BAI TẬP THỰC HÀNH TIN SINH HOC

Trường ĐH Công nghiệp thực phẩm
TP.HCM
Khoa Công nghệ sinh học và
kỹ thuật môi trường
TIN SINH HỌC
Nhóm 7: Actin (human): GenBank: BC012854.
GVHD: Nguyễn Thị Liên Thương
1. Tô Thị Xuân
2. Nguyễn Thị Hoài Thắm
3. Trần Văn Năm
4. Lê Thị Diễm Hương
5. Thái Thị Thu Hiền
Danh sách nhóm:
Nộidung
1. Nhập mã số genbank vào trang NCBI,
Tìm kiếm đoạn trình tự DNA.
2. Tìm kiếm chuỗi protein trên NCBI thông
qua liên kết protein_id. Từ đó tìm kiếm 39
protein tương đồng và 1 protein không
tương đồng.
3. Vẽ cây sinh loài dựa trên thông tin về
chuỗi protein của 40 loài sinh vật vừa tìm
được.
1. TÌM KIẾMTRÌNH TỰ DNA
•
Nhập mã Genbank vào ô tìm kiếm như
hình dưới ở trang wed:
/>2. TÌM KIẾM TRÌNH TỰ PROTEIN
•

Nhập mã gen vào trang wed NCBI
•
Mở mega4 (alignment→show wed brower,
trang wed NCBI sẽ hiện lên, ta chay Blast,
dán trình tự protein mã hóa vào để chạy
blastp. Chèn 40 trình tự vào mega).
• Tương tự ta làm như vậy tìm được 40
trình tự protein
•
Sắp xếp thẳng hàng các trình tự: