5 Kt qu kho sát phn trm c ch 46
Bng 3.6 Kt qu quan sát đi th, vi th ca 2 chng vi khun phân lp t phân
Dasvila. 48
Bng 3.7 Kt qu đnh danh 2 chng vi khun phân lp t phân Dasvila 48
Bng 3.8 Kt qu đnh lng kh nng sinh IAA ca chng DV2 50
Bng 3.9 Tng hp các chng có kh nng kích thích tng trng cây trng 51
Bng 3.10 Kt qu đnh danh sinh hóa ca vi khun thuc nhóm Azotobacter 53
Bng 3.11 Kt qu đnh danh sinh hóa ca vi khun thuc Bacillus 54
Bng 3.12 Kt qu chiu dài r, thân lúa, trng lng ti, trng lng khô 58
Bng 1 Giá tr OD ca đ th đng chun phospho 78
Bng 2 Kt qu OD
600nm
xác đnh phospho trong dch nuôi cy 78
Bng 3 Giá tr OD ca đ th đng chun IAA 79
Bng 4 Kt qu OD
530nm
xác đnh IAA trong dch nuôi cy 80
Bng 5 Kt qu OD
530nm
xác đnh IAA trong dch nuôi cy 87
Bng 6 Kt qu đo chiu dài r ca các nghim thc 88
Bng 7 Kt qu đo chiu dài thân ca các nghim thc 90
Bng 8 Kt qu cân trng lng ti ca các nghim thc 92
Bng 9 Kt qu cân trng lng khô ca các nghim thc 94
BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP
SVTH: LÊ TH HO
DANH MCăSă
S đ 2.1 B trí thí nghim 19
S đ 2.2 Quy trình đnh lng phospho 22
S đ 2.3 Quy trình đnh lng IAA 24
DANH MC BIUă
Biu đ 3.1 th biu din nng đ phospho tan dch nuôi cy các chng 42
Biu đ 3.2 th biu din nng đ IAA trong dch nuôi cy các chng 45
47
Biu đ 3.3 th biu din phn trm c ch nm bnh ca 2 chng V5 và D5 47
Biu đ 3.4 So sánh hƠm lng IAA sinh ra ca chng DV2 so vi các chng vi
khun ni sinh 50
Biu đ 3.5 th chiu dài r ca các nghim thc 58
Biu đ 3.6 th biu din chiu dài thân ca các nghim thc 59
Biu đ 3.7 th biu din trng lng ti ca các nghim thc 59
Biu đ 3.8 th biu din trng lng khô ca các nghim thc 60
Biu đ 3.9 đ th biu din hiu qu kích thích tng trng GPE (%) 60
Biu đ 1 th tng quan gia mt đ quang và nng đ phospho chun. 78
Biu đ 2 th tng quan gia mt đ quang và nng đ IAA chun. 79
BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP
SVTH: LÊ TH HO
DANH MC HÌNH NH
Hình 1.1 Cu trúc phân t ca IAA và tryptophan 10
Hình 1.2 Hình thái Bacillus 12
Hình 1.3 Hình thái Azotobacter trên môi trng vô đm và t bào vi khun
Azotobacter 15
Hình 3.1 Hình đi th ca mt s chng vi khun trên môi trng NA 36
Hình 3.2 Phân lp vi khun ni sinh trên môi trng TSA (A) vƠ đa đi chng
cha nc ra mu cui cùng (B) 37
Hình 3.3 Mt s hình nh quan sát vi th mt s chng phân lp đc (X100) 39
Hình 3.4 Kh nng phát trin ca vi khun V18, B3, V7, B5, V3, D1 trên môi
trng vô đm 39
Hình 3.5 Kh nng phơn gii lân ca vi khun trên môi trng Pikovskaya 40
Hình 3.6 Phn ng màu phospho hòa tan ca các chng 42
Hình 3.7 Phn ng màu gia thuc th FeCl
3
-H
2
SO
4
và IAA sinh ra bi vi khun 45
Hình 3.8 Th nghim kép và kho sát phn trm c ch nm Rhizoctonia sp. ca
chng D5 47
Hình 3.9 Sn phm phân Dasvila và phân lp chng vi khun t phân. 49
Hình 3.10 Hình nh vi khun DV2 và DV1 phát trin trên môi trng vô đm
Ashby 49
Hình 3.11 Hình nh kh nng sinh IAA ca chng DV2 lp li 3 ln 51
Hình 3.12 Kt qu th kh nng tng thích gia các chng vi khun đc la chn
55
Hình 3.13 Ht lúa ny mm trên đa agar 56
Hình 3.14 Ht lúa ny mm đc ngâm trong dch khun tng ng vi tng
nghim thc 56
Hình 3.15 Giai đon lúa phát trin đc 3 ngày, 7 ngày, 19 ngày sau khi gieo 57
Hình 3.16 Chiu dài r gia các nghim thc 61
Hình 3.17 Chiu cao thân gia các nghim thc 61
Hình 1 Kh nng lên men đng glucose ca vi khun 85
Hình 2 Phn ng VP Hình 3 Phn ng citrat 85
Hình 4 Kh nng phơn gii tinh bt Hình 5 Kh nng di đng 85
BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP
SVTH: LÊ TH HO
Hình 6 Th nghim catalase Hình 7 Th nghim oxidase 86
Hình 8 Phn ng nitrat Hình 9 Phn ng Indol 86
BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP
SVTH: LÊ TH HO
MC LC
PHN 1: TNG QUAN TÀI LIU 3
1.1 VI KHUN NI SINH 4
1.1.1 S lc v vi khun ni sinh 4
1.1.2 Tình hình nghiên cu trong nc 5
1.1.3 Tình hình nghiên cu trên th gii 6
1.2 S C NHăNITăPHÂN T CA VI KHUN 6
1.2.1 Quá trình c đnh nit phơn t 6
1.2.2 C ch quá trình c đnh nit phơn t 7
1.3 VI KHUN HÒA TAN LÂN 8
1.3.1 Vai trò ca lơn đi vi cây trng 8
1.3.2 Vi sinh vt hòa tan lân hu c 8
1.3.3 Vi sinh vt hòa tan lơn vô c 8
1.4 VI KHUN SINH IAA 9
1.5 BNH KHÔ VN TRÊN LÚA DO NM BNH Rhizoctonia sp.
GÂY RA 10
1.5.1 Triu chng 10
1.5.2 c đim phát sinh phát trin 11
1.6 VI KHUN Bacillus 12
1.7 VI KHUN Azotobacter 14
PHN 2: VT LIUăVẨăPHNGăPHÁPăNGHIểNăCU 16
2.1 THIăGIANăVẨăAăIM NGHIÊN CU 17
2.2 VT LIU 17
2.3 THIT B, DNG C,ăMỌIăTRNG 17
2.3.1 Thit b 17
2.3.2 Dng c 17
2.3.3 Môi trng 17
2.3.4 Thuc th 18
2.4 PHNGăPHÁPăTHC HIN 19
BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP
SVTH: LÊ TH HO
2.4.1 B trí thí nghim 19
2.4.2 Phng pháp phơn lp 20
2.4.3 nh tính kh nng sinh NH
3
ca vi khun 20
2.4.4 Xác đnh kh nng hòa tan lơn 21
2.4.5 Xác đnh kh nng sinh IAA 23
2.4.6 Th kh nng đi kháng nm bnh và kho sát phn trm c ch 25
2.4.7 nh danh chng đc la chn 26
2.4.8 Thí nghim th kh nng tng thích gia các chng đc la chn . 31
2.4.9 Thí nghim trng lúa 32
PHN 3: KT QU NGHIÊN CU VÀ THO LUN 34
3.1 KT QU QUANăSÁTăI TH 35
3.2 KT QU QUAN SÁT VI TH 37
3.3 KH NNGăC NHăNITăPHỂNăT 39
3.4 KH NNGăHọAăTANăLỂN 40
3.4.1 nh tính kh nng hòa tan lơn 40
3.4.2 nh lng kh nng phơn gii lân ca các chng 40
3.5 KH NNGăSINHăIAA 43
3.6 KT QU KIM TRA KH NNGăI KHÁNG NM 46
3.7 KT QU PHÂN LP,ăXÁCăNH HOT TÍNH KÍCH THÍCH
TNGăTR
NG THC VT CA VI KHUN TRONG PHÂN VI SINH
DASVILA 48
3.7.1 Kt qu quan sát đi th, vi th, đnh danh 48
3.7.2 Kt qu kho sát kh nng c đnh đm 49
3.7.3 Kt qu kho sát kh nng sinh IAA t 2 chng vi khun phân lp t
phân Dasvila 49
3.8 KT QU NH DANH MT S CHNG VI KHUNăC
LA CHN 51
3.8.1 Kt qu đnh danh s b 53
3.8.2 Kt qu đnh danh chng dng trc, Gram (-), không bào t 53
3.8.3 Chng dng trc, Gram (+), có bào t 54
BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP
SVTH: LÊ TH HO
3.9 KT QU TH KH NNGăTNGăTHệCHăGIA CÁC CHNG
VI KHUNăC LA CHN 55
3.10 KT QU TRNG LÚA 55
3.10.1 Chn ging, m ht ging ny mm, tin hành trng lúa 55
3.10.2 Kt qu mt s đc tính nông hc 57
PHN 4: KT LUNăVẨă NGH 65
4.1 KT LUN 66
4.2 NGH 66
BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP
SVTH: LÊ TH HO 1
T VNă
Lúa (Oryza sativa L.), thuc h Hòa Bn lƠ cơy ng cc quan trng nht trong
s phát trin th gii vƠ lƠ lng thc chính ca hn na dân s th gii
(FAOSTAT: ). Ngày nay, Thái Lan và Vit Nam lƠ hai nc
xut go hƠng đu trong th trng lúa go th gii. Theo FAOSTAT, tng sn
lng lúa go nm 2012 ca Vit Nam là 43.661.569,64 tn (FAOSTAT:
).
Có nhiu phng pháp đ tng nng sut cng nh kim soát nm gây bnh,
trong đó có bin pháp s dng hóa cht nông nghip. Phân bón và thuc hóa hc
ngƠy cƠng đc nông dơn a chung và s dng đn mc d tha. iu này chng
nhng làm tiêu tn tin bc mà còn gây tác hi đn đt trng, ngun nc, làm
cho môi trng b ô nhim vƠ đc bit, nh hng trc tip đn cuc sng con
ngi cng nh nhng sinh vt sng trong môi trng. S dng phơn bón vi sinh đ
thay th cho phân bón hóa hc là vn đ đang quan tâm và chú ý vì phân bón vi sinh
không nhng giúp nơng cao nng sut cây trng mà còn thân thin vi môi trng
(Nguyn Th Hunh Nh và cs., 2013).
Mt s nghiên cu cho thy rng, vi khun ni sinh phân lp t đt trng hoc r
cây lúa có kh nng thúc đy tng trng bng kh nng c đnh nit t do, hòa tan
lân, sinh hormon tng trng nh acit indol acetic (IAA)… vƠ c ch các bnh trên
cây trng (Cao Ngc ip và cs., 2009; Verma và cs., 2011; Wang và cs., 2009).
Kích thích tng trng thc vt do vi sinh vt có th thông qua c ch trc tip và
gián tip. Kích thích trc tip là cung cp cht dinh dng thông qua các c ch nh
c đnh nit phơn t, hòa tan lân và các cht dinh dng khác, đng thi sn sinh
các hormon IAA, axit gibberellic, cytokinin. Kích thích gián tip mà các vi sinh vt
có li c ch các vi sinh vt gây bnh có hi cho s tng trng và phát trin ca
thc vt (Raddadi và cs., 2008), đng thi tng kh nng đi kháng nm bnh cho
cây trng.
BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP
SVTH: LÊ TH HO 2
Da trên c s li ích ca vi sinh vt ni sinh, chúng tôi mong mun thc hin đ
tài: ”SƠng lc vi sinh vt ni sinh cây lúa có hot tính kích thích tng trng cây
trng và kháng nm Rhizoctonia sp. gây bnh trên cây lúa.” ti tnh Bình Dng,
ng Nai, Vng TƠu nhm sàng lc chng có hot tính cao đa vƠo sn xut phân
sinh hc chuyên dùng cho cơy lúa giúp tng kh nng c đnh đm cho cây, kích
thích tng trng, tng nhng tính nng tt nh hòa tan lơn khó tan, tng hp nhiu
kích thích t thc vt, kháng nm và góp phn phát trin nn nông nghip bn vng.
Mc tiêu tng quát:
Phân lp vi khun ni sinh cây lúa nhm sàng lc chng có kh nng c đnh nit
phân t, hòa tan lân, sinh IAA và kháng nm có kh nng kích thích tng trng
cây trng.
Ni dung thc hin
Phơn lp vƠ sƠng lc vi khun ni sinh cơy lúa có kh nng c đnh nit phơn
t, hòa tan lơn, sinh IAA, kháng nm Rhizoctonia sp. gơy bnh trên cây lúa.
Phơn lp vƠ đnh danh s b các chng vi khun t sn phm phơn vi sinh
thng mi. So sánh các chng nƠy vi các chng tuyn chn đc t cơy
lúa da trên kh nng c đnh đm vƠ sinh IAA.
nh danh chng có hot tính cao.
Thí nghim thc t.
BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP
SVTH: LÊ TH HO 3
PHNă1:
TNG QUAN TÀI LIU
BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP
SVTH: LÊ TH HO 4
1.1 VI KHUN NI SINH
1.1.1 S lc v vi khun ni sinh
Thut ng vi sinh vt ni sinh bao gm tt c các sinh vt có toàn b hoc mt
phn thi gian chu k sng ca chúng bên trong mô thc vt mà không to ra bt k
triu chng nào (Khan, 2007).
Cơy thng xuyên tham gia vƠo tng tác vi mt lot các vi khun. Vùng r là
ni tip giáp gia r thc vt vƠ đt, lƠ ni lng đng các cht hu c, vƠ lƠ ni xut
phát ca các môi trng sng và các ngun sng khác nhau cho các vi sinh vt đt.
Thc vt có th thay đi vùng r ca chúng nh s hp thu các cht dinh dng, đ
m và oxy t vùng r; và các cht do r tit ra (El-Shatnawi và cs., 2001). Vùng r
lƠ ni xut phát nhiu vi khun ni sinh chui vào r, thơn, lá đ sng ni sinh; sau
khi xâm nhp vào cây ch có th tp trung ti v trí xâm nhp hoc di chuyn đi
khp ni trong cơy đn các h mch ca r, thân, lá, hoa (Zinniel và cs., 2006), thúc
đy các quá trình chuyn hóa trong cây, s phát trin lông r mt cách mnh m và
gim s kéo dài r (Harari và cs., 1988).
Vi khun ni sinh thúc đy thc vt tng trng, tng nng sut vƠ đóng vai trò lƠ
mt tác nhơn điu hòa sinh hc (Ryan và cs., 2007). Vi khun ni sinh không gây
hi cho cây ch cng nh cu trúc bên ngoài ca thc vt, đc phân lp t hoa, trái
cây, lá, thân, r và ht ging loài thc vt khác nhau (Ahmad và cs., 2006), hu ht
chúng đu có kh nng c đnh đm nh: Azospirillum, Gluconacetobacter
diazotrophicus, Herbaspirillum, Klebsiella, Azoarcus, Enterobacter, Burkholderia,
Pseudomonas, Azotobacter (Phm Th Khánh Vân và cs.). Chúng thng có kh
nng tng hp kích thích t auxin (Barbieri và cs., 1986), giúp loi b các cht gây
ô nhim môi trng (Kobayashi và cs., 2000), tng hƠm lng các cht khoáng,
tng kh nng kháng bnh (Fahey và cs., 1991), hòa tan lân khó tan cho cây trng
hp th tt cht dinh dng (Lng Ngc Du và cs., 2007). Vi khun ni sinh sn
xut hƠng lot các sn phm t nhiên có li cho thc vt kỦ ch mƠ ta có th khai
thác nhng tác nhơn đó đ ng dng trong y hc, nông nghip hay công nghip.
NgoƠi ra nó còn có tim nng loi b các cht gơy ô nhim trong đt bng cách tng
cng kh nng kh đc trên thc vt vƠ lƠm cho đt tr nên mƠu m thông qua
BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP
SVTH: LÊ TH HO 5
vic phơn gii lơn vƠ c đnh đm. NgƠy cƠng có nhiu quan tơm trong vic phát
trin các ng dng tim nng công ngh sinh hc ca vi khun ni sinh đ phát trin
các ging cơy trng có kh nng kh đc đng thi có kh nng sn xut sinh khi
vƠ nhiên liu sinh hc (Ryan và cs., 2007).
1.1.2 Tình hình nghiên cu trong nc
nc ta, vic nghiên cu các vi khun ni sinh có kh nng c đnh đm, hòa
tan lân, tng hp kích thích t IAA các cây nông nghip đã đc tin hành khá
nhiu trong nhng nm gn đơy. Ti vin nghiên cu và phát trin sinh hc ậi
hc Cn Th, Nguyn Th Hunh Nh và cs. (2013) phân lp các dòng vi khun ni
sinh có kh nng tng hp IAA và c đnh đm trên cy chui; Nghiên cu ca
Lng Th Hng Hip và cs. (2011) phân lp và nhn din vi khun ni sinh trong
cây Cúc Xuyên Chi. Nguyn Hu Hip và cs. (2008) đã phân lp các dòng vi khun
ni sinh đ sn xut phân bón quy mô phòng thí nghim cho cây mía ti tnh Sóc
Trng.
Phm Th Khánh Vân và cs. phát hin vi khun Azospirillum lipoferum ni sinh
trong cơy lúa mùa đc sn (Oryza sativa L.) trng vùng đng bng sông Cu
Long. Nghiên cu ca Nguyn Th Ngc Bích, Cao Ngc ip (2009) nhn din vi
khun nt r ni sinh trong cây lúa bng k thut PCR- ARDRA IGS, kt qu cho
thy rng các dòng vi khun nt r, không phân bit là lên nhanh hay lên chm, đu
có th ni sinh cây không phi thuc h đu nh cơy lúa. Khi vi khun nt r ni
sinh cây lúa cao sn cho thy tính tích cc nh gia tng nng sut lúa, rm lúa vƠ
đc bit lƠ gia tng hƠm lng nit trong lá lúa t s ng dng k thut 15N đng
v thông qua s tích ly nit t s c đnh nit sinh hc. Vi khun nt r còn giúp
cây lúa hp thu nhiu lân, kali và st so vi cây không b sung vi khun nt r.
ng thi vi nhng thí nghim chng minh các dòng vi khun nt r này tng hp
và phóng thích các cht sinh trng giúp cho cây m cng cáp đn khi cây lúa
trng thành vi nhng hp cht IAA và c đnh đm sinh hc.
BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP
SVTH: LÊ TH HO 6
1.1.3 Tình hình nghiên cu trên th gii
Nm 2002, Lodewyck và cs. nêu lên phng pháp phơn lp và mô t đc đim vi
khun ni sinh t các loài thc vt khác nhau. Rosenblueth và cs. (2006) đã công b
mt danh sách toàn din ca vi khun ni sinh đc phân lp t mt lot các b
phn ca cây. Nm 2002, Zinniel và cs. đã phơn lp vi khun ni sinh t cây c.
Theo nghiên cu ca Fahey và cs. (1991) cho thy rng vi khun ni sinh có kh
nng kim soát sinh hc. Nhiu nghiên cu ca Sturz và Matheson (1996), Duijff và
cs., (1997), Krishnamurthy và Gnanamanickam (1997) đã ch ra rng vi khun ni
sinh có kh nng kim soát đc mm bnh trên thc vt; nghiên cu ca Azevedo
và cs., (2000), vi khun ni sinh có kh nng kim soát đc mm bnh côn trùng
và nghiên cu ca Hallmann và cs. (1997, 1998) cng
đã ch ra rng vi khun ni
sinh có kh nng kim soát đc mm bnh c tuyn trùng. Nghiên cu ca
Chanway, (1997) ch ra trong mt s trng hp chúng có th đy mnh tc đ ny
mm ca ht, thúc đy s hình thƠnh cơy con trong điu kin bt li và nâng cao
kh nng tng trng ca thc vt. Vi khun ni sinh còn có th ngn chn mm
bnh phát trin bng cách tng hp các cht ni sinh trung gian, qua đó đ tip tc
tng hp các cht chuyn hóa và các hp cht hu c mi.
Nghiên cu ca Sun và cs. (2008), v s đa dng ca vi khun ni sinh vùng r
lúa bng k thut phân tích trình t 16S rDNA. Nhiu tác gi cng phát hin mi
quan h gia vi khun nt r và cây lúa, chúng xâm nhim vào r lúa theo nghiên
cu ca Terouchi và Syono, 1990 nghiên cu ca Plazinski và cs. 1985 đã cho thy
s hình thành nt gi (cu trúc nh nt r) cây lúa. Thí nghim nghiên cu ca
Biswas và cs. (2000a), chng vi khun nt r cho cơy lúa lƠm gia tng lng quang
hp, lng sinh khi, lng nit trong lá vƠ cui cùng lƠ nng sut ht tng so vi
đi chng.
1.2 S C NHăNITăPHỂNăT CA VI KHUN
1.2.1 Quá trình c đnh nit phân t
Mt trong nhng quá trình vi sinh vt hc có Ủ ngha ln đi vi nông nghip là
quá trình c đnh nit phơn t. Trong khong không khí trên mi hecta đt có ti
80.000 tn nit nhng ngi, gia súc và cây trng đu không có kh nng s dng
BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP
SVTH: LÊ TH HO 7
đc nit dng phân t này. Cây trng trên toƠn trái đt mi nm s dng khong
100-110 triu tn nit, trong khi đó phơn đm hóa hc ca tt c các nc trên th
gii ch b sung khong 30 % s lng nit b ly đi. Mun phá v ba liên kt trong
phân t nit (N=N) đ d to ra các loi phân hóa hc, cn phi s dng các điu
kin k thut rt phc tp (nhit đ cao, áp sut cao, cht xúc tác đt tin) (Bch
Lan Phng, 2011).
1.2.2 C ch quá trình c đnh nit phân t
C đnh đm sinh hc là quá trình kh N
2
thành NH
3
di s xúc tác ca h
enzym nitrogenase. Sau đó, NH
3
có th kt hp vi các acid hu c đ to thành
protein. Trong không khí, N
2
dng rt bn và s lng rt phong phú, chim 78,16
% theo th tích và 75,5 % theo khi lng. Cây trng cng nh các loƠi đng vt và
ngi không có kh nng đng hóa trc tip ngun N
2
t do t không khí. Quá trình
c đnh đm xy ra trong t bào vi khun và vi khun lam đu ging nhau là nh
chúng có h thng gen nif (ni là ch vit tt ca nitrogen-nit vƠ f lƠ fixing-c đnh)
điu khin quá trình tng hp enzym nitrogenase. Nitrogenase là h enzym xúc tác
cho phn ng kh N
2
thành NH
3
. Nh vy, h thng gen nif đc xem là h thng
gen điu khin cho quá trình c đnh đm sinh hc (Bch Lan Phng, 2011).
Ngày nay nhiu nhà nghiên cu khoa hc đã chng minh NH
3
va là sn phm
ca quá trình c đnh nit phơn t va là nhân t điu hoà hot tính ca enzym
nitrogenase. Khi NH
3
tích ly đn mt nng đ nht đnh thì nó lƠm đình ch tc
khc hot đng ca nitrogenase. Kiu điu hoƠ nh vy gi lƠ “iu hoà liên h
ngc”. Tuy nhiên NH
3
không tham gia điu hoà trc tip mà thông qua mt
protein khác là enzym glutamin synthetase. Khi môi trng có nhiu NH
3
thì enzym
này b adenin hoá nên trng thái bt hot. Ngc li môi trng vi nng đ NH
3
thp hoc không có thì không b adenin hoá và enzym s dng hot đng. Khi
trng thái hot đng nó s hot hóa h gen chu trách nhim tng hp nitrogenase
(Bch Lan Phng, 2011).
BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP
SVTH: LÊ TH HO 8
1.3 VI KHUN HÒA TAN LÂN
1.3.1 Vai trò ca lân đi vi cây trng
Lân gi vai trò quan trng trong đi sng cây trng vì nó có thành phn ca
protit to nên nhân t bào, cn cho vic to ra các b phn mi cho cây, tham gia
tng hp acid amin. Nh vy lân gi vai trò rt quan trng trong đi sng ca t
bƠo. Khi cơy tng trng, hình thành nên nhiu t bào mi thì cn phi có thêm
nucleo-protit và cây phi hút thêm c đm ln lân. Nu trong đt có lân mà không
có đm cơy cng không phát trin đc.
Nhiu hp cht phc tp khác nhau tham gia vào quá trình hô hp và quang hp
ca cơy đu cha lân. Trong rt nhiu quá trình sinh hóa xy ra trong cây luôn có s
tham gia ca lân.
Vi sinh vt s bin đi lân thành dng mui ca acid phosphoric. Di dng này
mt phn đc cây s dng, mt phn đc c đnh di dng khó tan nh
Ca
3
(PO
4
)
2
. Nhng dng khó tan nƠy trong môi trng có pH thích hp s chuyn
hóa và bin thành dng d tan. Trong quá trình này vi sinh vt gi vai trò quan trng
(Bch Lan Phng, 2011).
1.3.2 Vi sinh vt hòa tan lân hu c
Vi sinh vt hòa tan lân hu c ch yu gm Bacillus và Pseudomonas. áng chú
ý là B. megaterium var phosphatsum có kh nng hòa tan lơn hu c cao, đng thi
B. megaterium còn có kh nng hình thƠnh bƠo t nên sc sng rt mnh.
Phân gii xác đng vt, thc vt acid nucleic, nucleotid, phospholipid, sn phm
phân gii cui cùng là H
3
PO
4
. Quá trình phân gii cn s tham gia ca nhiu nhóm
vi sinh vt thuc các ging Bacillus và Pseudomonas (Bch Lan Phng, 2011).
Quá trình có th biu din tng quát theo s đ sau:
Nucleoprotein nuclein acid nucleic nucleotide H
3
PO
4
.
Leucithin Glycero phosphat H
3
PO
4
.
1.3.3 Vi sinh vt hòa tan lân vô c
Nhiu vi khun nh Bacillus megaterium, Bacillus mycoides, Bacillus butyricus,
Pseudomonas fluorescens, có kh nng phơn gii Ca
3
(PO
4
)
2
và bt apatit. C ch
quá trình phân gii Ca
3
(PO
4
)
2
có liên quan mt thit đn s sn sinh acid trong quá
BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP
SVTH: LÊ TH HO 9
trình sng ca vi sinh vt. Tác dng vi mt trong bn loi acid: H
3
PO
4
, H
2
CO
3
,
HNO
3
, H
2
SO
4
, trong đó H
2
CO
3
rt quan trng. Chính H
2
CO
3
đã lƠm cho Ca
3
(PO
4
)
2
phân gii (Bch Lan Phng, 2011). Quá trình phân gii nh sau :
Ca
3
(PO
4
)
2
+ 4H
2
CO
3
+ H
2
O Ca(HPO
4
)
2
.H
2
O + Ca(HCO
3
)
2
1.4 VI KHUN SINH IAA
IAA là mt hormon quan trng đc sn xut bi mt s PGPR, có rt nhiu
nghiên cu đã chng minh rng khi cây trng đc x lý vi IAA do PGPR sn
xut s gia tng s phát trin. Vic vi khun Bacillus RC23, Paenibacillus
polymyxa RC05, B. subtilis OSU142, Bacillus RC03, Comamonas acidovorans
RC41, B. megaterium RC01, B. simplex RC19 vi trƠ đã lƠm gia tng t l r so vi
đi chng do vi khun có kh nng sinh IAA (Maheshwari K, 2011). Mt nghiên
cu khác cho thy Azospirillum không ch có kh nng c đnh đm mà còn có kh
nng sn xut IAA. Các chng Azospirillum đc nghiên cu cho thy rng sn
phm IAA ph thuc vƠo môi trng nuôi cy và tin cht tryptophan.
Cytokinins là mt nhóm hormon hin din vi lng rt nh trong sinh vt và
thng gơy khó khn cho vic phát hin vƠ đnh lng. Cytokinins đc sn xut
bi mt s vi khun nh Azospirillum và Pseudomonas spp. Ngoài ra, mt vài vi
khun PGPR đc báo cáo là có kh nng sn sinh cytokinins nh Rhizobium
leguminosarum, Paenibacillus polymyxa, Pseudomonas fluorescens (Maheshwari
K, 2011).
Trong mt vài nghiên cu, các PGPR nh R. phaseoli, A. lipoferum,
Azotospirillum brasilense, Acetobacter diazotropicus, Herbospirillum seropedicae,
Bacillus licheniformis, B. pumilus, Bacillus cereus MJ-1, Bacillus macroides CJ-29
đã đc báo cáo là có kh nng sn xut GAs, nhng điu nƠy cha đc chng
minh mt cách rõ ràng. Tuy nhiên, trong nhng nghiên cu gn đơy, Gutierrez-
Manero và cng s (2001) đã cung cp chng c v bn loi GAs đc sn xut bi
Bacillus pumilus và Bacillus licheniformis
BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP
SVTH: LÊ TH HO 10
Acid indoleacetic (IAA) Tryptophan (Trp)
Hình 1.1 Cu trúc phân t ca IAA và tryptophan ()
1.5 BNH KHÔ VN TRÊN LÚA DO NM BNH Rhizoctonia
sp. GÂY RA
1.5.1 Triu chng
Bnh khô vn gơy hi ch yu mt s b phn ca cơy nh b lá, phin lá vƠ c
bông. Các b lá sát mt nc hoc b lá giƠ di gc thng lƠ ni phát sinh bnh
đu tiên.
Vt bnh b lá lúc đu lƠ vt đm hình bu dc mƠu lc ti hoc xám nht, sau
lan rng ra thƠnh dng vt vn da h, dng đám mơy. Khi bnh nng, c b vƠ phn
lá phía trên b cht li.
Vt bnh lá tng t nh b lá, thng vt bnh lan rng ra rt nhanh chim
ht c b rng phin lá to ra tng mng vơn mơy hoc dng vt vn da h. Các lá
giƠ di hoc lá sát mt nc lƠ ni bnh phát sinh trc sau đó lan lên các lá
trên.
Vt bnh c bông thng lƠ vt kéo dƠi bao quanh c bông, hai đu vt bnh có
mƠu xám loang ra, phn gia vt bnh mƠu lc sm co tóp li.
Trên vt bnh các v trí gơy hi đu xut hin hch nm mƠu nơu, hình tròn dt
hoc hình bu dc nm ri rác hoc thƠnh tng đám nh trên vt bnh. Hch nm
rt d dƠng ri ra khi vt bnh vƠ ni trên mt nc rung (V Triu Mân, 2007).
BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP
SVTH: LÊ TH HO 11
1.5.2 c đim phát sinh phát trin
Bnh khô vn phát sinh mnh trong điu kin nhit đ cao vƠ đ m cao. Nhit
đ khong 24-32
o
C vƠ m đ bão hoƠ hoc lng ma cao thì bnh phát sinh phát
trin mnh, tc đ lơy lan nhanh. Bnh thng phát sinh trc tiên các b vƠ lá
giƠ sát mt nc hoc di gc. Tc đ lơy lan lên các lá phía trên ph thuc rt
nhiu vƠ thi tit ma nhiu, lng nc trên đng rung quá cao, đc bit các
rung nhiu nc, cy quá dƠy.
S phát trin ca bnh khô vn thi k đu t cơy m đn đ nhánh có mc đ
bnh ít. Giai đon đòng tr đn chín sáp lƠ thi k nhim bnh nng. min Bc
nc ta bnh khô vn gơy hi trong v mùa ln hn v đông xuơn.
S phát sinh phát trin ca bnh có liên quan nhiu ti ch đ nc trên đng
rung vƠ ch đ phơn bón. Bón phơn đm nhiu, bón đm mun thúc đòng bnh s
phát sinh phát trin mnh hn. Bón nhiu ln cng lƠm cho mc đ b bnh cao.
Bón Kali có tác dng lƠ gim mc đ nhim bnh ca cơy.
Ngun bnh ch yu lƠ hch nm tn ti trên đt rung vƠ si nm gc r vƠ
lá b bnh còn sót li sau thu hoch. Hch nm có th sng mt thi gian dƠi sau thu
hoch lúa thm chí trong điu kin ngp nc ngn hn vn có ti 30 % s hch gi
đc sc sng, ny mm thƠnh si vƠ xơm nhim gơy bnh cho v sau. Quá trình
xơm nhim lp li thng xy ra qua tip xúc gia hch vƠ b lá úa (V Triu Mân,
2007).
Ch s ca đt gơy bnh ln đu có liên quan mt thit vi s lng hch tip
xúc vi cơy, nhng s phát trin ca bnh sau khi tip xúc vi kỦ ch li chu nh
hng ln ca nhit đ, m đ vƠ tính mn cm ca cơy kỦ ch.
Phn ng ca các ging đu nm trong phm vi t nhim nm đn tng đi
chng chu. Cha có ging lúa nƠo th hin đc tính chng bnh cao. Ging lúa
Indica chng chu bnh tt hn ging lúa Japonica. nc ta, hu ht các ging lúa
đa phng vƠ ging nhp ni đu có mc đ nhim bnh khô vn t trung bình đn
nhim nm. Mt s ít các ging nh KV10, IR9965, IR50, IR17494, OM80, có
mc đ nhim bnh nh hn so vi các ging khác, lúa thun, lúa lai, (V Triu
Mân, 2007).
BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP
SVTH: LÊ TH HO 12
1.6 VI KHUN Bacillus
Theo Bergey's Manual of Systematic Bacteriology (Gibson T. và cs., 1975),
Bacillus phân loi nh sau:
Gii: Bacteria
Ngành: Firmicutes
Lp: Bacilli
B: Bacillales
H: Bacillaceae
Chi: Bacillus
Hình 1.2 Hình thái Bacillus ()
Bacillus hu ht lƠ các vi khun hình que, Gram dng, hiu khí, to ni bƠo t,
các t bƠo tn ti riêng l hay dính nhau thƠnh chui ngn. Ni bƠo t đc mô t
đu tiên bi Cohn khi nghiên cu v B. subtilis vƠ sau đó lƠ Koch trong các nghiên
cu v các loƠi gơy bnh nh B. anthracis vƠo nm 1976. S to thƠnh ni bƠo t
sau đó đc chp nhn nh lƠ mt đc tính cn bn đ phơn loi vƠ xác đnh các
thƠnh viên ca chi (Gibson và cs., 1975).
Tuy nhiên, cng có mt s loƠi Bacillus không to bƠo t nh B.
thermoamylovorans, B. halodenitrificans, mt s khác có Gram ơm hay Gram
dng yu nh B. thermosphaericus, B. horti, B. oleronius, B. azotoformans. Thêm
BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP
SVTH: LÊ TH HO 13
vƠo đó, khi phơn loi da vƠo gii trình t ADN - ARN, dng vi khun không to
bƠo t, k khí bt buc cng thuc nhóm Bacillus nh B. infernus.
T bƠo sinh dng Bacillus thng, có đu tròn hay vuông, kích thc t 0,5-
1,2x2,5-10 m, dng đn l hay chui ngn hoc dƠi. i vi Bacillus có ni bƠo
t thì bƠo t hình tr, oval, tròn, thnh thong có hình bu dc. Tùy theo loƠi, bƠo t
có th nm gia, gn cui hoc cui, vƠ túi bƠo t phng hoc không phng.
Tr B. anthracis và B. mycoides, hu ht các loƠi Bacillus đu di đng, mc dù có
s khác bit rt ln v kh nng di đng trong mi loƠi. a s các loài có catalase
dng tính (Nguyn c Qunh Nh vƠ cs, 2009; Nguyn Vn Thanh và cs.,
2009).
Phn ln các chi Bacillus phát trin tt trên các môi trng dinh dng thng
mi gm các thƠnh phn c bn nh: pepton, cao tht, glucose, lactose, cht
khoáng,…, mc dù trong mt s trng hp đc bit, các môi trng nƠy cn đc
điu chnh pH hoc nng đ mui (pH t 2 ậ 11, vƠ nng đ mui t di 2 ậ 25
%). Trong phòng thí nghim, di điu kin phát trin ti u, thi gian th h ca
Bacillus khong 25 phút. Trong môi trng nuôi cy lng chúng to váng trên b
mt. Trên môi trng thch to khun lc to, tròn hay hình dng bt thng, có mƠu
xám ng vƠng nht, b mt khóm sn sùi, hi nhn hoc to mƠng mn lan trên b
mt thch (Gibson và cs., 1975).
Hình dng khun lc thay đi tùy theo đ tui, vƠ các đa nuôi cy riêng l có th
to ra các dng khun lc khác nhau. B. larvae và B. popilliae trong môi trng
nuôi cy cn có thêm thiamine. Chúng thng phát trin trên môi trng J cha
trypton, glucose, dch chit nm men. B. pasteuri cn b sung 0,5 ậ 1 % urea vƠo tt
c môi trng nuôi cy. B. stearothermophilus phát trin trên môi trng dinh
dng có b sung calci vƠ st (Gibson và cs., 1975).
Phn ln các chng Bacillus a nhit trung tính. Các loƠi a nhit nh B.
stearothermophilus phát trin t 55 đn 70
o
C, thng lƠ khong 60
o
C. Các loài này
a nhit bt buc vƠ không th phát trin 37
o
C. LoƠi a nhit trung bình nh B.
coagulans phát trin tt ti 45 ậ 50
o
C. LoƠi gơy bnh cho côn trùng nh B. larvae
BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP
SVTH: LÊ TH HO 14
và B. popilliae phát trin nhit đ t 25-30
o
C. Tng t nh vy đi vi B.
thuringiensis và B. cereus (Gibson và cs., 1975).
1.7 VI KHUN Azotobacter
Vi khun Azotobacter đc phân lp ln đu tiên nm 1901 (M.W.Beijerrinck,
1901). ó lƠ loƠi Azotobacter chroococum. V sau ngi ta tìm thy nhiu loài khác
trong chi Azotobacter.
Vi khun thuc chi Azotobacter có t bào t hình cu đn hình que. Khi còn non
t bƠo thng có hình que vi kích thc khong 2,0-7,0 x 1,0-2,5 µm. ôi khi
chiu dƠi đt đn 10-12 µm. Di đng nh tiên mao mc quanh khp c th.
Trên môi trng không cha nit khun lc ca Azotobacter có dng nhy, li,
đôi khi nhn nheo. Khi nuôi cy lơu trên môi trng đc, khun lc có màu vàng
lc, màu hng hoc mƠu nơu đen (tùy loƠi Azotobacter) (Nguyn Lân Dng và cs.).
Quan sát kính hin vi khi t bào già, nhn thy Azotobacter đc bao bc bi
mt lp v nhy khá dày. V nhy cha khong 75 % là cht hidrit ca axit uronic
và ch cha khong 0,023 % nit.Theo khoá phân loi Bergey’s, Azotobacter ch
yu có 6 loài (Breed Robert và cs.):
- Azotobacter chroocuccum: khi còn non có kh nng di đng, không sinh sc
t.
- Azotobactera beijerincki: không di đng, không sinh sc t.
- Azotobacter paspali: khi còn non có kh nng di đng, khi giƠ có sc t mƠu
vƠng ti mƠu xanh lc, sinh sc t phát hunh quang.
- Azotobacter nigricans: không di đng, khi giƠ có sc t mƠu nơu đen, cho ti
mƠu tím đ.
- Azotobacter vinelandi: có kh nng di đng, sc t mƠu vƠng lc đn hunh
quang, khuych tán vƠo môi trng.
- Azotobacter armeniacus: có kh nng di đng, sc t mƠu nơu đen cho ti
mƠu tím đ.
Azotobacter thuc loi vi khun hiu khí nhng có th phát trin đc trong các
điu kin vi hiu khí. Nhit đ thích hp khong 26-30
o
C, pH thích hp nht đi
vi Azotobacter là 7,2 - 8,2.
BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP
SVTH: LÊ TH HO 15
Azotobacter thuc loi vi khun có kh nng chu đc nhng nng đ mui khá
cao, có th phát trin đc ngay c trong nhng môi trng cha 2,5-3 % NaCl.
Vi khun Azotobacter có kh nng t túc v các cht sinh trng khác nhau:
tiamin (vitamin B1), riboflavin (vitamin B2), xianocobalamin (vitamin B12), acid
pantotenic, acid folic, biotin, gibberellins.
Mt s nghiên cu còn xác đnh rng Azotobacter có kh nng tng hp ra mt
s cht kháng nm, kh nng nƠy không ging nhau các chng Azotobacter. Mt
s chng Azotobacter chroococcum có kh nng sinh ra mt s cht kháng nm có
ph tác dng khá rng c ch Aspergillus, Penicillium, Fusarium, Alternaria,…
S phát trin và c đnh nit ca Azotobacter trong đt chu nh hng mt thit
ca khu h vi sinh vt đt. Bên cnh nhng nhóm vi sinh vt có nh hng tt đi
vi s phát trin ca Azotobacter (tng hp các cht hot đng sinh hc, phân gii
các cht hu c bn vng) còn có nhiu nhóm vi sinh vt có kh nng c ch s
phát trin ca Azotobacter (cnh tranh thc n, sn xut cht kháng sinh,…)
(Nguyn Lơn Dng và cs.).
Hình 1.3 Hình thái Azotobacter trênămôiătrngăvôăđm và t bào vi khun
Azotobacter ()
BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP
SVTH: LÊ TH HO 16
PHNă2:
VT LIUăVẨăPHNGă
PHÁP NGHIÊN CU