TR
NG
I H C S PH M HẨ N I 2
KHOA SINH- KTNN
KHịA LU N T T NGHI P
PHỂN L P, TUY N CH N X KHU N
Cị KH N NG SINH CELLULASE T I
XUÂN HÒA- PHÚC YÊN- V NH PHÚC
Chuyên ngành: Vi sinh v t
Xuân Hòa- 2010
L IC M N
Em xin bƠy t lòng bi t n sơu s c t i PGS.TS.
Nhung đƣ t n tình ch b o, h
inh Th Kim
ng dƣn em trong su t quá trình h c t p
vƠ th c hi n đ tƠi.
Em c ng xin chơn thƠnh c m n toƠn th các th y cô trong t vi
sinh đƣ ch b o vƠ giúp đ đ em có th hoƠn thƠnh đ
c khóa lu n t t
nghi p nƠy.
Em c ng xin chơn thƠnh c m n ban ch nhi m khoa SinhKTNN vƠ ban giám hi u nhƠ tr
th hoƠn thƠnh đ
ng đƣ t o đi u ki n t t nh t đ em có
c khóa lu n t t nghi p nƠy.
Cu i cùng em xin chơn thƠnh c m n gia đình vƠ b n bè đƣ đ ng
viên giúp đ em trong su t th i gian th c hi n khóa lu n nƠy.
Em xin chơn thƠnh c m n!
Xuân Hòa , tháng 05 n m 2010
Sinh viên
Hoàng Mai Linh
L I CAM OAN
Tôi xin cam đoan đây là công trình nghiên c u c a riêng tôi. Các k t
qu nghiên c u , s li u đ
c trình bày trong khóa lu n là trung th c và
không trùng v i k t qu c a tác gi khác.
Tác gi
Hoàng Mai Linh
CÁC T
VI T T T
VSV
: Vi sinh v t
ISP
: International Steptomyces Project
N
: Nit
C
: Cacbon
CFU
: Colony Forming Unit
HSKS
: H s i khí sinh
HSCC
: H s i c ch t
M CL C
Trang
M
U…………………………………………………………..........1
CH
NG 1. T NG QUAN TẨI LI U………………………………...4
1.1
V trí và phân lo i x khu n………………………………............4
1.2
c đi m sinh h c c a x khu n………………………………….9
1.3
1.4.
Cellulose và cellulase……………………………………………...12
Tình hình nghiên c u x khu n sinh cellulase
Vi t Nam và trên th gi i
…………………………………………………………………………….14
CH
NG 2. PH
NG PHÁP VẨ V T LI U NGHIểN C U………..15
2.1.
V t li u…………………………………………………………….15
2.2.
Ph
ng pháp nghiên c u…………………………………………..18
CH
NG 3. K T QU VẨ TH O LU N……………………………..20
3.1.
K t qu phân l p x khu n t đ t…………………………………..20
3.2.
3.3.
c đi m hình thái c a các ch ng đã phân l p đ
c……………….23
Xác đ nh kh n ng sinh cellulase c a x khu n…………………….30
K T LU N VẨ KI N NGH ……………………………………………..34
1.
K t lu n……………………………………………………………..34
2.
Ki n ngh ……………………………………………………………34
TẨI LI U THAM KH O…………………………………………………35
DANH M C B NG VÀ HÌNH TRONG KHÓA LU N
B NG
B ng
Tên b ng
Trang
3.1
Các ch ng x khu n phân l p t đ t mùn
20
3.2
Các ch ng x khu n phân l p t đ t ru ng
21
3.3
c đi m khu n l c c a các ch ng x khu n nghiên c u
24
3.4
c đi m khu n l c c a các ch ng x khu n nghiên c u
26
3.5
Hình d ng cu ng sinh bào t c a các ch ng x khu n
28-29
nghiên c u
3.6
K t qu th ho t tính cellulase trên môi tr
ng ch a
30
ng ch a b t
31
CMC
3.7
K t qu th ho t tính cellulase trên môi tr
gi y
HÌNH
Hình
Tên hình
Trang
3.1
22-23
3.2
M t s ch ng x khu n phân gi i cellulose phân l p t
đ t
Khu n l c x khu n
3.3
S c t tan c a m t s ch ng x khu n phân l p
27-28
3.4
Hình nh cu ng sinh bào t c a các ch ng x khu n
phân l p đ c
29-30
3.5
Hình nh ho t tính cellulase c a các ch ng x khu n
nghiên c u
32-33
25
Khãa luËn tèt nghiÖp §H
Tr- êng §HSP Hµ Néi 2
M
U
1. Lý do ch n đ tƠi
X khu n c trú ch y u trong đ t, chúng đóng vai trò quan tr ng trong
quá trình hình thành và phát tri n c a đ t. X khu n tham gia tích c c vào các
quá trình chuy n hoá và phân gi i nhi u h p ch t h u c ph c t p và b n
v ng nh cellulose, ch t mùn, kitin, keratin, lignin…góp ph n khép kín các
vòng tu n hoàn v t ch t trong t nhiên. X khu n còn giúp tích l y ch t mùn
làm nên đ phì nhiêu c a đ t.
Ngày nay x khu n đ
c ng d ng r ng rãi trong các ngành công
nghi p lên men (s n xu t axit h u c nh lactat, axetat, glutamat…). Ch bi n
t o các s n ph m enzyme, ng d ng enzyme do m t s x khu n có kh n ng
sinh ra nhi u nh : cellulase, proteinase… H u h t các loài x khu n thu c
gi ng Actinomyces đ u có kh n ng hình thành kháng sinh (streptomicine,
oreomicine…), m t s vitamin nhóm B (B1, B2, B6, B12) chúng đ
d ng trong công nghi p d
c ph m, y h c…[1].
Cellulose là thành ph n ch y u t o lên b khung x
v t. Trung bình m i n m
c ng
ng t bào th c
c tính có kho ng 30 t t n ch t h u c đ
c cây
xanh t ng h p trên trái đ t trong đó có 30% là thành t bào th c v t, thành
ph n ch y u c a thành là cellulose. Hàng n m trái đ t ph i nh n v m t
l
ng ch t th i kh ng l (ch t th i sinh ho t, ch t th i th c v t nh lá, cành
…, ch t th i công nghi p), thành ph n ch y u c a các lo i ch t th i này là
cellulose.
phân gi i l
ng l n cellulose này khu h vi sinh v t trong đ t
đóng vai trò không nh , mu n làm đ
c đi u đó các vi sinh v t ph i s n sinh
ra cellulase, enzyme này đóng vai trò phân gi i cellulose.
Ngoài protenase ng d ng trong công nghi p ch bi n s a, amylase
trong công nghi p r
Hoµng Mai Linh
u, bia thì cellulase c ng là m t trong nh ng enzyme
-1-
K32D - Sinh
Khãa luËn tèt nghiÖp §H
đ
Tr- êng §HSP Hµ Néi 2
c ng d ng r t nhi u trong công nghi p s n xu t gi y, công nghi p may,
s i… Cellulase ng d ng s n xu t th c n cho gia súc, x lý ch t th i nông
nghi p, s n xu t các lo i đ
ng probiotin mà nguyên li u dùng
đây ch y u
là dùng vi sinh v t s ng.
T nh ng lí do trên v i m c đích tìm hi u, làm quen v i ph
nghiên c u vi sinh v t (VSV) nói chung, ph
ng pháp
ng pháp nghiên c u x khu n
có kh n ng sinh cellulase nói riêng, tôi ch n đ tài: “Phân l p, tuy n ch n
x khu n có kh n ng sinh cellulase t đ t t i Xuân Hòa- Phúc Yên- V nh
Phúc”.
2. M c tiêu c a đ tƠi
- Phân l p, tuy n ch n x khu n có kh n ng sinh cellulase
các đ sâu:
0cm, 5cm, 10cm, 15cm, 20cm, 25cm, 30cm t hai lo i đ t mùn và đ t ru ng
t i Xuân Hòa – Phúc Yên – V nh Phúc.
- Nghiên c u các đ c đi m hình thái: h s i khí sinh (HSKS), h s i c ch t
(HSCC), s c t tan, cu ng sinh bào t c a các ch ng x khu n phân l p đ c.
- Th ho t tính enzyme cellulase c a m t s ch ng x khu n phân l p đ c.
3. N i dung c a đ tƠi
tài “ Phân l p, tuy n ch n x khu n có kh n ng sinh cellulase t đ t
t i Xuân Hòa – Phúc Yên – V nh Phúc” đ tìm hi u:
-
c đi m s phân b c a x khu n và kh ng đ nh đ
c vai trò c a
chúng trong đ t.
-
Nghiên c u đ c đi m hình thái (HSKS, HSCC, s c t tan, cu ng sinh
bào t …).
-
Th ho t tính sinh cellulase c a x khu n phân l p t đ t.
Hoµng Mai Linh
-2-
K32D - Sinh
Khãa luËn tèt nghiÖp §H
Tr- êng §HSP Hµ Néi 2
4. Ý ngh a c a đ tƠi
tài góp ph n t o c s khoa h c cho các ph
c i t o đ t, bón phân… theo h
c
ng th c canh tác, cày x i,
ng l i d ng VSV phân gi i cellulose, t ng
ng các quá trình phân gi i h p ch t h u c đ làm giàu dinh d
ng cho
đ t, t ng n ng su t cây tr ng.
M t khác đ tài còn cho phép tuy n ch n nh ng ch ng x khu n có kh
n ng sinh cellulase cao, t đó có th t o ra các ch ph m VSV ch các ch ng
x khu n này ph c v cho vi c x lí rác th i ( rác sinh h c), ch bi n th c n
gia súc probiotin…
Hoµng Mai Linh
-3-
K32D - Sinh
Khãa luËn tèt nghiÖp §H
Tr- êng §HSP Hµ Néi 2
CH
NG 1
T NG QUAN TÀI LI U
1.1.
V trí vƠ phơn lo i x khu n
1.1.1. V trí c a x khu n trong sinh gi i
Theo Krassinikov, x khu n đ
c tách thành l p riêng g m x khu n
b c cao có h s i phát tri n, có c quan sinh s n riêng và x khu n b c th p
có h s i không phát tri n, t bào hình que ho c hình c u.
Trong cu n “Bergey’s Manual” (1989) Bergey x p x khu n vào b
riêng (Actinomycetales). B x khu n thu c l p Thallobacteria, ngành
Firmicutes, gi i Bacteria, siêu gi i Prokaryota.
Theo h th ng phân lo i hi n nay, x khu n thu c nhóm VSV nhân
nguyên th y (Procaryota) thu c gi i kh i sinh (Monera) trong h th ng phân
lo i n m gi i hay b y gi i thì x khu n đ u thu c gi i vi khu n chu n
(Eubacteria), thu c siêu gi i nhân s .
B x khu n bao g m 10 h :
- Actinomycetaceae
- Actinoplanaceae
- Permatophilaceae
- Frankiaceae
- Micramonosporaceae
- Thermonosporaceae
- Mycobacteriaceae
- Norcarddiceae
- Streptomycetaceae
Hoµng Mai Linh
-4-
K32D - Sinh
Khãa luËn tèt nghiÖp §H
Tr- êng §HSP Hµ Néi 2
Trong đó Streptomycetaceae là lo i x khu n có h s i gi ng n m và đ
c
nghiên c u khá k .
1.1.2. Phơn lo i x khu n
1.1.2.1. L
c s phơn lo i x khu n
Krainki l n đ u tiên đ ra các ch tiêu m i trong vi c phân bi t các loài
khác nhau và đã s b phân lo i 17 ch ng thu c chi Actinomyces. Ông coi các
đ c đi m sinh lí, sinh hóa là m u ch t trong nguyên t c phân lo i [8].
Waksman và Cutis đã đ c p đ n d ng trung gian trong mô t phân lo i
c a mình và coi đ c đi m hình thái bào t là đ c tính quan tr ng nh t c a các
cá th và đ a ra m t s loài m i có ý ngh a [8].
Millard và Burr tìm ra 17 lo i, Jensen tìm ra 2 lo i m i, Dutche tìm ra
13 lo i m i [8].
1chi Streptomyces d a trên HSKS, HSCC và m t s đ c đi m trung gian
khác [8]
Waksman và Henrici đã đ a ra h thông phân lo i và đ n n m 1961 h
th ng phân lo i này đã đ
khu n đ
c s a đ i l i. Trong h th ng phân lo i này thì x
c x p thành 3 h , 10 chi và đã mô t đ
c h n 250 loài thu c chi
Streptomyces. H th ng phân lo i này d a vào màu s c HSKS, HSCC, hình
d ng bào t , chu i bào t …[8].
Krassinicov công b h th ng phân lo i n m tia m i d a tên h th ng
đã công b n m 1949, trong đó x khu n đ
c chia thành 6 h v i 26 chi [8].
Nh ng n m g n đây các h th ng phân lo i ngày càng nhi u, đ th ng
nh t trong cách mô t , ISP (International Streptomyces Project) đã nêu lên các
ph
ng pháp và môi tr
1.1.2.2. M t s ph
ng mô t [9].
ng pháp trong phơn lo i x khu n
Nh s phát tri n nhanh chóng c a khoa h c k thu t, s l ng x
khu n đ
c mô t ngày càng nhi u và chính xác d a trên c s s phát tri n
Hoµng Mai Linh
-5-
K32D - Sinh
Khãa luËn tèt nghiÖp §H
Tr- êng §HSP Hµ Néi 2
c a sinh h c phân t , hóa sinh h c, lí sinh h c…
và chính xác, ng
phân lo i nhanh chóng
i ta s d ng phân lo i s (Numberical taxonomy), nghiên
c u ch ng lo i phát sinh ( Phylogeny taxonomy).
Tuy nhiên hi n nay trong th c nghi m, ng
i ta v n ch y u d a vào
các đ c đi m hình thái, tính ch t nuôi c y, đ c đi m sinh lí, sinh hóa , mi n
d ch h c và sinh h c phân t .
1.1.2.2.1.
c đi m hình thái vƠ tính ch t nuôi c y
D a vào đ c đi m hình thái và tính ch t nuôi c y ng
i ta chia x khu n ra
làm 4 nhóm chính:
- Nhóm 1: G m các x khu n mang bào t rõ r t, sinh s n b ng bào t và
phân hóa thành HSKS, HSCC.
- Nhóm 2: G m các x khu n có bào t nang, h s i phân chia theo
h
ng vuông góc v i nhau tao thành c u trúc t
ng t nang bào t .
- Nhóm 3: G m các x khu n có d ng Norcadia, sinh s n b ng phân đ t
h s i.
- Nhóm 4: G m các x khu n có d ng Corynebacter và d ng c u, t bào
có hình ch T, V và th
ng không có h s i.
Trong nh ng n m g n đây, d a vào nghiên c u x khu n trên các môi
tr
ng khác nhau, ng
i ta chia hình d ng chu i bào t x khu n thành 6
ki u:
- Ki u S: Type “Sprina” – chu i bào t xo n.
- Ki u SRA: Type “Sprina- Rectinaculum- Apertum” – chu i bào t
xo n có d ng móc câu hay xo n không hoàn toàn.
- Ki u SRF: Type “Spirina- Rectus- Flexibilis” - chu i bào t xo n, cong
đ n th ng.
- Ki u RA: Type “Rectinaculum- Apertum” - chu i bào t có móc, có
khóa.
Hoµng Mai Linh
-6-
K32D - Sinh
Khãa luËn tèt nghiÖp §H
Tr- êng §HSP Hµ Néi 2
- Ki u RA- RF : Type “Rectinaculum Apertum- Rectus Flexibilis” –
chu i bào t có d ng móc hay xo n không hoàn toàn.
- Ki u RF : Type “Rectus- Flexibilis” – chu i bào t th ng đ n l n
sóng.
Hi n nay có r t nhi u khóa phân lo i x khu n nh ng có th g p thành hai
h th ng sau đây :
1. H th ng phân lo i ch y u gi a vào đ c đi m hình thái đ phân lo i
nhóm l n nh h , gi ng. Các phân lo i th p h n loài thì dùng đ c đi m
nuôi c y, sinh lí, sinh hóa đ phân lo i [8]
2. H th ng phân lo i ch y u gi a vào các đ c đi m sinh lí nh màu s c
h s i… đ phân nhóm, sau đó dùng các đ c đi m nuôi c y đ phân
lo i đ n loài. Nhóm h th ng này c a Waksman, Gause… các tác gi
đ u th ng nh t l y đ c đi m s d ng ngu n nit , cacbon làm y u t b
sung cho phân lo i đ n loài.
1.1.2.2.2.
Ph
c đi m hóa phơn lo i
ng pháp hóa phân lo i d a vào các d li u v đ nh tính, đ nh l
ng
các thành ph n hóa h c trong t bào VSV đ phân lo i, ch y u là các đ c
đi m sau :
- Type thành t bào
- Type peptidoglucan
- Axit mycolic
- Axit béo
- Menaquinon
- Type photpholipit
Trong type thành t bào, ng i ta phân thành t bào x khu n thành 4 d ng :
+ Type I: Thành t bào có L- ADP và glixin
+ Type II: Thành t bào có m- ADP và glixin
Hoµng Mai Linh
-7-
K32D - Sinh
Khãa luËn tèt nghiÖp §H
Tr- êng §HSP Hµ Néi 2
+ Type III : Thành t bào có m- ADP
+ Type IV : Thành t bào có m- ADP, đ
Trong type peptidoglucan ng
ng arabinose, galactose
i ta chia x khu n thành :
Type ph
Type
A (3-4)
B (2-4)
C u liên k t
A1
- Liên k t peptide tr c ti p
A2
- Chu i peptide bên
A3
- Glycerol ho c axit monocacboxylic
A4
- Axit dicacboxylic
B1
- Axit đ
B2
- Các axit amin đ
c diamine hóa
c diamine hóa
1.1.2.2.3. Phơn lo i s
Ph
ng pháp này d a trên s đánh giá v m c đ gi ng nhau gi a các
VSV trong m t s l n các đ c đi m ch y u là các đ c đi m hình thái, sinh
hóa, sinh lí đ so sánh các ch ng v i nhau t ng đôi m t theo công th c sau :
SAB = nS*100/ ( nS + nd )
Trong đó :
- SAB: m c đ gi ng nhau gi a hai cá th
- nS: t ng s các đ c đi m d
- nd: t ng s các đ c đi m d
ng tính c a 2 ch ng so sánh
ng tính c a ch ng này mà âm tính c a
ch ng kia
K t qu này đ
nhau mà các VSV đ
c bi u hi n trên s đ nhánh và tùy thu c m c đ gi ng
c x p vào các nhóm.
1.1.2.2.4. Nghiên c u v phát sinh ch ng lo i
Nh s s p x p phát sinh ch ng lo i mà các sinh v t đ
c x p vào h
th ng phân lo i g n t nhiên h n.
Các nghiên c u v di truy n phân t nh m xây d ng cây phát sinh
ch ng lo i b ng cách ti n hành so sánh các cao phân t ADN, ARN, protein
Hoµng Mai Linh
-8-
K32D - Sinh
Khãa luËn tèt nghiÖp §H
Tr- êng §HSP Hµ Néi 2
mà quan tr ng h n c là s s p x p các nucleotit c a rARN 16S. M c đ
gi ng nhau gi a hai cá th so sánh th hi n m i quan h gi a chúng.
1.2.
c đi m sinh h c c a x khu n
1.2.1.
c đi m hình thái c a x khu n
Tùy lo i môi tr
ng mà x khu n có hình thái khác nhau. Trên môi
tr
ng đ c, x khu n phát tri n thành nh ng khu n l c. Tùy theo loài, môi
tr
ng nuôi c y mà kích th
c màu s c khu n l c có th khác nhau nh : đ ,
da cam, vàng, nâu, h ng, xám… Khu n l c x khu n th
d ng nhung t , hay d ng màng d o và th
ng ch c, xù xì, có
ng có c u trúc 3 l p : l p ngoài có
c u trúc s i b n ch t, l p gi a có d ng c u trúc t ong và l p trong cùng có
c u trúc t
trong môi tr
ng đ i x p. C u trúc khu n l c x khu n v i h
ng t o ra HSCC và m t ngoài môi tr
ng sinh tr
ng t o ra HSKS.
kính h s i x khu n thay đ i trong kho ng 0,2-1,0µm đ n 2,0-3,0µm .
ng
ng
as
các x khu n có h s i phân nhánh m nh, không có vách ng n. Màu s c h
s i đa d ng, có th g p các màu tr ng, vàng, da cam, nâu, tím, đen… HSCC
có th sinh ra các s c t tan trong n
HSKS
t n cùng th
c ho c tan trong dung môi h u c .
ng là các chu i bào t có d ng xo n, l
n sóng, th ng,
vòng… ây là đ c đi m khá quan tr ng đ phân lo i x khu n [1]
Các bào t x khu n có th có hình tròn, b u d c, hình que, hay hình
tr … C u trúc b m t bào t có th có d ng nh n (Smooth), có gai (Spinny),
kh i u (Warty), n p nh n (Rugose) hay d ng tóc (Hairy). Hình d ng, kích
th
c, c u trúc b m t bào t c ng là m t trong nh ng ch tiêu quan tr ng đ
đ nh lo i x khu n [1].
Khi nuôi c y x khu n trong môi tr
ng d ch th , x khu n có th m c
thành d ng màng hay d ng vòng trên thành bình nuôi c y, trên b m t môi
tr
ng hay thành d ng b t ho c k t t a ki u vi khu n. Khi nuôi c y chìm trên
máy l c ho c n i lên men đ
Hoµng Mai Linh
c khu y đ o thì x khu n phát tri n thành d ng
-9-
K32D - Sinh
Khãa luËn tèt nghiÖp §H
Tr- êng §HSP Hµ Néi 2
s i bông ho c c n x p. Nh ng th
nh ng qu c u nh ch a đ y môi tr
ng g p h n c là x khu n phát tri n thành
ng, kích th
c t 0,1mm đ n 2-3mm.
1.2.2. C u t o c a x khu n
X khu n có c u t o t
ng đ i gi ng vi khu n g m có thành t bào,
màng t bào ch t, v t ch t nhân s và các h t d tr . X khu n thu c nhóm
VSV Gram (+). Thành t bào dày kho ng 20nm có vai trò duy trì hình d ng
h s i và b o v t bào, đ
c c u t o ch y u g m các l p glucopeptit, các
g c N-Acetylglucosamine liên k t v i N-Acetylmuramic (ho c NGlycolylmuramic, ví d nh chi Micromonospora).
C n c vào k t c u hóa h c có th chia thành t bào x khu n thành 4
nhóm sau :
- Nhóm 1 (Type I): có ch a L-ADP (L-Diaminopimelic) và glixin. G m
có các chi Streptomyces, Norcardioider…
- Nhóm 2 (Type II): có ch a m-ADP (meso- Diaminopimelic) và glixin.
G m các chi Micromospora, Actinoplans, Ampullariella…
- Nhóm 3 (Type III): có ch a m-ADP (meso- Diaminopimelic). G m có
Actinomadura, Actinobigfida , Micronobispora…
- Nhóm 3 (Type III):có ch a m-ADP (meso- Diaminopimelic) ,
đ
ng arabinose, galactose. G m có Norcadia, Pseudonocardia ,
Mycrobacterium…
1.2.3.
c đi m sinh lí , sinh hóa c a x khu n
X khu n là m t nhóm c th d d
ng, chúng s d ng đ
ng, r
u,
axit h u c , lipid, protein và nhi u h p ch t h u c khác làm ngu n cacbon.
Còn nitrat, nitrit, mu i amon, ure, pepton, cao th t… đ làm ngu n nit .
các
loài khác nhau thì kh n ng h p th các h p ch t này là khác nhau. Ph n l n
x khu n là VSV hi u khí, a m, nhi t đ thích h p cho sinh tr
tri n là 25-300C.
Hoµng Mai Linh
a s x khu n phât tri n t t trong môi tr
- 10 -
ng và phát
ng ki m.
K32D - Sinh
Khãa luËn tèt nghiÖp §H
Tr- êng §HSP Hµ Néi 2
X khu n là nhóm vi khu n Gram (+), đ c bi t khác v i các sinh v t
khác c a nhóm nhân s có t l (G+X) cao (trên 70%), trong khi đó vi khu n
khá th p (25-45%). M t trong nh ng đ c đi m đáng l u ý c a x khu n là
chúng không b n v ng v m t di truy n và th
phân t ADN.
ng x y ra s s p x p l i trong
i u này gây ra tính đa d ng c a hình thái, tính ch t, sinh lí,
sinh hóa c a x khu n (kh n ng đ ng hóa ngu n cacbon, nit , ho t tính
kháng sinh, tính kháng thu c, kh n ng phân gi i cellulose…).
1.2.4. Phơn b c a x khu n
X khu n là nhóm vi sinh v t phân b r ng rãi trong t nhiên. X
khu n có th phân l p t đ t, n
c, không khí, bùn, rác th i…
c bi t
trong đ t x khu n chi m s l ng r t l n. Theo Waksman thì trong đ t x
khu n chi m 9-45% t ng s các VSV. Và trong 1g đ t có ch a t i 29.00024.000.000 m m x khu n. Tuy nhiên tùy vùng đ t khác nhau trên th gi i
mà có s bi n đ i l n v s l
ng x khu n trong đ t, s l
ng x khu n
nam bán c u bao gi c ng cao h n b c bán c u. Ngoài ra s
l
ng x
khu n trong đ t còn ph thu c vào m c đ canh tác, đ phì nhiêu c a đ t,
m c đ che ph c a th c v t…
t giàu dinh d
nhi u x khu n h n so v i đ t nghèo dinh d
ng. Trong 1g đ t canh tác có
th phân l p đ
c 5.000.000 CFU/g x khu n.
nghèo dinh d
ng có s
l
ng, h u c , khoáng thì có
t vùng sa m c khô nóng,
ng x khu n ít h n, không dao đ ng trong
kho ng 10.000 – 100.000 CFU/g.
X khu n là nhóm VSV a trung tính hay ki m y u, do đó s phân b c a
x khu n trong đ t ph thu c vào đ pH c a đ t.
các đ t có đ pH trung tính
ho c h i ki m thì có m t đ x khu n cao h n so v i các vùng đ t có đ pH ki m
ho c axit.
ng th i s l ng x khu n còn ph thu c vào các th i đi m trong
n m. Do đó khi l y m u đ t nghiên c u c n ph i chú ý t i các đi u ki n nh thành
ph n l p đ t, sinh c nh, th i đi m l y m u, đ
Hoµng Mai Linh
- 11 -
m, nhi t đ …
K32D - Sinh
Khãa luËn tèt nghiÖp §H
Tr- êng §HSP Hµ Néi 2
1.2.5. Vai trò c a x khu n
X khu n là m t trong nhi u lo i VSV có ý ngh a trong t nhiên b i
vai trò tích c c tham gia vào quá trình chuy n hóa nh ng h p ch t trong đ t,
n
c…
X khu n có kh n ng sinh ch t kháng sinh, có 60-70% x khu n phân
l p t đ t nh Streptomyces, Actinomyces… có kh n ng này, các ch t kháng
sinh do chúng sinh ra đ
c s d ng r ng rãi trong y h c.
Ngoài ra x khu n còn có kh n ng phân gi i cellulose trong bã th i
nông nghi p, công nghi p th c ph m đ ch bi n th c n gia súc probiotin,
phân bón h u c , x lí rác th i…
1.3. Cellulose và cellulase
1.4.1. Cellulose
Cellulose là m t polysaccharite m ch th ng g m t 1400- 12.000 g c
-D-glucose liên kêt v i nhau b i các liên k t -1,4-glucoside. Trong phân t
cellullose các phân t
-D-glucose có c u trúc không gian d ng gh bành. Hai
phân t khác nhau quay góc v i nhau 1800. Cellulose là lo i h p ch t h u c
d i dào trong t nhiên chi m t i 40-50% hydratcacbon. Cellulose có c u trúc
không gian d ng s i song song, dài kho ng 5µm , đ
ng kính 3nm. . Các s i
này liên k t v i nhau b i các liên k t hidro và các liên k t vandervan t o
thành các bó s i nh có đ
ng kính 10-40nm g i là vi s i (microfibrin). Các
vi s i có c u trúc không đ ng nh t t o nên c u trúc mixen c a cellulose [8]
Cellulose d ng mixen g m 2 vùng :
- Vùng k t tinh (Crystolline regions) : Có các h s i ch t ch , đ m đ c
ng n c n s h p th n
c và ít ch u tác đ ng phân gi i. Vùng này
chi m 3/4 c u trúc cellulose.
- Vùng vô đ nh hình (Amorphous regions) : Có c u trúc kém ch t ch , d
b tr
ng lên và d b phân gi i.
Hoµng Mai Linh
- 12 -
K32D - Sinh
Khãa luËn tèt nghiÖp §H
Tr- êng §HSP Hµ Néi 2
Trong t nhiên cellulose khá b n v ng, không tan và b tr
th n
ng lên khi h p
c. Cellulose b phân h y khi đun nóng v i axit hay ki m
nhi t đ
khá cao ho c b phân gi i b i các cellulose sinh ra t nhi u lo i sinh v t.
1.4.2. Cellulase
Enzyme cellulase xúc tác cho qua trình chuy n hóa cellulose thành các s n
ph m hòa tan d s d ng. H thông cellulase g m 3 lo i chính sau:
- Endo- -glucanase hay 1,4- -D-glucanhydronase, cellobiohydrolase
(CBH), CMC-ase: Enzyme này t n công vào các đi m khác nhau trên
chu i
cellulose
c a
CMC,
cellulose
tr
ng
ph ng,
các
celloligosaccharide. Chúng phân c t các chu i cellulose m t cách ng u
nhiên, s n ph m t o thành là glucose và các oligosaccharide (có th t
3-6C ho c nhi u h n). S phân c t này hình thành các đ u kh t do,
t o đi u ki n cho exoglucanase ho t đ ng. B i v y cellulose vùng k t
tinh đ
c phân gi i tri t đ , hi u qu .
- Exo- -glucanase hay 1,4-
-D-glucan cellobiohydronase, avicelase:
enzyme này t n công vào đ u không kh c a cellulose và k t qu t o ra
các cellobinose.
-
-glucosidase hay cellobinose: Th y phân cellobinose và m t vài
celloligosaccharit thành glucose. Ho t tính c a
-glucosidase m nh
nh t trên cellobinose và gi m d n theo chi u dài chu i.
1.4.3. H enzyme phơn gi i cellulose
M t s nhóm VSV phân gi i đ
c cellulose là nh ph c h enzyme
cellulose g m 4 enzyme khác nhau tác d ng v i các m i liên k t c a
cellulose.
u tiên enzyme cellobihydrolase có tác d ng c t đ t liên k t hidro,
bi n cellulose t nhiên có c u hình không gian thành d ng cellulose vô đ nh
hình không có c u trúc l p.
Hoµng Mai Linh
- 13 -
K32D - Sinh
Khãa luËn tèt nghiÖp §H
Tr- êng §HSP Hµ Néi 2
Enzyme th hai là endoglucanase có kh n ng c t đ t kiên k t -1,4glucozit t o thành nh ng chu i dài.
Enzyme th
ba là exoglucanase ti n hành phân gi i các chu i trên
thành disaccharite g i là cellobinose.
Enzyme th t là -glucosidase ti n hành th y phân cellobinose thành
glucose.
1.4. Tình hình nghiên c u x khu n sinh cellulase
Vi t Nam và
trên th gi i
Hàng n m ho t đ ng trong ngành nông nghi p đã th i ra môi tr
ng
hàng ngàn t n ph ph m và đang là m t trong nh ng nguyên nhân gây ô
nhi m môi tr
ng. N u l ng ph ph m này đ
c x lý làm th c n gia súc
ho c phân bón vi sinh thì đó s là m t ngu n l i l n. Vì v y trên th gi i và
Vi t Nam đã có nh ng ngiên c u v kh n ng sinh cellulase c a các VSV
trong đ t đ phân gi i cellulose t các ph ph m nông nghi p.
c bi t x
khu n là m t loài VSV có kh n ng sinh cellulase khá m nh và có th cho
ngu n enzyme d i dào ph c v cho vi c x lý rác th i, ch bi n th c n gia
súc probiotin…
Vi t Nam, vi c nghiên c u v
cellulase c a nó v n còn khá m i.
x
khu n và kh
n ng sinh
ã có nhi u nghiên c u v cellullase
ng d ng trong th c n ch n nuôi nh ng đ i t
ng nghiên c u ch y u l i
là n m m c, n m men… nh : Nguy n Lân D ng (1991) đã lên men x p
s n b ng cách s
d ng Aspergillus hennebergii, Aspergillus niger s n
ph m dùng làm th c n cho trâu, bò. Chu Th Thanh Bình và c ng s
(2002) đã
ng d ng các ch ng n m men trong bã th i hoa qu giàu
cellulose làm th c n gia súc… Tuy nhiên Vi t Nam là đ t n
c s n xu t
nông nghi p là ch y u nên vi c nghiên c u v kh n ng sinh cellulase
c a x khu n có tri n v ng r t l n.
Hoµng Mai Linh
- 14 -
K32D - Sinh
Khãa luËn tèt nghiÖp §H
Tr- êng §HSP Hµ Néi 2
NG 2
CH
PH
NG PHÁP VÀ V T LI U NGHIÊN C U
2.1. V t li u
2.1.1. Nguyên li u
Các m u đ t l y t các lo i đ t thu c ph
ng Xuân Hòa – Phúc Yên –
V nh Phúc.
2.1.2. Hóa ch t
Các hóa ch t : K2HPO4, MgSO4.7H2O, NH4Cl, KNO3, NaNO3,
(NH4)2SO4, NaCl, FeSO4…..
Tinh b t tan, Sacharose, th ch agar, CMC (Cacboxyl Methyl
Cellulose), b t gi y…
2.1.3.D ng c vƠ thi t b nghiên c u
- D ng c : H p petri, ng nghi m, bàn trang, que c y, đèn c n, bình
tam giác, giá đ ng ng nghi m.
- Thi t b : T
m vi sinh (Heraeus –
c ), t s y (Heraeus –
c ),
n i h p (Tomy – Nh t B n), cân Sartorius, t c y vô trùng, t l nh.
2.1.4. Môi tr
ng phơn l p x khu n
- Môi tr
ng 1 : Gause I , pH = 7,0
Hóa ch t
Kh i l
Tinh b t tan
20g
KH2PO4
0,5g
KNO3
MgSO4.7H2O
NaCl
1g
5g
0,5g
H2 O
1000ml
FeSO4
Vt
Th ch agar
20
Hoµng Mai Linh
ng
- 15 -
K32D - Sinh
Khãa luËn tèt nghiÖp §H
- Môi tr
Tr- êng §HSP Hµ Néi 2
ng 2 : Czapeck- tinh b t , pH =7,2- 7,4
Hóa ch t
- Môi tr
Kh i l
Tinh b t tan
20g
KH2PO4
1g
NaNO3
3g
ng
MgSO4.7H2O
0,5g
KCl
0,1g
NaCl
0,1g
H2 O
1000ml
FeSO4
Vt
Th ch agar
20
ng 3 : Czapeck ( nguyên g c) , pH = 7,2
Hóa ch t
Kh i l
Sacharose
20g
K2HPO4
1g
NaCl
30g
MgSO4.7H2O
0,5g
H2 O
1000ml
FeSO4
Vt
Th ch agar
20g
Hoµng Mai Linh
ng
- 16 -
K32D - Sinh
Khãa luËn tèt nghiÖp §H
ng th ho t tính phơn gi i cellulose c a x khu n
2.1.5. Môi tr
- Môi tr
Tr- êng §HSP Hµ Néi 2
ng 1 : 1% CMC
Hóa ch t
Kh i l
ng
NaNO3
1,5g
KH2PO4
0,5g
MgSO4.7H2O
0,5g
KCl
0,5g
NaCl
10g
Th ch agar
20g
CMC
10g
H2O
1000ml
- Môi tr
ng 2 : 1% b t gi y
Hóa ch t
Kh i l
ng
NaNO3
1,5g
KH2PO4
0,5g
MgSO4.7H2O
0,5g
KCl
0,5g
NaCl
10g
Th ch agar
20g
B t gi y
10g
H2 O
1000ml
+ Chu n b n
c chi t đ t :
1kg đ t + 1l n
c s ch
H p kh trùng trong n i h p 30 phút
B sung thêm 1g CaCO 3
R il c l yn
c trong
Hoµng Mai Linh
- 17 -
K32D - Sinh
Khãa luËn tèt nghiÖp §H
2.2. Ph
Tr- êng §HSP Hµ Néi 2
ng pháp nghiên c u
2.2.1. Ph
ng pháp l y m u [3]
Trên m i lo i đ t dùng d ng c l y đ t
15cm, 20cm, 25cm, 30cm.
các đ sâu 0cm, 5cm, 10cm,
m i đ sâu thì l y kho ng 10g cho vào túi nilon,
trên túi có ghi đ sâu l y m u, n i l y m u, lo i đ t, sau đó bu c túi l i đ
tránh bay h i n
c và tránh các VSV l xâm nh p vào. M u đ t sau khi đ
thu th p c n ph i ti n hành phân l p ngay. N u ch a phân l p đ
b o qu n m u trong t l nh
2.2.2. Ph
c
c thì ph i
nhi t đ 4-50C.
ng pháp phơn l p x khu n t m u đ t [3]
L y 1g đ t cho vào ng nghi m ch a s n 10ml n
c c t vô trùng l c
đ u r i dùng pipet hút 1ml dung d ch đ t này cho sang ng nghi m có ch a
s n 9ml n
c c t vô trùng l c đ u thu đ
c d ch đ t v i đ pha loãng 10 -1
c ti p t c nh v y v i ng nghi m ti p theo ta có dung d ch đ t v i đ
pha loãng 10-2, 10-3,.... 10-10. Tùy theo m t đ phân b c a x khu n trong
m u đ t mà ta ch n d ch đ t có đ pha loãng thích h p.
đây tôi ch n d ch
đ t có đ pha loãng 10-5, 10-7. Dùng pipet vô trùng hút 0,5 ml dung d ch đ t
có đ pha loãng 10-5, 10-7 nh lên b m t th ch trong h p petri, l y bàn
trang th y tinh trang đ u kh p b m t th ch. V i m i m u đ t
trên c y lên 3 môi tr
nuôi trong t
các đ sâu
ng: Gause I, Czapeck- tinh b t, Czapeck . Sau đó
m 3-5 ngày
nhi t đ 30oC, theo dõi các khu n l c x khu n
m c trên b m t th ch. C y truy n nh ng khu n l c x khu n m c riêng
bi t không b nhi m sang các ng th ch nghiêng có ch a môi tr
I. Các gi ng này đ
c đ a vào t
m và gi
ng Gause
nhi t đ 30 oC sau 3- 4 ngà y
mang ra ki m tra l i n u th y ng nghi m nào không m c ho c b nhi m thì
lo i b c y truy n l i đ cu i cùng ta đ
c các ng nghi m có các ch ng x
khu n thu n ch ng.
Hoµng Mai Linh
- 18 -
K32D - Sinh