đề cương luận văn thạc sĩ tạo DÒNG và xác ĐỊNH TRÌNH tự một số đoạn cDNAEST từ lá CHÈ TRỒNG tại THÁI NGUYÊN

ĐẠI HỌC THÁI NGUYÊN
ĐẠI HỌC THÁI NGUYÊN
TRƯỜNG
ĐẠI HỌC KHOA HỌC
TRƯỜNG ĐẠI HỌC KHOA HỌC

NGUYỄN THỊ HẠNH

TẠO DÒNG VÀ XÁC ĐỊNH TRÌNH TỰ MỘT SỐ
ĐOẠN cDNA/EST TỪ LÁ CHÈ TRỒNG TẠI THÁI
NGUYÊN

 

ĐỀ CƯƠNG LUẬN VĂN THẠC SĨ CÔNG NGHỆ SINH HỌC
Mã số: 60.42.02.01

Người hướng dẫn khoa học: TS. HOÀNG THỊ THU YẾN

Thái nguyên - 2015


Nội dung


Mở đầu
1. Lí do chọn đề tài
-

Chè là một loại cây công nghiệp dài ngày, lá chè được chế
biến để phục vụ đời sống con người.

-

Kích thước genome chè là rất lớn (khoảng 4 Gb) nên việc
giải mã toàn bộ genome đòi hỏi thời gian nhiều năm và chi
phí cao.

-

Trong những năm gần đây, người ta tập trung nghiên cứu
cây chè ở mức độ phân tử, đặc biệt việc phân tích
cDNA/EST chè đã đem lại nguồn thông tin khá lớn


- Phương pháp phân lập và phân tích các đoạn trình tự
gene biểu hiện (Expressed Sequence Tag, EST/cDNA) là
một trong các phương pháp sinh học phân tử hiện đại
nhằm tập trung nghiên cứu các gen chức năng.
- Để tạo tiền đề cho các nghiên cứu cơ bản tiếp theo về
cấu trúc genome và nghiên cứu sự biểu hiện các gen
chức năng ở chè, chúng tôi tiến hành thực hiện đề tài
nghiên cứu: “Tạo dòng và xác định trình tự một số đoạn
cDNA/EST từ lá chè trồng tại Thái Nguyên”.


2. Mục tiêu nghiên cứu
Tạo dòng và xác định trình tự một số đoạn
cDNA/EST từ lá chè trồng tại Thái Nguyên góp phần
xây dựng thư viện cDNA/EST ở chè

3. Nội dung nghiên cứu
• Nghiên cứu tạo dòng tái tổ hợp mang các đoạn

cDNA/EST ngẫu nhiên được tổng hợp từ mRNA của lá
chè trồng tại Thái Nguyên.
• Xác định và phân tích trình tự của các đoạn cDNA/EST

đã được tạo dòng từ lá chè trồng tại Thái Nguyên


Chương I. Tổng quan tài liêêu
1.1 Giới thiệu chung về cây chè
1.1.1 Phân loại
1.1.2  Nguồn gốc và phân bố
1.1.3  Đặc điểm thực vật của cây chè
1.1.4  Đặc điểm di truyền của cây chè
1.1.5  Thành phần hóa sinh trong cây chè
1.1.6  Giá trị của cây chè


Chương I. Tổng quan tài liêêu
1.2 Thư viện cDNA/EST
1.2.1 Giới thiệu về cDNA/EST
1.2.2 Phương pháp tạo ra thư viện cDNA/EST
1.3 Tình hình nghiên cứu gen và genome ở chè
1.3.1 Genome chè
1.3.2 Các nhóm gen chức năng ở chè
1.3.3 Thư viện cDNA/EST ở chè

Chương II. Vâêt liêêu và phương pháp nghiên cứu
2.1 Vật liệu
2.1.1 Nguyên liệu
- Lá của các giống chè trồng tại một số vùng trồng chè
ở Thái Nguyên: Chè San, chè Bát tiên...
2.1.2 Hóa chất, thiết bị
a) Hóa chất
Hóa chất phục vụ cho nghiên cứu tách chiết RNA
tổng số, tinh sạch mRNA, tạo cDNA, tách dòng và xác
định trình tự gen.
b) Thiết bị


Chương II. Vâêt liêêu và phương pháp nghiên
cứu
2.2. Phương pháp nghiên cứu
a) Phương pháp thu mẫu lá chè
b) Phương pháp sinh học phân tử
- Kỹ thuật tách chiết RNA tổng số từ lá chè
- Kỹ thuật tinh sạch mRNA
- Kỹ thuật phiên mã ngược tạo cDNA
- Kỹ thuật gắn cDNA vào vector
- Kỹ thuật biến nạp vector tái tổ hợp vào tế bào chủ
- Kỹ thuật xác định trình tự nucleotit
c) Phương pháp phân tích số liệu
- sử dụng các phần mềm blast, bioedit


Chương III: Dự Kiến Kết Quả Đạt Được
3.1 Dự kiến kết quả

Đề tài dự kiến thu được các kết quả chính:
- Tạo dòng được một số đoạn cDNA/EST từ lá
chè trồng tại Thái Nguyên.
- Xác định được trình tự của các đoạn
cDNA/EST đã được tạo dòng từ lá chè trồng
tại Thái Nguyên


3.2 Tiến độ thực hiện
STT

Các nội dung công việc thực hiện

Thời gian dự
kiến

1

Thu thập mẫu lá chè trồng tại Thái Nguyên

2

Tách RNA tổng số và tinh sạch mRNA

9/2015

3

Tổng hợp cDNA chè bằng phiên mã ngược

10/2015

4

Gắn các đoạn cDNA/EST vào vector tạo dòng

11/2015

5

Tạo dòng các đoạn cDNA/EST

12/2015- 
1/2016

6

Xác định trình tự các đoạn cDNA/EST đã được  2/2016-3/2016
tạo dòng

7

Chỉnh sửa và viết luâân văn

8/2015

4/2016-5/2016


XIN CẢM ƠN QUÝ HỘI ĐỒNG

VÀ CÁC BẠN
ĐÃ CHÚ Ý LẮNG NGHE