Tải bản đầy đủ (.pdf) (11 trang)

ỨNG DỤNG KỸ THUẬT PCR VÀ GIẢI TRÌNH TỰ GEN ĐỊNH DANH NẤM ĐƯỜNG SINH SẢN Ở PHỤ NỮ TRONG ĐỘ TUỔI SINH ĐẺ (18 - 49 TUỔI) ĐÃ CÓ CHỒNG TẠI THỊ XÃ QUẢNG YÊN TỈNH QUẢNG NINH (2013 - 2014)

Bạn đang xem bản rút gọn của tài liệu. Xem và tải ngay bản đầy đủ của tài liệu tại đây (779.76 KB, 11 trang )

TẠP CHÍ Y - DƯỢC HỌC QUÂN SỰ SỐ 9-2014

ỨNG DỤNG KỸ THUẬT PCR VÀ GIẢI TRÌNH TỰ GEN ĐỊNH DANH
NẤM ĐƢỜNG SINH SẢN Ở PHỤ NỮ TRONG ĐỘ TUỔI SINH ĐẺ
(18 - 49 TUỔI) ĐÃ CÓ CHỒNG TẠI THỊ XÃ QUẢNG YÊN
TỈNH QUẢNG NINH (2013 - 2014)
Cao Bá Lợi*; Vũ Quyết Thắng* và CS
TÓM TẮT
398 phụ nữ trong độ tuổi sinh đẻ (18 - 49 tuổi) đã có chồng tại thị xã Quảng Yên, tỉnh Quảng
Ninh được khám sản khoa và lấy mẫu xét nghiệm dịch âm đạo tìm ký sinh trùng. Kết quả:
116 phụ nữ nhiễm Candida sp. bằng phương pháp nuôi cấy trong môi trường Sabouraud,
sau đó, những phụ nữ này được xét nghiệm bằng kỹ thuật PCR với gen mồi ITS1 và ITS4 và
sử dụng enzym phân cắt hạn chế Msp I để định danh loài nấm, kết quả: 95/106 (89,6%) mẫu
cho kết quả (+).
Lựa chọn 95 mẫu tiến hành thôi gel, 51 mẫu cho kết quả 2 băng, tiến hành thôi gel mỗi một
băng ADN riêng rẽ và thu từng băng để giải trình tự. Truy cập Ngân hàng Gen và phân tích
giám định loài 51 chuỗi gen cho thấy: 27 mẫu C. glabrata, 15 mẫu C. albicans, 6 mẫu C. tropical,
2 mẫu C. parapsilosis, 1 mẫu C. krusei.
* Từ khóa: Nấm đường sinh sản; PCR; Phụ nữ độ tuổi sinh đẻ; Quảng Ninh.

Application of PCR and Electrophoresis Gel Sequencing for
Quantification of Vaginal Candidiasis in 398 Married Women at
Reproductive Age (18 - 49) in Quangyen, Quangninh (2013 - 2014)
Summary
The research was conducted in Quangyen, Quangninh provice on 398 married women at
reproductive age (18 - 49). Obstetric examination was carried out, vaginal samples were examined
by Gram staining and cultured in Sabouraud medium for yeart gentital tract. The result showed
that 116 samples infected with Candida spp. 106/116 samples were tested using PCR at
Vietnam Institute of Biotechnology with ITS 1 - ITS4 target gene resulting in 95/106 (89.6%)
positive samples.
Selection of 51 samples in total of 95 positive samples were subjected to gel purifiel DNA


from electrophoresis gel sequencing. PCR product made 2 saparated bands, it was purified
seperately.
* Viện Sốt rột - Ký sinh trựng và Côn trùng TW
Người phản hồi (Corresponding): Cao Bá Lợi ()
Ngày nhận bài: 09/10/2014; Ngày phản biện đánh giá bài báo: 20/11/2014
Ngày bài báo được đăng: 26/11/2014

59


TẠP CHÍ Y - DƯỢC HỌC QUÂN SỰ SỐ 9-2014
The order of the nucleotide sequence was handled by specialized software, with reference
sequence in gene banks. Results: 27 samples were as C. glabrata, 15 samples purified as C.
albicans, 6 samples as C. tropical, 2 samples known as C. parapsilosis and and 1 samples as
C. krusei.
* Key words: Vaginal candidiasis; PCR; Women at reproductive age; Quangninh province.

ĐẶT VẤN ĐỀ
Tại Việt Nam, các bệnh nhiễm trùng
đường sinh sản (ĐSS) có xu hướng tăng
cao do nhiều nguyên nhân như: thói quen
sinh hoạt mất vệ sinh, nguồn nước bị ô
nhiễm, tệ mại dâm, tình trạng nạo phá
thai không kiểm soát… dẫn đến tình trạng
nhiễm trùng ĐSS, đặc biệt nhiễm nấm
Candida sp. ĐSS. Vũ Đức Bình và CS
(2013) nghiên cứu trên phụ nữ 18 - 49 đã
có chồng tại huyện Tam Nông, Phú Thọ
bằng kỹ thuật PCR và giải trình tự gen
nấm ký sinh ĐSS thấy: tỷ lệ nhiễm

Candida sp. ĐSS là 30,5%, trong đó,
Candida glabrata (C. glabrata) chiếm 43,5%,
Candida tropicalis (C. tropicalis) 34,8%,
Candida albicans (C. albicans) 14,6%,
Candida krusei (C. krusei) 4,3% và Candida
parapsilosis (C. parapsilosis) 2,8% [1, 2].
Tại Quảng Ninh nói chung và thị xã
Quảng Yên nói riêng đến nay chưa có
công trình nghiên cứu nào đi sâu và đầy
đủ về tình trạng nhiễm nấm ĐSS ở phụ
nữ trong độ tuổi sinh đẻ, nhưng các yếu
tố nguy cơ nhiễm nấm ĐSS rất cao. Với
tính cấp thiết của vấn đề và để xác định
tỷ lệ thành phần loài nấm ĐSS, chúng tôi
thực hiện nghiên cứu với mục tiêu: Ứng
dụng kỹ thuật PCR và giải trình tự gen
xác định tỷ lệ, thành phần loài nấm ĐSS ở
phụ nữ trong độ tuổi sinh đẻ (18 - 49 tuổi)
60

đã có chồng tại thị xã Quảng Yên, tỉnh
Quảng Ninh.
ĐỐI TƢỢNG VÀ PHƢƠNG PHÁP
NGHIÊN CỨU
1. Đối tƣợng, địa điểm và thời gian
nghiên cứu.
- Đối tượng nghiên cứu: phụ nữ trong
độ tuổi sinh đẻ (18 - 49) đã có chồng, tình
nguyện tham gia nghiên cứu.
- Địa điểm nghiên cứu:

+ Lấy mẫu bệnh phẩm tại thị xã Quảng
Yên, tỉnh Quảng Ninh.
+ Tiến hành kỹ thuật PCR giải trình tự
gen nấm tại Phòng Miễn dịch học, Viện
Công nghệ Sinh học, Viện Hàn lâm Khoa
học Việt Nam.
- Thời gian nghiên cứu từ 4 - 2014 đến
10 - 2014.
2. Phƣơng pháp nghiên cứu.
- Cỡ mẫu nghiên cứu: cỡ mẫu điều
tra cắt ngang đánh giá tình trạng nhiễm
nấm ĐSS là 384, trong thực tế chúng tôi
nghiên cứu 398 mẫu.
Thực hiện kỹ thuật PCR giải trình tự
gen 106/116 mẫu nấm.
- Thu thập và bảo quản mẫu [3, 4]:
gồm các bệnh phẩm lấy từ dịch âm đạo
tại cùng đồ sau, sau đó, nuôi cấy trong
môi trường Sabouraud có kháng sinh
chloramphenicol, pH = 5,0.


TẠP CHÍ Y - DƯỢC HỌC QUÂN SỰ SỐ 9-2014

Các mẫu bệnh phẩm (+) với nấm
Candida spp. mỗi mẫu cho vào túi riêng
biệt và chuyển về Phòng Miễn dịch học,
Viện Công nghệ Sinh học. Bảo quản ở
ngăn mát (4 - 100C) (tủ lạnh thường) đến
khi tiến hành tách ADN tổng số.


- Bổ sung 100 µl NaCl 5 M, 100 µl
CTAB/NaCl (4,1 g NaCl; 10 g CTAB;
trong 100 ml nước), làm nóng đến 65oC,
lắc xoáy đến khi toàn bộ dịch chuyển
sang màu trắng sữa và ủ 65oC trong 10
phút.

Tiến hành tách ADN tổng số (ADN hỗn
hợp của tế bào nấm) theo quy trình sau:

- Bổ sung 450 µl hỗn hợp chloroform/
isoamyl alcohol 24:1 và lắc xoáy trong 10
giây. Ly tâm 13.000 vòng/phút trong 5 phút.

- Dùng que cấy (loop) lấy đầy tế bào
nấm từ bề mặt ống nuôi cấy và chuyển
vào ống Eppendorf (dung tích 1,5 ml).

- Chuyển dịch nổi sang ống Eppendorf
mới, bổ sung 450 µl isopropanol, ủ trong
đá 10 phút.

- Bổ sung 400 µl đệm TE (500 µl Tris-HCl
pH 6,8 1 M; 100 µl EDTA, pH8 0,5 M và
nước đến tổng số 50 ml). Ủ 800C trong
20 phút để giết tế bào nấm, sau đó hạ nhiệt
độ xuống nhiệt độ phòng.

- Ly tâm 13.000 vòng/phút trong 15 phút;

loại bỏ dịch nổi. Bổ sung 500 µl ethanol
70%, ly tâm 13.000 vòng/phút trong 5 phút;
loại bỏ dịch nổi và làm khô tủa. Hòa tan
tủa trong 50 µl dịch TE. Bảo quản sản
phẩm ở -20oC.

* Tách chiết ADN tổng số [3, 4]:

- Bố sung 50 µl lysozyme nồng độ
10 mg/ml (35 mg lysozyme trong nước
đến tổng số 3,5 ml) lắc xoáy (vortex),
ủ 37oC trong 1 giờ.
- Bổ sung 5 µl proteinase K nồng độ
10 mg/l và 70 µl SDS 10% (1 g SDS trong
9 ml nước), lắc xoáy nhẹ và ủ ở 65oC
trong 10 phút.

* Thiết kế mồi và thực hiện phản ứng
PCR:
Để thực hiện xác định loài các mẫu
nấm, cặp mồi chung cho các loài nấm ký
hiệu ITS1/ITS4 [3, 4], thiết kế để thực
hiện phản ứng PCR vùng ITS (internal
transcribed spacer).

Bảng 1: Trình tự nucleotid các chuỗi mồi thực hiện PCR trong xác định loài nấm
Candida spp.





ITS1

18S rRNA

TCCGTAGGTGAACCTGCGG

19

ITS4

26S rRNA

TCCTCCGCTTATTGATATGC

20

Khoảng 0.5 đến 0.9 kb (tùy loài
nấm) vùng gen 18S rRNA-ITS15.8S rRNA-ITS2-28S rRNA

Phản ứng PCR thực hiện với cặp mồi, bao gồm mồi xuôi ITS1 và mồi ngược ITS4
cho sản phẩm từ 500 - 900 bp, tùy từng loài Candida sp. Thành phần phản ứng PCR
như sau:
* Thành phần phản ứng PCR: PCR master mix (Fermentas): 12,5 µl; ITS1F
(10 picomol/ul): 1 µl; ITS4R (10 picomol/ul): 1 µl; DMSO: 1,25 µl; ADN khuôn: 1 µl;
nước: 8,25 µl.
- Chu trình nhiệt thực hiện PCR như sau:
61



TẠP CHÍ Y - DƯỢC HỌC QUÂN SỰ SỐ 9-2014

Bảng 2: Chu trình nhiệt thực hiện PCR.

95 C

0

5’

95 C

0

30”

58 C

0

30”

0

1’

72 C
0

1


35

72 C

5’

0

Nhiệt độ bảo quản sản phẩm

4C

Sau khi thực hiện phản ứng, kết quả
PCR được kiểm tra bằng điện di sản
phẩm trên thạch agarose 1%, hiệu điện
thế U = 100 V trong 25 phút.
* Giải trình tự và xử lý số liệu:
Sản phẩm PCR sau khi kiểm tra được
tinh sạch bằng phương pháp thôi gel
(ADN elution) sử dụng bộ kít AccuPrep™
Gel Purification Kit (Bioneer, Hàn Quốc).
Nếu mẫu có 2 băng ADN sản phẩm PCR,
tiến hành thôi gel mỗi băng ADN riêng rẽ
và thu từng băng để giải trình tự. Sản
phẩm PCR sau khi tinh sạch được giải
trình tự trực tiếp, sử dụng mồi ITS1.
Xử lý trình tự các chuỗi nucleotid bằng
phần mềm chuyên biệt, bao gồm SeqEd1.03,
AsemblyLIGNv1.9c và hệ chương trình

MacVector8.2 (Accelrys Inc) trên máy
tính Macintosh. So sánh đối chiếu và
xử lý số liệu các chuỗi thu nhận và
Ngân hàng Gen (Genbank) bằng chương
trình GENEDOC2.7. So sánh trình tự
nucleotid vùng ITS của các chủng nấm
Candida spp về thành phần nucleotid, xác
định loài bằng cách truy cập Ngân hàng
Gen (BLAST: />Blast.cgi) và xem xét mối quan hệ phả
hệ nguồn gốc, sử dụng chương trình
MEGA5.0 phương pháp “kết nối liền kề”
62

NJ (Neighbor-JoiningNJ) với hệ số tin
tưởng 1.000 bootstrap [4].
* Địa điểm thực hiện:
Tiến hành giải trình tự gen và xử lý số
liệu tại Phòng Miễn dịch và Phòng Thí
nghiệm Trọng điểm, Viện Công nghệ Sinh
học (Viện Hàn lâm Khoa học và Công
nghệ Việt Nam).
KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU VÀ
BÀN LUẬN
1. Kết quả tách chiết ADN tổng số
từ các mẫu nấm nuôi cấy.
Từ 106 mẫu nấm (phần lớn tập trung
thuộc chi Candida spp.), sử dụng các loại
dung môi, hóa chất pha chế theo mô tả
trên. Kiểm tra ngẫu nhiên ADN tổng số ở
một số mẫu, kết quả cho thấy có hiển thị

vệt sáng trên thạch agarose 1% nhuộm
ethidium bromide, chứng tỏ trong mẫu
tách chiết có ADN thu nhận từ hệ gen của
mẫu nấm nuôi cấy. Từ kết quả tách chiết,
sử dụng lần lượt ADN tổng số các mẫu
sử dụng làm khuôn để thực hiện PCR
theo quy trình đã mô tả [3, 4]. Kết quả
như sau:
Bảng 3: Số lượng sản phẩm PCR ITS1 ITS4 trước và sau khi cắt bằng Msp I.
Candida sp.

871

557,314

C. glabrata

49

49,4

535

297,238

C. albicans

27

27,3


524

340,184

C. tropical

10

10,1

520

520,000

C. parapsilosis

7

7,1

510

261,249

C. krusei

6

6,1


99

100,0

Tổng


TẠP CHÍ Y - DƯỢC HỌC QUÂN SỰ SỐ 9-2014

Bảng 4: Tổng hợp kết quả (+) với ITS1 và ITS4 PCR.

Số mẫu (+)

Tỷ lệ (%)

Số mẫu (-)

Tỷ lệ (%)

Liên Vị (1)

35

29

82,9

6


17,1

Hoàng Tân (2)

47

44

93,6

3

6,4

Sông Khoai (3)

24

22

91,7

2

8,3

Chung

106


95

89,6

11

10,4

Giá trị p

(1, 2, 3) < 0,05

89,6% phát hiện nấm (+) bằng kỹ thuật PCR với cặp mồi chung ITS1 và ITS4. Có
sự khác biệt giữa tỷ lệ phát hiện nấm ở 3 xã Liên Vị, Hoàng Tân và Sông Khoai tương
ứng 82,9% so với 93,6% và 91,7%, p < 0,05.
2. Kết quả giải trình tự phân tích

Có 106 mẫu được tách chiết ADN tổng

chuỗi gen và giám định loài nấm gây

số, thực hiện PCR, kết quả 11 mẫu âm

nhiễm.

tính không cho sản phẩm. Tổng số thu

* Một số nhận xét chung:
Tất cả sản phẩm PCR thu được ở mỗi
nhóm, kể cả một số sản phẩm thu được


hoạch được 95 mẫu có sản phẩm PCR,
trong đó, 4 mẫu cho sản phẩm kép, gồm
2 băng ADN (0.5 kb và 0.9 kb).

sau PCR lần 2, tinh sạch thu đơn băng

Hầu hết sản phẩm thæi gel các mẫu

ADN bằng phương pháp thôi gel (ADN

được giải trình tự trực tiếp. Sau khi phân

elution). Trường hợp đơn băng thì cắt

tích, thu được 51 chuỗi nucleotid đơn nhất

riêng băng ADN đó, trong trường hợp đa

sử dụng để truy cập Ngân hàng Gen và

băng, cắt riêng từng băng một và thu

phân tích giám định loài.

ADN tinh sạch vào từng ống để đưa đi

Một số sản phẩm PCR khi giải trình tự

giải trình tự. Sau khi giải trình tự, chuỗi


cho 2 chuỗi nucleotid lồng nhau, không

nucleotid được xử lý phân tích bằng phần

thể phân tích để thu chuỗi nucleotid riêng

mềm chuyên biệt để có chuỗi cuối cùng

biệt. Như vậy, tuy cùng kích thước, nhưng

và tiến hành truy cập Ngân hàng Gen

sản phẩm là ADN của 2 hoặc đa loài gây

sử dụng chương trình BLAST (BLAST:

nhiễm. Với trường hợp này, cần tách dòng

Danh

phân biệt để thu từng clon riêng và giải

sách mẫu, kết quả PCR, chuỗi gen giải

trình tự.

trình tự, kết quả truy cập Ngân hàng Gen

Kết quả truy cập Ngân hàng Gen chủ

yếu là liệt kê xác định 5 loài trong số 51
mẫu truy cập, kết quả như sau:

và xác định kết quả cuối cùng được thống
kê ở bảng 4.
63


TẠP CHÍ Y - DƯỢC HỌC QUÂN SỰ SỐ 9-2014

- So sánh phân tích chuỗi gen ITS các mẫu thuộc loài Candida albicans.
20

40

60

Calb-IST(5
Calb-IST(5
M1-H1- 030
M2- H2-003
M-H2- 052
M-H2- 055
M-H3-064
M-S-061
M-S-072
M-S-130
M-S-150
M-S-161
M-L-Đông-107

M-L-Hàn-074
M-L-Bầu-044
M-L- Đình-121
M-L-Quán-198

:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:

GTGTTTTTCTTTGAAACAAACTTGCTTTGGCGGTCCCAGCCTGCCGCCAGAGGTCTAAACTTACAACCAATTTTTTA

Calb-IST(5
Calb-IST(5
M1-H1- 030
M2- H2-003
M-H2- 052

M-H2- 055
M-H3-064
M-S-061
M-S-072
M-S-130
M-S-150
M-S-161
M-L-Đông-107
M-L-Hàn-074
M-L-Bầu-044
M-L- Đình-121
M-L-Quán-198

:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:


TCAACTTGTCACACCAGATTATTACT-AATAGTCAAAACTTTCAACAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAAC

Calb-IST(5
Calb-IST(5
M1-H1- 030
M2- H2-003
M-H2- 052
M-H2- 055
M-H3-064
M-S-061
M-S-072
M-S-130
M-S-150
M-S-161
M-L-Đông-107
M-L-Hàn-074
M-L-Bầu-044:
M-L- Đình-121
M-L-Quán-198

:
:
:
:
:
:
:
:
:

:
:
:
:
:
:
:
:

GCAGCGAAATGCGATACGTAATATGAATTGCAGATATTCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTCTGGT

Calb-IST(5
Calb-IST(5
M1-H1- 030
M2- H2-003
M-H2- 052
M-H2- 055
M-H3-064
M-S-061
M-S-072
M-S-130
M-S-150
M-S-161
M-L-Đông-107
M-L-Hàn-074
M-L-Bầu-044
M-L- Đình-121
M-L-Quán-198

:

:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:

ATTCCGGAGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCGTTTCTCCCTCAAACCGCTGGGTTTGGTGTTGAGCAATACGACTTGGGTTT

64

80

………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………

………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
100
120
140
160
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
180

200
220
240
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
260
280
300
320
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………

………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………
………………………………………………………………...……………………………..………

: 80
: 80
: 80
: 80
: 80
: 80
: 80
: 80
: 80
: 80
: 80
: 80
: 80
: 80
: 80
: 80
: 80
: 159
: 159
: 159
: 159
: 159

: 159
: 159
: 159
: 159
: 159
: 159
: 159
: 159
: 159
: 159
: 159
: 159
: 239
: 239
: 239
: 239
: 239
: 239
: 239
: 239
: 239
: 239
: 239
: 239
: 239
: 239
: 239
: 239
: 239
: 319

: 319
: 319
: 319
: 319
: 319
: 319
: 319
: 319
: 319
: 319
: 319
: 319
: 319
: 319
: 319
: 319


TẠP CHÍ Y - DƯỢC HỌC QUÂN SỰ SỐ 9-2014
340

360

380

400

Calb-IST(5
Calb-IST(5
M1-H1- 030

M2- H2-003
M-H2- 052
M-H2- 055
M-H3-064
M-S-061
M-S-072
M-S-130
M-S-150
M-S-161
M-L-Đông-107
M-L-Hàn-074
M-L-Bầu-044
M-L- Đình-121
M-L-Quán-198

:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:

:
:

GCTTGAAAGACGGTAGTGGTAAGGCGGGATCGCTTTGACAATGGCTTAGGTCTAACCAAAAACATTGCTTGCGGCGGTAA

Calb-IST(5
Calb-IST(5
M1-H1- 030
M2- H2-003
M-H2- 052
M-H2- 055
M-H3-064
M-S-061
M-S-072
M-S-130
M-S-150
M-S-161
M-L-Đông-107
M-L-Hàn-074
M-L-Bầu-044
M-L- Đình-121
M-L-Quán-198

:
:
:
:
:
:
:

:
:
:
:
:
:
:
:
:

CGTCCACCACGTATATCTTCAAACTTT G ACCT CAAA TCAG GTAGGACTACC CGCTGAACTTAAG : 463
……………………………………………………………………………………………………………………………………:463
……………………………………………………………………………………………………………………………………:463
……………………………………………………………………………………………………………………………………:463
……………………………………………………………………………………………………………………………………:463
……………………………………………………………………………………………………………………………………:463
……………………………………………………………………………………………………………………………………:463
……………………………………………………………………………………………………………………………………:463
……………………………………………………………………………………………………………………………………:463
……………………………………………………………………………………………………………………………………:463
……………………………………………………………………………………………………………………………………:463
……………………………………………………………………………………………………………………………………:463
……………………………………………………………………………………………………………………………………:463
……………………………………………………………………………………………………………………………………:463
……………………………………………………………………………………………………………………………………:463
……………………………………………………………………………………………………………………………………:463
……………………………………………………………………………………………………………………………………:463
……………………………………………………………………………………………………………………………………:463

: 399

: 399
: 399
: 399
: 399
: 399
: 399
: 399
: 399
: 399
: 399
: 399
: 399
: 399
: 399
: 399
: 399

………………………………………………………………………………………………………
………………………………………………………………………………………………………
………………………………………………………………………………………………………
………………………………………………………………………………………………………
………………………………………………………………………………………………………
………………………………………………………………………………………………………
………………………………………………………………………………………………………
………………………………………………………………………………………………………
………………………………………………………………………………………………………
………………………………………………………………………………………………………
………………………………………………………………………………………………………
420


:

440

460

Hình 1: So sánh trình tự nucleotid chuỗi gen ITS của 15 chủng C. albicans từ
các mẫu nghiên cứu với 2 chủng C. albicans của thế giới.
Các chuỗi nucleotid của 15 mẫu Candida sp. nghiên cứu bao gồm H1-030, H2-003,
H2-052, H2-055, H3-064, S-061, S-072, S-130, S-150, S-161, L-Đông-107, L-Hán-074,
L-Bầu-044, L-Đình-121, L-Quán-198 được sắp xếp so sánh và phân tích thành phần
nucleotid với 2 chuỗi C. albicans thu thập từ Ngân hàng Gen là C. albicans (CalbITS(571bp)ATCC-JX094781 từ ATCC; Calb-ITS(540bp)ICB954-BR-JX463266 tõ Brazil).
Các chủng đã cho tỷ lệ đồng nhất đạt 99 - 100%. Như vậy, ngoài truy cập Ngân hàng
Gen, kết quả phân tích chuỗi gen khẳng định có 15 mẫu nấm gây nhiễm của Việt Nam
được xác định là C. albicans.
- So sánh phân tích chuỗi gen ITS của các mẫu thuộc loài Candida glabrata:
20

Cglab-ITS(
Cglab-ITS (
M3-H1-052
M4-H1-053
M8-H2-008
M9-H2-019
M15-H2-062
M20-H3-070
M1-H3-016
M6-H3-042
M7-H3-046
M16-H3-069

M18-H3-073
M21-H3-082
M22-H3-083
M2-S-007
M8-S-082
M10-S-096
M15-S-122
M16-S-124
M3-L-Đông171
M4-L-Đông195
M5-L-Hàn-073 M7L-Hàn-086 M10LBầu-072
M12-LĐình-114
M19-LQuán-003
M16-L-Bầu-54 M17L-Quán18

65

:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:

:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:

40

60

80

100

TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC
TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC
TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC
TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC
TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC

TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC
TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC
TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC
TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC
TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC
TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAT AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC
TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC
TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC
TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC
TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC
TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC
TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC
TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC
TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAC TTTCTCTGCTGCGAATGCTATTTCTCCTGCC
TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC
TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC
TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC
TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC
TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC
TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC
TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATACTTTCTCTGCTGC GAATGCTATTTCTCCTGCC
TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC
TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC
TGATTTGTCTGAGCTCGGAGAGAGACATCTCTGGGGAGGACCAGTGTAGACACTCAGGAGGCTCCTAA AATAT TTTCTCTGCTGT GAATGCTATTTCTCCTGCC

: 104

: 104
: 104
: 104

: 104
: 104
: 104
: 104
: 104
: 104
: 104
: 104
: 104
: 104
: 104
: 104
: 104
: 104
: 104
: 104
: 104
: 104
: 104
: 104
: 104
: 104
: 104
: 104
: 104


TẠP CHÍ Y - DƯỢC HỌC QUÂN SỰ SỐ 9-2014
120


140

160

180

200

Cglab-ITS(
Cglab-ITS(
M3-H1-052
M4-H1-053
M8-H2-008
M9-H2-019
M15-H2-062
M20-H3-070
M1-H3-016
M6-H3-042
M7-H3-046
M16-H3-069
M18-H3-073
M21-H3-082
M22-H3-083
M2-S-007
M8-S-082
M10-S-096
M15-S-122
M16-S-124
M3-L-Đông171
M4-L-Đông195

M5-L-Hàn-073
M7-L-Hàn-086
M10-LBầu-072
M12-LĐình-114
M19-LQuán-003
M16-L-Bầu-54
M17-L-Quán18

:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:

:
:
:
:
:
:
:

TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT
TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT
TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT
TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT
TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT
TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT
TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT
TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT
TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT
TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT
TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT
TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT
TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT
TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT
TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT
TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT
TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT
TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT
TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT
TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT
TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT
TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT

TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT
TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT
TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT
TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT
TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT
TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT
TGCGCTTAAGTGCGCGGTTGGTGGGTGTTCTGCAGTGGGGGGAGGGAGCCGACAAAGACCTGGGAGTGTGCGTGGATCTCTCTATTCCAAAGGAGGTGTTTTAT

Cglab-ITS( CglabITS(
M3-H1-052
M4-H1-053
M8-H2-008
M9-H2-019
M15-H2-062
M20-H3-070
M1-H3-016
M6-H3-042
M7-H3-046
M16-H3-069
M18-H3-073
M21-H3-082
M22-H3-083
M2-S-007
M8-S-082
M10-S-096
M15-S-122
M16-S-124
M3-L-Đông171
M4-L-Đông195
M5-L-Hàn-073

M7-L-Hàn-086
M10-LBầu-072
M12-LĐình-114
M19-LQuán-003
M16-L-Bầu-54
M17-L-Quán18

:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:

:
:
:
:
:
:

CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC

Cglab-ITS( CglabITS(
M3-H1-052
M4-H1-053
M8-H2-008
M9-H2-019
M15-H2-062
M20-H3-070
M1-H3-016
M6-H3-042
M7-H3-046
M16-H3-069
M18-H3-073
M21-H3-082
M22-H3-083
M2-S-007
M8-S-082
M10-S-096
M15-S-122
M16-S-124
M3-L-Đông171
M4-L-Đông195

M5-L-Hàn-073
M7-L-Hàn-086
M10-LBầu-072
M12-LĐình-114
M19-LQuán-003
M16-L-Bầu-54
M17-L-Quán18

:

AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC
AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC
AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC
AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC
AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC
AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA ATAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC
AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC
AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC
AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC
AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC
AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC
AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC
AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC
AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC
AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT TTATTTAAA CTAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAAT AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC
AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC
AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC
AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC
AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC
AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC

AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC
AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC
AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT TTATTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC
AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC
AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC
AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC
AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC
AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC
AGTGGATGCAAACACAAACAAATATTTT - - - TTTAAA C TAATTCAGTCAACACAAGATTTCTTTTAGTAGAA - AACAACTTCAAAACTTTCAACAATGGATCTC

220

420

66

260

280

300

CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC
CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC
CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC
CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA A GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC
CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC
CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC
CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC
CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC

CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC
CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC
CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG G AGTTCTCCC
CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC
CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC
CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA A GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC
CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC
CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC
CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC
CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC
CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC
CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA A GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC
CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC
CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC
CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC
CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC
CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC
CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC
CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC
CACACGACTCGACACTTTCTAATTACTACACACAGTGGAGTTTACTTTACTACTATTCTTTTGTTCGTTGGGGGAA C GCTCTCTTTCGGGGGGG - AGTTCTCCC

320
:
:
:
:
:
:
:
:

:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:

240

340

440

360

460


380

480

: 208
: 208
: 208
: 208
: 208
: 208
: 208
: 208
: 208
: 208
: 208
: 208
: 208
: 208
: 208
: 208
: 208
: 208
: 208
: 208
: 208
: 208
: 208
: 208
: 208

: 208
: 208
: 208
: 208

: 311
: 311
: 311
: 311
: 311
: 311
: 311
: 311
: 311
: 311
: 311
: 312
: 311
: 311
: 311
: 311
: 311
: 311
: 311
: 311
: 311
: 311
: 311
: 311
: 311

: 311
: 311
: 311
: 311

400

500

520

: 411
: 411
: 411
: 411
: 411
: 411
: 411
: 411
: 411
: 411
: 411
: 411
: 411
: 411
: 415
: 411
: 411
: 411
: 411

: 411
: 411
: 411
: 414
: 411
: 411
: 411
: 411
: 411
: 411


TẠP CHÍ Y - DƯỢC HỌC QUÂN SỰ SỐ 9-2014
Cglab-ITS(
Cglab-ITS(
M3-H1-052
M4-H1-053
M8-H2-008
M9-H2-019
M15-H2-062
M20-H3-070
M1-H3-016
M6-H3-042
M7-H3-046
M16-H3-069
M18-H3-073
M21-H3-082
M22-H3-083
M2-S-007
M8-S-082

M10-S-096
M15-S-122
M16-S-124
M3-L-Đông171
M4-L-Đông195
M5-L-Hàn-073
M7-L-Hàn-086
M10-LBầu-072
M12-LĐình-114
M19-LQuán-003
M16-L-Bầu-54
M17-L-Quán18

:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:

:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:

TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT
TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT
TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT
TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT
TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT
TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT
TTGGTTCTCGCATCGAGAAAAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT
TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT
TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT
TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAGTGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT
TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT
TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT
TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT
TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT
TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT
TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAGTGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT
TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAGTGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT

TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT
TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT
TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT
TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT
TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT
TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT
TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT
TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT
TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCATTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT
TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT
TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT
TTGGTTCTCGCATCGAGAAGAACGCAGCGAAATGCGATACGTAATGTGAATTGCAGAATTCCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACAT TGCGCCCTCTGGT

Cglab-ITS(
Cglab-ITS(
M3-H1-052
M4-H1-053
M8-H2-008
M9-H2-019
M15-H2-062
M20-H3-070
M1-H3-016
M6-H3-042
M7-H3-046
M16-H3-069
M18-H3-073
M21-H3-082
M22-H3-083
M2-S-007
M8-S-082

M10-S-096
M15-S-122
M16-S-124
M3-L-Đông171
M4-L-Đông195
M5-L-Hàn-073
M7-L-Hàn-086
M10-LBầu-072
M12-LĐình-114
M19-LQuán-003
M16-L-Bầu-54
M17-L-Quán18

:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:

:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:

ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA
ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA
ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA
ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA
ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA
ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA
ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA
ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA
ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA
ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA
ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA
ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA
ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA
ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACA CGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA
ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA
ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA
ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA

ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA
ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA
ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA
ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA
ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA
ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACATTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA
ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA
ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA
ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA
ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA
ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA
ATTCCGGGGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTCCTTCTCAAACACGTTGTGTTTGGTAGTGAGTGATACTCTCGTTTTTGAGTTAACTTGAAATTGTAGGCCA

Cglab-ITS( CglabITS(
M3-H1-052
M4-H1-053
M8-H2-008
M9-H2-019
M15-H2-062
M20-H3-070
M1-H3-016
M6-H3-042
M7-H3-046
M16-H3-069
M18-H3-073
M21-H3-082
M22-H3-083
M2-S-007
M8-S-082
M10-S-096

M15-S-122
M16-S-124
M3-L-Đông171
M4-L-Đông195
M5-L-Hàn-073
M7-L-Hàn-086
M10-LBầu-072
M12-LĐình-114
M19-LQuán-003
M16-L-Bầu-54
M17-L-Quán18

:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:

:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:

TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG

Cglab-ITS(
Cglab-ITS(
M3-H1-052
M4-H1-053
M8-H2-008
M9-H2-019
M15-H2-062
M20-H3-070
M1-H3-016
M6-H3-042
M7-H3-046
M16-H3-069
M18-H3-073
M21-H3-082
M22-H3-083
M2-S-007

M8-S-082
M10-S-096
M15-S-122
M16-S-124
M3-L-Đông171
M4-L-Đông195
M5-L-Hàn-073
M7-L-Hàn-086
M10-LBầu-072
M12-LĐình-114
M19-LQuán-003
M16-L-Bầu-54
M17-L-Quán18

:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:

:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:

ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG
ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG
ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG
ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG
ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG
ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG
ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG
ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG
ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG
ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG
ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG
ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG
ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG
ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG
ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG
ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG

ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG
ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG
ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG
ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG
ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG
ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG
ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG
ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG
ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG
ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG
ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG
ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG
ATCTAGGGAGGGATAAGTGATGTTTTGTGCGTGCTGGGCAGACAGACGTCTTTAAGTTTGACCTCAAATCAGGTAGGGTTACCCGCTGAACTTAAG

540

640

560

660

480

680

600

620


700

760

780

: 619
: 619
: 619
: 619
: 619
: 619
: 619
: 619
: 619
: 619
: 619
: 619
: 619
: 619
: 623
: 619
: 619
: 619
: 619
: 619
: 619
: 619
: 622
: 619

: 619
: 619
: 619
: 619
: 619

720

TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG
TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG
TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG
TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG
TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG
TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG
TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG
TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG
TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG
TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG
TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG
TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG
TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG
TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG
TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG
TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG
TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG
TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG
TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG
TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG
TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG
TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG

TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG
TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG
TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG
TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG
TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG
TATCAGTATGTGGGACACGAGCGCAAGCTTCTCTATTAATCTGCTGCTCGTTTGCGCGAGCGGCGGGGGTTAATACTGTATTAGGTTTTACCAACTCGGTGTTG

740

: 515
: 515
: 515
: 515
: 515
: 515
: 515
: 515
: 515
: 515
: 515
: 515
: 515
: 515
: 519
: 515
: 515
: 515
: 515
: 515
: 515

: 515
: 518
: 515
: 515
: 515
: 515
: 515
: 515

800

: 723
: 723
: 723
: 723
: 723
: 723
: 723
: 723
: 723
: 723
: 723
: 723
: 727
: 723
: 723
: 723
: 723
: 723
: 723

: 723
: 723
: 723
: 726
: 723
: 723
: 723
: 723
: 723
: 723

820
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:

:
:
:
:
:
:
:
:
:
:
:

820
820
820
820
820
820
820
820
820
820
820
820
820
820
820
820
820
820

820
820
820
820
820
820
820
820
820
820
820

Hình 2: So sánh trình tự nucleotid chuỗi gen ITS của 27 chủng C. glabrata (Việt Nam)
với 2 chủng C. glabrata của thế giới.
67


TẠP CHÍ Y - DƯỢC HỌC QUÂN SỰ SỐ 9-2014

Các chủng cho tỷ lệ đồng nhất đạt cao (98 - 100%). Xác định các chuỗi nucleotid của
27 mẫu Candida sp. ở Việt Nam là C. glabrata, được sắp xếp so sánh và phân tích
thành phần nucleotid với 2 chuỗi C. glabrata thu thập từ Ngân hàng Gen là C. glabrata
(Cglab-ITS(886bp)-KW-FN652301 từ Cô-oét và Cglab-ITS (905bp)-GR-KC253980 từ
Hy Lạp). Ngoài những sai khác mang tính chất đơn lẻ từng nucleotid, 2 chủng của mẫu
nghiên cứu (các chủng H3-083 và L-Hàn-073) có sai khác đặc biệt đến 3 nucleotid
(TTA) và đột biến điểm thêm vào 1 nucleotid G hoặc T tại vị trí giải trình tự gen.
Như vậy, ngoài truy cập Ngân hàng Gen, kết quả phân tích chuỗi gen đã khẳng định
27 mẫu nấm gây nhiễm nghiên cứu được xác định là C. glabrata.
- So sánh phân tích chuỗi gen ITS của các mẫu thuộc loài Candida tropicalis:
20

Ctrop-CN(5 :
Ctrop-TW(4 :
Ctrop-PK(5 :
M11-H2-030 :
M12-H3-061 :
M9 - S-084 :
M12- S-103 :
M17- S-129 :
M21- S-157 :

100
Ctrop-CN(5 :
Ctrop-TW(4 :
Ctrop-PK(5 :
M11-H2-030 :
M12-H3-061 :
M9 - S-084 :
M12- S-103 :
M17- S-129 :
M21- S-157 :

Ctrop-CN(5 :
Ctrop-TW(4 :
Ctrop-PK(5 :
M11-H2-030 :
M12-H3-061 :
M9 - S-084 :
M12- S-103 :
M17- S-129 :
M21- S-157 :


80

120

140

160

220

240

260

180
:194
:192
:193
:193
:193
:193
:193
:193
:193
:193
:193

280
:291

:289
:290
:290
:290
:290
:290
:290
:290
:290
:290

300
320
340
360
380
TCCCTCAAACCCCCGGGTTTGGTGTTGAGCAATACGCTAGGTTTGTTTGAAAGAATTTAACGTGGAAACTTATTTTAAGCGACTTAGGTTTATCCAA
TCCCTCAAACCCCCGGGTTTGGTGTTGAGCAATACGCTAGGTTTGTTTGAAAGAATTTAACGTGGAAACTTATTTTAAGCGACTTAGGTTTATCCAA
TCCCTCAAACCCCCGGGTTTGGTGTTGAGCAATACGCTAGGTTTGTTTGAAAGAATTTAACGTGGAAACTTATTTTAAGCGACTTAGGTTTATCCAA
TCCCTCAAACCCCCGGGTTTGGTGTTGAGCAATACGCTAGGTTTGTTTGAAAGAATTTAACGTGGAAACTTATTTTAAGCGACTTAGGTTTATCCAA
TCCCTCAAACCCCCGGGTTTGGTGTTGAGCAATACGCTAGGTTTGTTTGAAAGAATTTAACGTGGAAACTTATTTTAAGCGACTTAGGTTTATCCAA
TCCCTCAAACCCCCGGGTTTGGTGTTGAGCAATACGCTAGGTTTGTTTGAAAGAATTTAACGTGGAAACTTATTTTAAGCGACTTAGGTTTATCCAA
TCCCTCAAACCCCCGGGTTTGGTGTTGAGCAATACGCTAGGTTTGTTTGAAAGAATTTAACGTGGAAACTTATTTTAAGCGACTTAGGTTTATCCAA
TCCCTCAAACCCCCGGGTTTGGTGTTGAGCAATACGCTAGGTTTGTTTGAAAGAATTTAACGTGGAAACTTATTTTAAGCGACTTAGGTTTATCCAA
TCCCTCAAACCCCCGGGTTTGGTGTTGAGCAATACGCTAGGTTTGTTTGAAAGAATTTAACGTGGAAACTTATTTTAAGCGACTTAGGTTTATCCAA
TCCCTCAAACCCCCGGGTTTGGTGTTGAGCAATACGCTAGGTTTGTTTGAAAGAATTTAACGTGGAAACTTATTTTAAGCGACTTAGGTTTATCCAA
TCCCTCAAACCCCCGGGTTTGGTGTTGAGCAATACGCTAGGTTTGTTTGAAAGAATTTAACGTGGAAACTTATTTTAAGCGACTTAGGTTTATCCAA

:388
:385

:387
:387
:387
:387
:387
:387
:387
:387
:387

420

440

460

AAACGCTTATTTTGCTAGTGGCCACCACAATTTATTTCATAACTTTGACCTCAAATCAGGTAGGACTACCCGCTGAACTTAAGCAT
AA - CGCTTATTTTGCTAGTGGCCACCACAATTTATTTCATAACTTTGACCTCAAATCAGGTAGGACTACCCGCTGAACTTAAGCAT
AAACGCTTATTTTGCTAGTGGCCACCACAATTTATTTCATAACTTTGACCTCAAATCAGGTAGGACTACCCGCTGAACTTAAGCAT
AAACGCTTATTTTGCTAGTGGCCACCACAATTTATTTCATAACTTTGACCTCAAATCAGGTAGGACTACCCGCTGAACTTAAGCAT
AAACGCTTATTTTGCTAGTGGCCACCACAATTTATTTCATAACTTTGACCTCAAATCAGGTAGGACTACCCGCTGAACTTAAGCAT
AAACGCTTATTTTGCTAGTGGCCACCACAATTTATTTCATAACTTTGACCTCAAATCAGGTAGGACTACCCGCTGAACTTAAGCAT
AAACGCTTATTTTGCTAGTGGCCACCACAATTTATTTCATAACTTTGACCTCAAATCAGGTAGGACTACCCGCTGAACTTAAGCAT
AAACGCTTATTTTGCTAGTGGCCACCACAATTTATTTCATAACTTTGACCTCAAATCAGGTAGGACTACCCGCTGAACTTAAGCAT
AAACGCTTATTTTGCTAGTGGCCACCACAATTTATTTCATAACTTTGACCTCAAATCAGGTAGGACTACCCGCTGAACTTAAGCAT
AAACGCTTATTTTGCTAGTGGCCACCACAATTTATTTCATAACTTTGACCTCAAATCAGGTAGGACTACCCGCTGAACTTAAGCAT
AAACGCTTATTTTGCTAGTGGCCACCACAATTTATTTCATAACTTTGACCTCAAATCAGGTAGGACTACCCGCTGAACTTAAGCAT

:
:

:
:
:
:
:
:
:
:
:

474
470
473
473
473
473
473
473
473
473
473

Hình.3: So sánh trình tự nucleotid chuỗi gen ITS của 6 chủng C. tropicalis các
mẫu nghiên cứu với 3 chủng C. tropicalis của thế giới.
68

:97
:95
:96
:96

:96
:96
:96
:96
:96
:96
:96

GTAATATGAATTGCAGATATTCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTTTGGTATTCCAAAGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTC
GTAATATGAATTGCAGATATTCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTTTGGTATTCCAAAGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTC
GTAATATGAATTGCAGATATTCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTTTGGTATTCCAAAGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTC
GTAATATGAATTGCAGATATTCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTTTGGTATTCCAAAGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTC
GTAATATGAATTGCAGATATTCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTTTGGTATTCCAAAGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTC
GTAATATGAATTGCAGATATTCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTTTGGTATTCCAAAGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTC
GTAATATGAATTGCAGATATTCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTTTGGTATTCCAAAGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTC
GTAATATGAATTGCAGATATTCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTTTGGTATTCCAAAGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTC
GTAATATGAATTGCAGATATTCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTTTGGTATTCCAAAGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTC
GTAATATGAATTGCAGATATTCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTTTGGTATTCCAAAGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTC
GTAATATGAATTGCAGATATTCGTGAATCATCGAATCTTTGAACGCACATTGCGCCCTTTGGTATTCCAAAGGGCATGCCTGTTTGAGCGTCATTTC

400
Ctrop-CN(5 :
Ctrop-TW(4 :
Ctrop-PK(5 :
M11-H2-030 :
M12-H3-061
:M9 - S-084 :
M12- S-103 :
M17- S-129 :
M21- S-157 :


60

TTACAGTCAAACTTGATTTATTATTACAATAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAC
TTACAGTCAAACTTGATTTATTATTACAATAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAC
TTACAGTCAAACTTGATTTATTATTACAATAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAC
TTACAGTCAAACTTGATTTATTATTACAATAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAC
TTACAGTCAAACTTGATTTATTATTACAATAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAC
TTACAGTCAAACTTGATTTATTATTACAATAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAC
TTACAGTCAAACTTGATTTATTATTACAATAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAC
TTACAGTCAAACTTGATTTATTATTACAATAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAC
TTACAGTCAAACTTGATTTATTATTACAATAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAC
TTACAGTCAAACTTGATTTATTATTACAATAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAC
TTACAGTCAAACTTGATTTATTATTACAATAGTCAAAACTTTCAACAACGGATCTCTTGGTTCTCGCATCGATGAAGAACGCAGCGAAATGCGATAC
200

Ctrop-CN(5 :
Ctrop-TW(4 :
Ctrop-PK(5 :
M11-H2-030 :
M12-H3-061 :
M9 - S-084 :
M12- S-103 :
M17- S-129 :
M21- S-157 :

40

TGCTTAATTGCACCACATGTGTTTTTTATTGAACAAATTTCTTTGGTGGCGGGAGCAATCCTACCGCCAGAGGTTATAACTAAACCAAACTTTTTAT
- GCTTA - TTGCACCACATGTGTTTTTTATTGAACAAATTTCTTTGGTGGCGGGAGCAATCCTACCGCCAGAGGTTATAACTAAACCAAACTTTTTAT

TGCTTA – TTGCACCACATGTGTTTTTTATTGAACAAATTTCTTTGGTGGCGGGAGCAATCCTACCGCCAGAGGTTATAACTAAACCAAACTTTTTAT
TGCTTA – TTGCACCACATGTGTTTTTTATTGAACAAATTTCTTTGGTGGCGGGAGCAATCCTACCGCCAGAGGTTATAACTAAACCAAACTTTTTAT
TGCTTA – TTGCACCACATGTGTTTTTTATTGAACAAATTTCTTTGGTGGCGGGAGCAATCCTACCGCCAGAGGTTATAACTAAACCAAACTTTTTAT
TGCTTA – TTGCACCACATGTGTTTTTTATTGAACAAATTTCTTTGGTGGCGGGAGCAATCCTACCGCCAGAGGTTATAACTAAACCAAACTTTTTAT
TGCTTA – TTGCACCACATGTGTTTTTTATTGAACAAATTTCTTTGGTGGCGGGAGCAATCCTACCGCCAGAGGTTATAACTAAACCAAACTTTTTAT
TGCTTA – TTGCACCACATGTGTTTTTTATTGAACAAATTTCTTTGGTGGCGGGAGCAATCCTACCGCCAGAGGTTATAACTAAACCAAACTTTTTAT
TGCTTA – TTGCACCACATGTGTTTTTTATTGAACAAATTTCTTTGGTGGCGGGAGCAATCCTACCGCCAGAGGTTATAACTAAACCAAACTTTTTAT
TGCTTA – TTGCACCACATGTGTTTTTTATTGAACAAATTTCTTTGGTGGCGGGAGCAATCCTACCGCCAGAGGTTATAACTAAACCAAACTTTTTAT
TGCTTA – TTGCACCACATGTGTTTTTTATTGAACAAATTTCTTTGGTGGCGGGAGCAATCCTACCGCCAGAGGTTATAACTAAACCAAACTTTTTAT


TẠP CHÍ Y - DƯỢC HỌC QUÂN SỰ SỐ 9-2014

Các chủng cho tỷ lệ đồng nhất cao, gần
tuyệt đối (99 - 100%). Đã xác định chuỗi
nucleotid của 6 mẫu Candida sp. là C.
tropicalis được sắp xếp so sánh và phân
tích thành phần nucleotid với 3 chuỗi C.
tropicalis thu thập từ Ngân hàng Gen là C.
tropicalis (Ctrop - CN(533 bp) - FJ662410) từ
Trung Quốc; Ctrop - TW(498bp) AB467290 từ
Đài Loan và (Ctrop - PK(548bp) JN159660 từ
Pakistan).

Truy cập Ngân hàng Gen và phân tích
51 chuỗi gen cho thấy: 27 mẫu C. glabrata,
15 mẫu C. albicans, 6 mẫu C. tropical,
2 mẫu C. parapsilosis, 1 mẫu C. krusei.

Như vậy, kết quả phân tích chuỗi gen

đã khẳng định 6 mẫu nấm gây nhiễm
trong mẫu nghiên cứu được xác định là C.
tropicalis.

1. Bộ Y tế. Hướng dẫn chuẩn Quốc gia về
về các dịch vụ chăm sóc sức khỏe sinh sản.
Nhà Xuất bản Y học. Hà Nội. 2003,tr.126-144.

KẾT LUẬN
Nghiên cứu định danh nấm ĐSS bằng
kỹ thuật PCR và giải trình tự gen trên 106
mẫu bệnh phẩm nấm sau nuôi cấy, kết
quả cho thấy: tổng số 106 mẫu được tách
chiết ADN, thực hiện PCR. Kết quả có 11
mẫu âm tính không cho sản phẩm, 95
mẫu có sản phẩm PCR, trong đó, 4 mẫu
cho sản phẩm kép, gồm 2 băng ADN
(0,5 kb và 0,9 kb). Khi tiến hành thæi gel,
51 chuỗi nucleotid đơn nhất sử dụng để
truy cập Ngân hàng Gen và phân tích
giám định loài.

69

Kết quả PCR và phân tích chuỗi gen cho
thấy hiện tượng nhiễm 2 loài nấm trên cùng
một cá thể do xuất hiện sản phẩm đa băng
ADN (khoảng 0,5 kb và 0,9 kb) và chuỗi
nucleotid lồng nhau khi giải trình tự.
TÀI LIỆU THAM KHẢO


2. Vũ Đức Bình, Cao Bá Lợi và CS. Ứng
dụng kỹ thuật PCR định danh nấm đường sinh
sản ở phụ nữ tuổi 18 - 49 đã có chồng tại
huyện Tam Nông, tỉnh Phú Thọ 2011 - 2012.
Tạp chí Phòng chống bệnh sốt rét và các bệnh
ký sinh trùng. Viện Sốt rét - Ký sinh trùng - Côn
trùng TW. 2013, số 2, tr.3-12.
3. Wei Y P Feng J, Lou Z C et al. Isolation
and genotyping of vaginal non-albicans Candida
spp in women from two different ethic groups
in Lanzhou China, Int. Juonal Gynaecol Obste.
2010, Vol 110 (3), pp.227-230.
4. Tamura K et al. MEGA 5 moleculer
evolutionary genetics analysis using maximum
Likeli - Hood, evolutionary distance and maximum
parsimony methods. Mol Biology. 2011, Vol 28,
pp.2731-2739.



×