nghiên cứu đa dạng di truyền tập đoàn lúa kháng đạo ôn của việt nam bằng chỉ thị ssr

Luận văn thạc sỹ Đặng Đình Hoàn


1
MỞ ĐẦU

1. Lý do chọn đề tài
(Oryza sativa L.) 

 
 

 

cao.
T              
chúng 

Nam không
 
   




 [4].


   
 
- 


Luận văn thạc sỹ Đặng Đình Hoàn


2

 [8].

           


Có rt nhiu loi ch th ADN khác
c s d nh các loi cây trng.  th SSR d thc
hin, có m o, biu hin vi s ng ln các allele nên rt thích hp
cho vi      ng di truyn; xây
dng b gen; nghiên cu s phát sinh loài và nghiên cu s tin hóa. Trên th
giu nghiên cu s dng ch th  nghiên cng di truyn
   n các allele hi  nhn dng chính xác các gi  a
 [28], [46], [52], [54].
      
.
Chính vì chúng  “Nghiên cứu đa dạng di truyền tập đoàn
lúa kháng đạo ôn của Việt Nam bằng chỉ thị SSR”   
 
ôn.
2. Mục tiêu nghiên cứu
 
 
ch
 




Luận văn thạc sỹ Đặng Đình Hoàn


3
3. Ý nghĩa khoa học và thực tiễn của Đề tài

           h cho công tác

 

lúa   
 


gen lúa  




sinh thái N 
4. Đối tƣợng và phạm vi nghiên cứu

34 
vùng, các . C

.



             -  

Luận văn thạc sỹ Đặng Đình Hoàn


4
CHƢƠNG 1. TỔNG QUAN TÀI LIỆU

1.1 Vài nét sơ lƣợc về cây lúa

PoaceaeGramineae),
PryzoideaeOryzae, chi Oryza, loài Oryza sativa và Oryza glaberrima.
Loài Oryza sativa  Oryza glaberrima 
Phi. sativa chi
Oryza.  Oryza sativa,
granulata, coarctala, rhynchoryza và chi Oryza [1]. 

Lúa dại hàng niên 
      

 rufipogon
hàng niên.
Lúa dại đa niên 

 
rufipogon 
lúa cỏ

lúa đỏ



khó p


Oryza sativa 
Luận văn thạc sỹ Đặng Đình Hoàn


5


Oryza glaberrima Steud Châu Phi
Oryza sativa L [10].
- 

              
  

                




Oryza 
Vaughan D. A. (1994) 
Oryza rhizomatisOryza lên 23




Oryza
Nhóm/loài
Tên khác



I. Nhóm O. sativa



1. O. sativa L

24
AA
2. O. nivara Shama et Shastry
O. rufipogon
24
AA
3. O. rufipogon Griff
O. perennis,
O. rufipogon
24
AA
4. O. glaberrima Steud

24
AA
Luận văn thạc sỹ Đặng Đình Hoàn

6
Nhóm/loài
Tên khác



5. O. barthii A. Chev
O. breviligulata
24
AA
6. O. longistaminata Chev. et
Roehr
O. barthii
24
AA
7. O. meridionalis Ng

24
AA
II. Nhóm O. officinalis
O. latifolia


8. O. officinanis Wall ex Watt
O. minuta
24
CC
9. O. minuta Presl et Presl
O. officinanis
48

BBCC
10. O. rhizomatis Vaughan

24
CC
11. O. eichingeri Peter

24
CC
12. O. punctata Kotschy ex Steud
O.schweinfurthia
24, 48
BB,BBCC
13. O. latifolia Desv

48
CCDD
14. O. alta Swallen

48
CCDD
15. O. grandiglumis (Doell) Prod

48
CCDD
16. O. Australiensis Domin

24
EE
17. O. brachyantha Chev. et

Roehr.

24
FF
18. O. schlechteri Pilger

48

III. Nhóm O. ridleyi



19. O. ridleyi Hook.f.

48

20. O. longiglumis Jansen

48

IV. Nhóm O. meyeriana



21. O. meyeriana (Zoll. et Mor. ex
Steud) Baill

24

22. O. granulata Nees et Am. ex

Watt.

24

Nguồn: Vaughan, 1994 [61]
Luận văn thạc sỹ Đặng Đình Hoàn


7
Oryza 
Oryza sativa và Oryza glaberrima 
Oryza glaberrima 
và Trung Phi còn loài Oryza sativa         
Indica và Japonica
 Indica và Japonica      Javanica

0], [13].


INDICA
JAVANICA
JAPONICA
Thân
- Thân cao
- Thân cao trung bình
- 

- 
- 
- N

Lá
- 
- 

- 

- 
- 

- 

- 
- 
- 

- 
- 
- 
- 

- 

- 

-

- 

- 


Nguồn: Chang, 1965 [22]
- 11
    Indica          
Indica, Japonica) cho 
Luận văn thạc sỹ Đặng Đình Hoàn


8
Indica và Japonica - 200000

Jason và 
- 

Oryza rufipogon 
Indica và Japonica [41].


Japonica 
Indica [7].
1.1.3. Giá t

 
 
     
  
             


-



  
   

. 1].
 

Luận văn thạc sỹ Đặng Đình Hoàn


9



  

 


 
              



1.2. Tình hình sản xuất lúa gạo trên thế giới và Việt Nam
  



     



 
4].


              
 

         
Luận văn thạc sỹ Đặng Đình Hoàn


10
              



 

   
   2010
 
 

  


  
 



 


  lên 4,3

 




Luận văn thạc sỹ Đặng Đình Hoàn


11







Ý và Liê 


              
Indonesia, Iran, Trung Qu        

 Ngoài

       
            

              


  




-  
- 2010,


Luận văn thạc sỹ Đặng Đình Hoàn


12



 


 



 



c



           








            


Luận văn thạc sỹ Đặng Đình Hoàn


13
tính, 



 




1.3. Bệnh đạo ôn ở lúa
Pyricularia grisea 



               





6




Philippines 
- 
 


Luận văn thạc sỹ Đặng Đình Hoàn


14
khác nhau: Khang dân   


 


- 
               
OM1490, thi- 80%.

      


6
H
5
NO
2
), piricularin (C
18
H
14
N
2
O
3



9


 
        

8].

  

- - 0,5 cm.

                 

 - 
 - 
Luận văn thạc sỹ Đặng Đình Hoàn


15

Chung, 2005) [3].

Bệnh
Triệu chứng
Trên lá



không rõ.
Trên 

héo.



-2mm


 


Hải Dƣơng:             

Thái Bình: gày 29/3


Nghệ An: 
   ôn 

Quảng Bình: - 


Luận văn thạc sỹ Đặng Đình Hoàn


16
Quảng Trị: 

- - 
3].
Các tỉnh phía Nam: 







 
1.4. Tình hình nghiên cứu đa dạng di truyền lúa bằng chỉ thị ADN


l. 
 allele 




56% allele 
allele 
allele allele 


Bonman và  (1992) 
               
Luận văn thạc sỹ Đặng Đình Hoàn


17
    
               

                
 - 






 2011 Girija          
 



 Kt qu phân tích PCR cho thy 39
trong s c s da 8 ging lúa [34].




 




 
Luận văn thạc sỹ Đặng Đình Hoàn


18
Indica
Japonica 13].
g nông


2001) [1].
Japonica 
ng

dày [10].


- 50
-  [14].

     
trong các    

 

 [15].

 




-
khác là 0,34 (1-
Luận văn thạc sỹ Đặng Đình Hoàn


19

5].


Pi-5(t) và gen Pi-3(t) [2].



Xa-4 và Xa-5 [6].
 




              


5].

tro

46 locut.              
Japonica  Indica 
6].
1.5. Một số kết quả và thành tựu trong chọn tạo giống lúa kháng đạo ôn
                
 
Pyricularia grisea 

Luận văn thạc sỹ Đặng Đình Hoàn


20





nhau. Các receptor 
        
- 
effector


     



0].

Pyricularia i
9



 
              
               
Raminad, Zenith, Np-125, Usen, Dular, Kanto 51, Sha-tiao-tsao, Caloro. Tuy nhiên,


- 

Luận văn thạc sỹ Đặng Đình Hoàn


21


kháng chính. Các gen khá


- 

lúa Zenith (Pi-Z + Pia + Pi-i), Dular (Pi-ka), Tetep (Pi-kh), Tadukan (Pi-ta








* 

 
     -  
Tongil [47].
Sandhu  






Luận văn thạc sỹ Đặng Đình Hoàn


22



* 
à AFLP, nó cho phép xác



                
-

-

* 

- 


          

- 
- 
nucleotide khác.
- 



 
Luận văn thạc sỹ Đặng Đình Hoàn

23







                  




SSR 


 và
, 1998) [39]. 



ng
SSR là 
                 


           

 chi
Luận văn thạc sỹ Đặng Đình Hoàn

24


                


               

yêu 

         

[24], [25], [27], [29], [46], [64].
     
 

    -z

-1, AP5659-3 và AP5659-
--z
[31].
  Digu, kháng 
ôn, y còn  quan  lúa kháng 
  
. 
         gen kháng     
Pik
s

,Pia, Pik, Pi-b, Pi-k
p
, Pi-ta
2
, Pi-ta, Pi-z, Pi-i, Pi-k
m
,Pi-z
t
, Pi-t và Pi-11, 
  Digu  
 c Digu 
Luận văn thạc sỹ Đặng Đình Hoàn


25
ZB13 và ZB15  hai gen , 
Hai gen  gen kháng , 
-d(t)1 và Pi-d(t)2.   RFLP: G1314A và G45
 F2, Pi-d (t  
  và 10,6 cM, Pi-d (t  
  3,2 và 3,4 cM 
  
 lúa Digu 

Japonica   kháng
  Pi-ta    Japonica   M202 (Pi-     
 Magnaporthe oryzae  Pi-ta. Con lai kháng 
qua  M, con lai kháng 
  ng   AVR-Pita, và lai   M202 
 Hai  BC5F1  

12 marker SSR    -ta   12. Nhóm
    vào trong 43 con lai BC5F2 
   
 ADN  và các
  còn A k
BC5F2. Tuy nhiên,   Pi-ta khác nhau giao
   (27Mbp)  
   
vùng genom Pi-ta    
trong Pi- Katy, Madison, Kaybonnet, và Drew. 
này   Tetep có  12  Tadukan 
Philippines.     
 .