1
I HI
SINH HC
PROTEIN - ENZYME
c hin : n
Lp : K55 - CNSHB
: 550513
ng dn : TS. Nguyn
i, 2012
2
I
-
.
-
- .
1. (Ion Exchange Chromatography):
chung:
- d
trong
Nga MikhailTsvet (Mikhail Semyonovich Tsvet) 1903 khi
chlorophyll.
- trao ion pha
trao ion ionit).
- trao ion
do nhau ion trong dung (pha trung
trao ion ion) (pha
- trong
sinh.Theo IEC h protein
trong quy tinh bao
nhau): IEC: 75%; (AC): 60%;
gel (GF): 50% .
-
t
-
.
b) :
-
-
.
-
-
3
-
cellulose (CM-
yl-cellulose (DEAE-
c)
- .
- .
- .
2. (Gel-Filtration Chromatography):
-
3.
4
4. :
III :
(Gel-Filtration Chromatography):
5
Gel seph
m
(Ion Exchange Chromatography):
, hay
T
+
-
6
IV
m:
- m phosphate 0.1M, pH 7.5.
- Dung dch NaCl 2M (dung dch g mui
m phosphate).
2. Chun b gel:
-
-
- -
-
.
.
4. (equilibration):
5. (Binding):
.
6.
-
280
, 0,25
280
2 ml.
280
7
280
g
3
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
- :
-
IV
OD
280
(A)
OD
280
(A)
OD
280
(A)
1
0,066
16
0,038
31
0,334
2
0,076
17
0,034
32
0,322
3
0,108
18
0,062
33
0,294
4
0,048
19
0,056
34
0,286
5
0,026
20
0,076
35
0,252
6
0,026
21
0,122
36
0,238
7
0,020
22
0,134
37
0,218
8
0,024
23
0,190
38
0,238
9
0,018
24
0,220
39
0,244
10
0,020
25
0,256
40
0,264
11
0,194
26
0,278
41
0,158
8
12
0,040
27
0,308
42
0,162
13
0,046
28
0,326
43
0,166
14
0,028
29
0,338
15
0,076
30
0,326
Đ th nng đ protein trong sc k lc gel
0.000
0.050
0.100
0.150
0.200
0.250
0.300
0.350
0.400
0 5 10 15 20 25 30 35 40 45 50
ng nghim
OD 280 (A)
OD280 (A)
OD
280
(A)
OD
280
(A)
OD
280
(A)
1
0,272
16
0,028
31
0,212
2
0,110
17
0,020
32
0,210
3
0,112
18
0,041
33
0,195
4
0,106
19
0,116
34
0,192
5
0,126
20
0,106
35
0,294
6
0,482
21
0,120
36
0,070
7
0,067
22
0,128
37
0,223
8
0,241
23
0,158
38
0,191
9
0,123
24
0,106
39
0,163
10
0,066
25
0,101
40
0,208
11
0,002
26
0,096
41
0,099
12
0,005
27
0,088
42
0,133
13
0,046
28
0,290
14
0,041
29
0,109
15
0,021
30
0,155
9
Đồ thị nồng độ protein trong sắc ký trao đổi ion
0.000
0.100
0.200
0.300
0.400
0.500
0.600
0 5 10 15 20 25 30 35 40 45
Ống nghiệm
OD 280 (A)
OD280 (A)
V
-
-
-
t
-
-
280
-
-
-
-
-
-
10
-
11
I
-
- .
- .
II :
. Do
2+
)
- CO NH -
:
- Thuc th Biuret: 1.5 g cupric sulfate pentahydrate (CuSO
4
5 H
2
O)
6.0 g sodium potassium tartrate tetrahydrate (NaKC
4
H
4
O
6
4 H
2
O).
trong 500 ml c cc cho tan,
c cn th o qun trong l ti.
- c,
c dung dch g Bo qun
trong 2 tun.
2. L th ng chun:
Ly 6 ng nghi t 1 t tham gia phn
tng ng nghing sau:
Bng : L th ng chun BSA
STT
BSA 10
mg/ml
ml
H
2
O
(ml)
Thuc th
Biuret (ml)
N protein
(mg/ml)
1
0.0
1.0
4
0
2
0.2
0. 8
4
2
3
0.4
0. 6
4
4
4
0.6
0.4
4
6
5
0.8
0.2
4
8
12
6
1.0
0.0
4
10
L ng nghi nhi
quang OD
540
cng nghim t 2
6 sau khi tr OD
540
ca ng 1 s th biu din s
bi a m quang theo n protein chu th
ng chun).
ng protein b:
-
540
540
OD
540
2
0.003
4
0.012
6
0.024
8
0.034
10
0.039
Đường chuẩn BSA (phương pháp Biuret)
y = 0.0047x - 0.0058
R
2
= 0.9848
0
0.01
0.02
0.03
0.04
0.05
2 4 6 8 10
Nng đ protein (mg/ml)
OD540
OD540
Linear (OD540)
13
y = 0,0047x - 0,0058
(mg/ml)
540
(A)
-
MT1X
MC7
OD
540
(A)
0,310
0,311
0,322
134,383
134,809
139,489
134383
134809
139489
-
540
540
cao.
III ng n protein b :
h
-
ion
-
sphomolipden phos
660nm.
:
-
2
CO
3
(2%) pha trong 1000
-
4
.5H
2
Citrate Kali Tartrate 1%.
-
-
-
14
STT
BSA (1 mg/ml)
H
2
O
(ml)
N protein
1
20
0.98
20
2
40
0.96
40
3
60
0.94
60
4
80
0.92
80
5
100
0.90
100
6
120
0.88
120
-
-
.
ng protein b:
660
.
OD
660
20
0.060
40
0.105
60
0.153
80
0.173
100
0.206
120
0.271
15
y = 0,002x + 0,023
g/ml)
y
660
(A)
-
MT1X
MC7
OD
660
(A)
0,304
0,325
0,196
281
1510
173
-
660
660
IV :
Lowry, Smith copper
c
+
16
1. Dung dch thuc th Bradford 5X:
Ethanol tuyi
(99,99%). B sung 100 ml axit phosphoric (H
3
PO
4
85%). Hn h c
khu c cn th
ml (nu c lc). Chia nh nh o qun trong ti.
c khi s d ch thuc th
n t dung dch gc). Chng hn ly 10 ml Bradford 5X, b
c ct s c th 1X. Thuc th 1X ch
s d
:
-
- Albumin
-
:
-
-
-
-
:
a) Xây dựng đồ thị chuẩn:
17
Pha dung dch g
c ct). T dung dch g ch
chu gim dn (xem bng).
(*) ng s 5: lch t ng s 4, b
2
O
(**) ng s 6: lch t ng s 5, b
2
O
ng chun:
Chun b mng nghim s ng
Lng nghit theo bng sau:
ng nghim
1
2
3
4
5
6
i
chng)
BSA t ch chu
100
100
100
100
100
100
100 ml
H
2
O
Bradford 1X (ml)
5
5
5
5
5
5
5
H
2
0
0
0
0
0
0
100
i
ng nghim (mg)
1,25
1,0
0,8
0,5
0,25
0,125
0
Để tăng độ chính xác của đường chuẩn, tương ứng với mỗi nồng độ chuẩn BSA
nên lặp lại 3 lần (sử dụng 3 lần nhắc lại hoặc 3 ống nghiệm cho 1 lần).
Sau khi trng nghi trong ti nhi
kho hp th ng
chun bng Excel s dng kt qu
OD, trng protein. Tuy
t
ng eppendorf
1
2
3
4
5
6
H
2
420
450
460
950
*
**
N BSA g
60
50
40
50
*
**
Tng th
480
500
500
1000
*
**
N cu
1,25
1,0
0,8
0,5
0,25
0,125
1
2
3
4
5
6
7
8
18
b) Xác định hàm lượng protein bằng phương pháp Bradford:
Gi s t mu protein cha bi
dung dch BSA chun, lch protein cho ng nghim.
B sung 5 ml thuc th c ti
th chu OD.
c) Cách tính hàm lượng:
i chi c vng chun s
c n ng ca mu cng
5. D th ng chun:
OD
595
0.125
0.006
0.25
0.017
0.5
0.081
0.8
0.129
1
0.188
1.25
0.256
y = 0,222x 0,032
g/ml)
y
595
(A)
19
6. Kt qu m:
-
MT1X
MC7
OD
595
(A)
0,156
0,136
0,154
1,694
1,514
1,676
Nh
- OD
595
ca mu nm tr OD
595
cng chu
th chp nhn kt qu protein ca mu.
IV Nh
MT1X
MC7
134383
134809
139489
281
1510
173
1,694
1,514
1,676
T bng tng ky:
- N c t ln.
- N
n.
- m.
- Phn ng ca mi loi protein trong m
- Mu protein chun b c chun.
- t chun b c chun.
-
20
I
-
.
- .
II
-
-
g
-
-
-
- SDS-PAGE (sodium
-
--
-
-
-
--PA
21
-
-PAGE
III:
lang.
.
1.
- 1,5 M Tris HCl pH 8,8
- 0,4% SDS
- Tris base (KLPT 121,14) 90,83 g
- H
2
O 400 ml
-
- 10 % SDS 20 ml
- 500 ml
2.
- 0,5 M Tris-Cl pH 6,8
- 0,4% SDS
- Tris base 15,14 g
- H
2
O 200 ml
-
- 10 % SDS 10 ml
- 250 ml
3.
10 ml
20 ml
0,5 M Tris pH 6,8
5 ml
10 ml
0,25 M, pH 6,8
SDS
0,6 g
1,2 g
6 %
Glycerol
4 ml
8 ml
40 %
Bromopjenol Blue 1%
0,4 ml
0,8 ml
0,04 %
H
2
O
8 ml
16 ml
22
20
0
C.
4.
- 10X SDS Laemmli Running Buffer (0,25 M Tris, 1.92 M Glycine, 1 %
SDS, pH 8,3).
- Tris base 30,2 g
- Glycine 144 g
- SDS 10 g
-
2
O, c
5.
- Acrylamide 58, 42 g
- Bis-acrylamide 1,6 g
- H
2
O dn t t n 200 ml
6.
- Coomassie R250 1 g
- Glacial acetic acid 100 ml (10%)
- Methanol 400 ml (40%)
- H
2
O 500 ml
1000 ml
7. Dung dch ty (Destaining solution)
- Methanol 150 ml (15%)
- Acetic acid 100 ml (10%)
- H
2
O 750 ml
Tng s: 1000 ml
8.
- 10% SDS 10 g SDS/ 100 ml H
2
- 10% APS 10 g APS / 100 ml H
2
0
IV :
-
-
-
23
1.
V
Acrylamide (12 %)
H
2
O
(ml)
2,19
1,5 M Tris HCl pH 8,8
(ml)
1,5
29:1 Acrylamide:Bis
(ml)
2,5
10 % APS
(l)
3,25
TEMED
(l)
5
ml
6,19825 ml
2. Gel
V
Acrylamide (5 %)
H
2
O
(ml)
2,32
0,5 M Tris HCl pH 6,8
(ml)
1
29:1 Acrylamide:Bis
(ml)
0,68
10 % APS
(l)
16
TEMED
(l)
8
ml
4,024 ml
di protein:
- .
-
-
- .
- .
VI :
- Sau khi
- .
- .
- .
VII
1.
24
1
5
Tag
9
GFP
2
6
o
)
10
o
)
3
GFP
7
VK (ecoli)
11
BSA
4
BSA
8
12
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
2
-
25
-
-
-
-
-
- T
-
-
-
a) BSA:
-m 607 acid amin.
-
- 66463Da (= 66,5 kDa)
-
o
C: 4,7
-824 M
-1
cm
-1
279 nm
-
3
c)
b) GFP (
-
-