B GIÁO DC VẨ ẨO TO
TRNG I HC M TP.HCM
BÁO CÁO KHÓA LUN TT NGHIP
Tên đ tài:
BC U TỊM HIU K THUT SINH HC
PHÂN T TRONG XỄC NH T BIN TRểN
GEN HBB GÂY BNH THIU MỄU HNG CU
HỊNH LIM
KHOA CÔNG NGH SINH HC
CHUYÊN NGÀNH: VI SINH ậ SINH HC PHÂN T
GVHD: ThS. Trng Kim Phng
SVTH: Nguyn Th Thu Ngân
MSSV: 1053012479
Khóa: 2010 - 2014
TP.HCM, tháng 06 nm 2014
Chuyên đ khóa lun tt nghip GVHD: ThS. Trng Kim Phng
Sinh viên thc hin: Nguyn Th Thu Ngân ậ 1053012479
LI CM N
Em xin gi lòng tri ơn đn cô Trng Kim Phng, ngi đƣ tn tình hng
dn và truyn đt kin thc cho em trong quá trình hc tp và giúp em hoàn thành
tt chuyên đ khóa lun tt nghip này.
Em cng chơn thƠnh cm n QuỦ Thy Cô khoa Công Ngh Sinh Hc ậ
Trng i hc M TP.HCM đƣ tn tình giúp đ và truyn đt kin thc cho em
trong quá trình hc tp.
Xin chân thành cm n cô Lê Huyn Ái Thúy, thy Lao c Thun đƣ tn tình
giúp đ và to điu kin thun li cho em trong sut thi gian thc hin chuyên đ
khóa lun tt nghip này.
Xin chân thành cm n Trung tơm chn đoán y khoa Medic đƣ to điu kin
thun li vƠ giúp đ em trong thi gian thc hin chuyên đ khóa lun tt nghip
này.
Em cng xin gi li bit n sơu sc đn gia đình, ngi thân và li cm n đn
bn bè đƣ đng viên em trong sut thi gian hc tp.
Sau cùng em xin chân thành cm n QuỦ Thy Cô đƣ dƠnh thi gian đc và
xem xét chuyên đ khóa lun tt nghip này ca em.
Sinh viên thc hin
Nguyn Th Thu Ngân
Chuyên đ khóa lun tt nghip GVHD: ThS. Trng Kim Phng
Sinh viên thc hin: Nguyn Th Thu Ngân - 1053012479 i
DANH MC CÁC CH VIT TT
ACS Acute chest syndrome
ARMS Amplification refractory mutation system
ASA Allele specific amplification
AS-PCR Allele specific ậ polymerase chain reaction
bp Base pair
ddNTP Dideoxynucleotide triphosphat
dNTP Deoxynucleotide triphosphat
EDTA Ethylendiamin Tetraacetic Acid
Glu Glutamic
Hb Hemoglobin
HbA Hemoglobin A
HbA
2
Hemoglobin A
2
HbAS Hemoglobin A ậ hemoglobin S
HBB Beta-hemoglobin
HbC Hemoglobin C
HbD Hemoglobin D
HbE Hemoglobin E
HbF Hemoglobin F
HbS Hemoglobin S
HbSbetathal Hemoglobin S ậ beta thalassemia
HbSC Hemoglobin S - hemoglobin C
Chuyên đ khóa lun tt nghip GVHD: ThS. Trng Kim Phng
Sinh viên thc hin: Nguyn Th Thu Ngân - 1053012479 ii
HbSD Hemoglobin S - hemoglobin D
HbSS Hemoglobin S - Hemoglobin S
IDT Integrated DNA Technologies
IQ Intelligence Quotient
Lys Lysine
NCBI National Center for Biotechnology Information
NIH National Institutes of Health
NST Nhim sc th
nu Nucleotide
OD Optical Density
PCR Polymerase chain reaction
PMC Pubmed Central
RFLP Restriction fragment length polymorphism
SCA Sickle cell anemia
SCD Sickle cell disease
SNP Single nucleotide polymorphism
SSCP Single strand conformation polymorphism
STT S th t
TAE Tris-acetate-EDTA
Tm Melting temperature
UV Ultraviolet
Val Valine
WHO World Health Organisation
Chuyên đ khóa lun tt nghip GVHD: ThS. Trng Kim Phng
Sinh viên thc hin: Nguyn Th Thu Ngân - 1053012479 iii
THUT NG DIN GII
Ting Vit Ting Anh
Bnh hng cu hình lim Sickle cell disease
t qu Stroke
Hi chng ngc cp tính Acute chest syndrome
Thiu máu hng cu hình lim Sickle cell anemia
Tn thng c quan mn tính Chronic organ damage
Chuyên đ khóa lun tt nghip GVHD: ThS. Trng Kim Phng
Sinh viên thc hin: Nguyn Th Thu Ngân - 1053012479 iv
DANH MC CÁC BNG
Bng I.1. Các đc đim lâm sàng ca bnh hng cu hình lim 6
Bng I.β. Các đc đim sinh hc ca bnh hng cu hình lim 7
Bng II.1. Thành phn phn ng PCR vi cp mi HBB1-F và HBB1-R 21
Bng II.2. Chu k nhit cho phn ng PCR vi cp mi HBB1-F và HBB1-R 22
Bng II.3. Thành phn phn ng PCR vi cp mi HBB2-F và HBB2-R 22
Bng II.4. Chu k nhit cho phn ng PCR vi cp mi HBB2-F và HBB2-R 23
Bng III.1. Các dng đt bin trên gen HBB 26
Bng III.2. T l các th đt bin trên gen HBB 27
Bng III.γ. Các phng pháp đc s dng trong xác đnh đt bin 27
Bng III.4. Thông tin trình t gen HBB thu thp trên NCBI 28
Bng III.5. Các h mi thu thp đc 29
Bng III.6. Các thông s vt lý ca mi 31
Bng III.7. Kho sát đ đc hiu ca mi HBB1-F và HBB1-R, HBB2-F và HBB2-
R bng phn mm Annhyb 32
Bng III.8. đc hiu ca h mi bng công c Blast 33
Bng III.9. Kt qu đo OD DNA b gen ngi ca 3 mu bnh phm 35
Bng 1. Thông tin mu bnh phm s dng trong nghiên cu 55
Chuyên đ khóa lun tt nghip GVHD: ThS. Trng Kim Phng
Sinh viên thc hin: Nguyn Th Thu Ngân - 1053012479 v
DANH MC HÌNH NH
Hình I.1: Hình nh ca gen HBB[44] 3
Hình I.2: Hình nh mô t các bc trong phn ng PCR (P1 vƠ Pβ: các đon mi-
Primers)[49] 15
Hình III.1: Hình nh mô t v trí khuch đi vùng gen HBB ca b mi HBB1-F và
HBB1-R, HBB2-F và HBB2-R 35
Hình III.2: Kt qu đin di kho sát nhit đ lai ca cp mi HBB1-F và HBB1-R
37
Hình III.3: Kt qu đin di sn phm PCR mu 1 vi cp mi HBB1-F và HBB1-R
38
Hình III.4a: Kt qu đin di sn phm PCR mu 2 vi cp mi HBB1-F và HBB1-
R 39
Hình III.4b: Kt qu đin di sn phm PCR mu 2 vi cp mi HBBβ-F và HBB2-
R 39
Hình III.5a: Kt qu đin di sn phm PCR mu 3 vi cp mi HBB1-F và HBB1-
R 2
Hình III.5b: Kt qu đin di sn phm PCR mu 3 vi cp mi HBBβ-F và HBB2-
R 2
Hình III.6: Kt qu Blast trình t A3-F trên NCBI 42
Hình III.7: Kt qu phơn tích tính tng đng ca trình t A3-F vi trình t gen
HBB và v trí bt cp ca mi HBB1-R 43
Hình 1: Mc đ tng đng ca trình t 7 (AF007546) và trình t 9 (U01317) trên
Seaview 53
Hình 2: Kt qu Blast ca trình t 7 (AF007546) trên NCBI 54
Hình 3: Kt qu kim tra đ đc hiu ca cp mi HBB1-F và HBB1-R bng phn
mm Annhyb 55
Hình 4: Mc đ tng đng ca trình t A3-F và trình t gen HBB 56
Hình 5: Mc đ tng đng ca trình t A3-R và trình t gen HBB 57
Chuyên đ khóa lun tt nghip GVHD: ThS. Trng Kim Phng
Sinh viên thc hin: Nguyn Th Thu Ngân - 1053012479 vi
MC LC
T VN
PHN I: TNG QUAN
I.1 TNG QUAN V BNH THIU MÁU HNG CU HÌNH LIM 3
I.1.1 Tng quan v gen HBB (beta-hemoglobin)[44] 3
I.1.1.1 Gen HBB[44] 3
I.1.2 Bnh hng cu hình lim (Sickle cell disease, SCD) 4
I.1.2.1 nh ngha bnh hng cu hình lim (SCD) 4
I.1.2.2 Các th bnh hng cu hình lim 5
I.1.2.3 Du hiu ca bnh hng cu hình lim 5
I.1.3 Bnh hng cu hình lim th HbSS[24] 7
I.2 TÌNH HÌNH BNH THIU MÁU HNG CU HÌNH LIM 8
I.2.1 Tình hình trên th gii 8
I.2.2 Tình hình bnh Vit Nam 10
I.3 BIN CHNG CA BNH THIU MÁU HNG CU HÌNH LIM 10
I.3.1 t qu 10
I.3.2 Hi chng ngc cp tính (ACS) 10
I.3.3 Tn thng c quan mn tính 11
I.4 TÁC NG CA BNH THIU MÁU HNG CU HÌNH LIM 11
I.5 CÁC PHNG PHÁP CHN OÁN BNH THIU MÁU HNG CU
HÌNH LIM
13
I.5.1 Xét nghim máu 13
I.5.2 Xét nghim cn lâm sàng 13
I.5.3 in di hemoglobin 13
Chuyên đ khóa lun tt nghip GVHD: ThS. Trng Kim Phng
Sinh viên thc hin: Nguyn Th Thu Ngân - 1053012479 vii
I.5.4 Phng pháp PCR (Polymerase chain reaction) 14
I.5.5 Phng pháp gii trình t 15
I.5.6 Mt s phng pháp khác 16
PHN II: VT LIU VẨ PHNG PHÁP NGHIÊN CU
II.1 VT LIU 18
II.2 PHNG PHÁP NGHIÊN CU 18
II.2.1 Khai thác d liu 18
II.2.2 Kho sát in silico ậ thit k mi 18
II.2.3 Kho sát thc nghim 19
II.2.3.1 Tách chit DNA 19
II.2.3.2 Kim tra cht lng DNA thu nhn bng phng pháp đo quang
ph 20
II.2.3.3 Phn ng PCR 21
II.2.3.4 Phng pháp đin di 23
II.2.3.5 Phng pháp gii trình t 24
PHN III: KT QU VÀ BÀN LUN
III.1 KHAI THÁC D LIU 26
III.1.1 Thu thp bài báo 26
III.1.2 Thu thp trình t gen HBB 27
III.1.3 Thu thp b mi xác đnh đt bin gen HBB 29
III.2 KHO SÁT IN SILICO 30
III.2.1 Trình t gen HBB 30
III.2.2 Trình t mi 30
III.3 KHO SÁT THC NGHIM 35
III.3.1 Kt qu đo OD 35
Chuyên đ khóa lun tt nghip GVHD: ThS. Trng Kim Phng
Sinh viên thc hin: Nguyn Th Thu Ngân - 1053012479 viii
III.3.2 Kt qu phn ng PCR vƠ đin di 36
III.3.3 Kt qu gii trình t 41
PHN IV: KT LUN VẨ NGH
IV.1 KT LUN 45
IV.1.1 Khai thác d liu 45
IV.1.2 Kho sát in silico 45
IV.1.3 Kho sát thc nghim 45
IV.2 NGH 46
TÀI LIU THAM KHO 47
PH LC 53
Chuyên đ khóa lun tt nghip GVHD: ThS. Trng Kim Phng
Sinh viên thc hin: Nguyn Th Thu Ngân - 1053012479 Trang 1
T VN
Thiu máu hng cu hình lim th HbSS (Sickle Hemoglobin) là mt dng
bnh lý di truyn v máu, tính cht gia đình, th đng hp, do đt bin đim (GAG
GTG) exon 1 ca gen – globin dn đn s thay th ca acid glutamic thành
valine (Glu6Val) v trí acid amin th sáu ca chui polypeptide ậ globin làm
bin đi HbA thành HbS. Th HbSS hình thành các t bào hng cu hình lim gây
thiu máu, dn đn s tc nghn mch máu, nhim trùng và tn thng mt s c
quan quan trng trong c th con ngi, có th làm gim tui th và gây t vong
cho ngi bnh.
Hin nay, trên th gii có nhiu công trình nghiên cu v chn đoán bnh
HbSS và các bnh lý khác thuc nhóm SCD (Sickle cell disease). Tuy nhiên, Vit
Nam vn cha có s liu v tình hình bnh cng nh các công trình nghiên cu
phân t v bnh HbSS. Do vy, nhm góp phn tìm hiu thông tin v bnh di truyn
HbSS Vit Nam, chúng tôi thc hin chuyên đ nghiên cu:
ắBC U TÌM HIU K THUT SINH HC PHÂN T TRONG
XỄC NH T BIN TRÊN GEN HBB GÂY BNH THIU MÁU HNG
CU HÌNH LIM”.
Mc tiêu nghiên cu tng quát:
Tìm hiu thông tin v bnh di truyn HbSS Vit Nam.
Ni dung nghiên cu:
Chúng tôi tin hành thu thp tài liu, đánh giá tình hình bnh hng cu hình
lim do đt bin trên gen – hemoglobin (HBB) Vit Nam và trên th gii.
Kho sát in silico, thit k mi phù hp nhm phát hin đt bin trên gen HBB
gây bnh thiu máu di truyn
Bc đu xây dng quy trình da trên k thut PCR nhm tìm hiu v đt
bin gây bnh thiu máu hng cu hình lim th HbSS trên gen HBB trên các mu
bnh phm.
Chuyên đ khóa lun tt nghip GVHD: ThS. Trng Kim Phng
Sinh viên thc hin: Nguyn Th Thu Ngân - 1053012479
PHN I: TNG QUAN
Chuyên đ khóa lun tt nghip GVHD: ThS. Trng Kim Phng
Sinh viên thc hin: Nguyn Th Thu Ngân - 1053012479 Trang 3
I.1 TNG QUAN V BNH THIU MÁU HNG CU HÌNH
LIM
I.1.1 Tng quan v gen HBB (beta-hemoglobin)
I.1.1.1 Gen HBB [44]
Gen beta-hemoglobin (HBB) mã hóa protein beta-globin, có kích thc 1606
bp (v trí nucleotide 5.246.695 ậ 5.248.300) trên NST 11p15.5.
Hình I.1: Hình nh ca gen HBB[44]
S đt bin trên gen HBB có th dn đn 2 dng bin th chính:
t bin đim trên trình t gen HBB dn đn s tng hp chui globin bt
thng (HbS, HbC, HbE, HbD, ).
Nhóm bin th thalassemia dn đn làm gim hoc bt hot s tng hp
chui globin.
Các bin th ca HBB có tn s xut hin khong 1-1,5/1000.
I.1.1.2 Hemoglobin (Hb)
Hemoglobin đc cu to bi bn chui globin bao gm 2 loi hemoglobin: [2]
Hemoglobin bào thai (HbF) có hai chui vƠ hai chui (ββ).
Hemoglobin ngi ln (HbA) có hai chui vƠ hai chui (ββ).
Mi tiu đn v protein ca hemoglobin mang mt phân t heme. Phân t này
cn cho các t bƠo máu đ đ ly oxy t phi và cung cp cho các t bào khp c
Chuyên đ khóa lun tt nghip GVHD: ThS. Trng Kim Phng
Sinh viên thc hin: Nguyn Th Thu Ngân - 1053012479 Trang 4
th. Mt hemoglobin hoàn chnh có kh nng mang bn phân t oxy cùng mt lúc
(mt phân t oxy gn vi mt phân t heme).[44]
I.1.2 Bnh hng cu hình lim (Sickle cell disease, SCD)
I.1.2.1 nh ngha bnh hng cu hình lim (SCD)
Bnh hng cu hình lim (Sickle cell disease - SCD) là mt dng bnh lý di
truyn v máu, th đng hp vi các dng đt bin đim trên gen HBB (HbS, HbC,
HbD, HbE, ầ) dn đn vic tng hp ậ globin bt thng to ra cu trúc phân t
hemoglobin hình lim làm gim hoc ngn cn quá trình vn chuyn O
2
đn t
bào.[1,24,44]
Các dng bt thng ca ậ globin thng xy ra vi mt tiu đn v ậ
globin b bin đi thành hemoglobin S (HbS), tiu đn v ậ globin còn li b đt
bin thành hemoglobin C (HbC), hemoglobin E (HbE), [44]
Các dng bnh hng cu hình lim:
Dng bnh HbSS: dng bnh hng cu hình lim HbSS xy ra do s đt bin
trên gen HBB đƣ to nên các tiu đn v ậ globin th HbS. Th
hemoglobin S đc hình thƠnh do đt bin đim (GAG GTG) exon 1
ca gen – globin dn đn s thay th ca acid glutamic thành valine v trí
acid amin th 6 (Glu6Val) dn đn vic to dng bt thng ca -globin là
HbS (hemoglobin S).[7,25,44]
Dng bnh HbSC: dng bnh hng cu hình lim HbSC xy ra do s đt
bin trên gen HBB đƣ to nên các tiu đn v ậ globin th HbS và HbC.
Th hemoglobin C (HbC) đc hình thành do s thay th ca glutamic bng
lysine v trí acid amin th 6 (vit là Glu6Lys). Mc đ nghiêm trng ca
dng bnh HbSC khá bin đng, nhng nó cng nghiêm trng nh bnh
thiu máu hng cu hình lim th HbSS.
Dng bnh HbSE: dng bnh hng cu hình lim HbSE xy ra do s đt bin
trên gen HBB đƣ to nên các tiu đn v ậ globin th HbS và HbE. Th
Chuyên đ khóa lun tt nghip GVHD: ThS. Trng Kim Phng
Sinh viên thc hin: Nguyn Th Thu Ngân - 1053012479 Trang 5
hemoglobin E (HbE) hình thành do s thay th glutamic bng lysine v trí
acid amin 26 (vit là Glu26Lys). Vi dng bnh nƠy, ngi bnh có th có
các du hiu và triu chng nghiêm trng liên quan đn thiu máu hng cu
hình lim nh các đt đau [10,44], thiu máu và chc nng lách bt
thng.[44]
Dng bnh HbSD: dng bnh hng cu hình lim HbSD xy ra do s đt
bin trên gen HBB đƣ to nên các tiu đn v ậ globin th HbS và HbD.
Th hemoglobin D (HbD) hình thành do s thay th glutamic bng glutamin
v trí acid amin 121.[2]
Mt dng bnh khác là HbS BetaThal, đc gây ra bi đt bin hemoglobin
S (HbS) và beta thalassemia xut hin cùng nhau. Các du hiu và triu
chng ca HbS betathalassemia thng nghiêm trng hn so vi dng HbSC
và có th bao gm đau nghiêm trng và tn thng c quan [44]. -
thalassemia đc hình thành do s thiu ht chui -globin.[2]
SCD là mt nhóm các ri lon di truyn mn tính Hb trong đó ngi bnh
tha hng hai gen globin đt bin t c cha ln m, mt trong nhng gen này luôn
luôn lƠ đt bin hng cu hình lim.[24]
I.1.2.2 Các th bnh hng cu hình lim [2]
Bnh hng cu hình lim có hai th: th đng hp t và th d hp t. Th d
hp t HbAS không có du hiu lâm sàng. Các th d hp t khác nh HbSC,
HbSD hoc HbS Thalassemie thì có du hiu lâm sàng.
I.1.2.3 Du hiu ca bnh hng cu hình lim [2]
Du hiu lâm sàng ca bnh hng cu hình lim
Chuyên đ khóa lun tt nghip GVHD: ThS. Trng Kim Phng
Sinh viên thc hin: Nguyn Th Thu Ngân - 1053012479 Trang 6
Bng I.1. Các đc đim lâm sàng ca bnh hng cu hình lim
Th bnh
Du hiu lâm sàng
Th
đng
hp t
HbSS
St, đau khp, đau bng, đau xng.
Vàng da, thiu máu, tan máu mn, có cn tan
máu.
Ri lon nhp tim, nghn mch.
Lách to, có th b tn thng gan, phi, thn,
mc treo rut hoc võng mc mt.
Th d
hp t
HbSD
Thiu máu nng, có cn tan máu.
Lách to.
HbSC
Thiu máu, tan máu mn tính, có cn tan máu.
Lách to.
au xng.
HbS Thalassemia
Thiu máu nng, có cn tan máu nh.
Lách to.
Du hiu sinh hc ca bnh hng cu hình lim
Chuyên đ khóa lun tt nghip GVHD: ThS. Trng Kim Phng
Sinh viên thc hin: Nguyn Th Thu Ngân - 1053012479 Trang 7
Bng I.2. Các đc đim sinh hc ca bnh hng cu hình lim
Th bnh
Du hiu sinh hc
Th
đng
hp t
HbSS
Huyt đ: thiu máu, tan máu mn. Hng cu
hình li lim: 40 ậ 100%.
Ty đ: hng cu tng, có hng cu hình lim.
Lách đ: thy nhiu hng cu lim.
Bilirubin gián tip gim nh.
in di Hb: thy HbS t 77 ậ 78%; HbA
2
2,5%; HbF 5 ậ 10% có khi ti 25%; HbA
không có.
Th d
hp t
HbSD
in di thy HbS và HbD.
HbSC
in di Hb thy HbS 52,5%; HbC 43,5%; HbF
3,5%.
HbS Thalassemia
in di Hb thy HbS và HbF.
HbAS
Hng cu hình li lim 10 ậ 40%.
in di Hb thy HbA và HbS.
I.1.3 Bnh hng cu hình lim th HbSS
Thiu máu hng cu hình lim th HbSS là mt bnh di truyn đng hp ln,
do đt bin đim (GAG GTG) exon 1 ca gen – globin dn đn s thay th
ca acid glutamic thành valine (Glu6Val) v trí acid amin th sáu ca chui
polypeptide ậ globin làm bin đi HbA thành HbS gây thiu máu hng cu hình
Chuyên đ khóa lun tt nghip GVHD: ThS. Trng Kim Phng
Sinh viên thc hin: Nguyn Th Thu Ngân - 1053012479 Trang 8
lim th HbSS [7,25,44]. Thiu máu hng cu lim là dng bnh lý ri lon liên
quan đn máu, nh hng ti phân t hemoglobin và làm cho toàn b t bào máu
thay đi hình dng. Kt qu ca đt bin này là vic sn xut mt dng bt thng
ca -globin là HbS.[44]
Ngi b bnh thiu máu hng cu hình lim th HbSS do nhn yu t di
truyn th HbS t c cha và m. Do đó ngi bnh có triu chng thiu máu
hng cu hình lim gây ra bi s thay th 2 tiu đn v ậ globin bng HbS.[25]
I.2 TÌNH HÌNH BNH THIU MÁU HNG CU HÌNH
LIM
I.2.1 Tình hình trên th gii
Bnh hng cu hình lim ln đu tiên đc công nhn là mt ri lon v huyt
hc do Herrick đa ra vƠo nm 1910. Nm 1949, Pauling công b nghiên cu v
mt loi huyt cu t bt thng chit xut t hng cu các bnh nhân thiu máu có
hng cu hình lim [15,25], đơy là mt cn bnh phân t [15].
Theo báo cáo ca T chc y t th gii (World Health Organisation, WHO)
các bnh v ri lon di truyn hemoglobin ban đu đc trng ca vùng nhit đi và
cn nhit đi nhng hin nay ph bin trên toàn th gii do di c [6,25]. Bnh thiu
máu hng cu hình lim là bnh ph bin trên th gii. Bnh thng gp nht
nhng ngi Châu Phi, các nc vùng a Trung Hi nh Hy Lp, Th Nh K
vƠ ụ, bán đo Rp, n và khu vc ting Tây Ban Nha Nam M, Trung M
(đc bit là Panama), và các b phn ca vùng bin Caribean.[25]
Bnh hng cu hình lim tác đng ti hn 1γ triu ngi trên toàn th gii và
nh hng đn hn 70.000 ngi ti Hoa K và có ít nht 75.000 ca nhp vin tn
trên 500 triu USD mi nm đ điu tr các bin chng ca bnh hng cu hình
lim (SCD) [19]. c tính có khong 1/500 ngi M gc Phi vƠ 1/1000 đn
1/1400 ngi M gc Tây Ban Nha b mc bnh này [21,24]. Có khong 2 triu
ngi M hoc 1/1β ngi M gc Phi mang đc đim hng cu hình lim [24].
Chuyên đ khóa lun tt nghip GVHD: ThS. Trng Kim Phng
Sinh viên thc hin: Nguyn Th Thu Ngân - 1053012479 Trang 9
Brazil s ph bin ca bnh thiu máu hng cu hình lim đc c tính t
β5.000 đn γ0.000 trng hp [21]. tui mc bnh Brazil t nh nhi đn
ngi trng thành vi t l t vong cao nht t 0 ậ 9 tui: 31%, t l nam n mang
bnh tng đng nhau vi t l là nam 47,6% và n 52,4% [31].
SCD là bnh ph bin Châu Phi ti tiu vùng Sahara ni st rét đc tìm
thy [24,14]. Các kiu gen đc trng lƠ HbSS vƠ HbSC chim u th trong dân s
mang bnh hng cu hình lim ca Ghana. T l th mang bnh trong dân s là 30%
trong khi có 2% tr s sinh Ghana b bnh hng cu hình lim [14]. Tanzania
bnh xut hin các nhóm tui t tr em đn ngi trng thành và có t l t
vong cao nht nhóm tui <5 tui (9,1%), tui mc bnh ca nam trung bình là 7
tui và tui mc bnh ca n trung bình là 9 tui [30].
n , hemoglobin hình lim là ri lon di truyn ph bin nht trong các
b lc Trung và Nam n . Hemoglobin hình lim ln đu tiên đc phát hin
t mt b lc min Nam n vƠo nm 195β [22]. n mi nm có khong
5.200 tr em sinh ra b bnh hng cu hình lim (SCD) [46].
Ri lon hemoglobin ban đu lu hƠnh 60% ca 229 quc gia, nh hng
đn 75% các ca sinh, nhng bơy gi ph bin 71% quc gia vi 89% ca sinh.
Theo T chc y t th gii (WHO) có ít nht 5,2% dân s th gii vƠ hn 7% ph
n mang thai mang mt bin th hemoglobin bt thng [14]. Hemoglobin S chim
40% ca các th mang nhng gơy ra hn 80% các ri lon: khong 85% các ri
lon hng cu lim, và hn 70% ca tt c các ca sinh b nh hng xy ra châu
Phi. Ngoài ra, ít nht 20% dân s th gii mang thalassemia.
Khong 1,1% các cp v chng trên toàn th gii có nguy c có con b mt ri
lon hemoglobin và 2,7/1000 trng hp th thai b nh hng. T l sinh b nh
hng c tính là 2,55/1000 tr em b nh hng nhiu nht các nc có thu nhp
cao vi mt ri lon mn tính, trong khi tr em đc sinh ra các nc có thu nhp
thp hu ht cht trc 5 tui: vi t l t vong tr em di 5 tui trên toàn th
gii là 3,4% hoc 6,4% châu Phi.
Chuyên đ khóa lun tt nghip GVHD: ThS. Trng Kim Phng
Sinh viên thc hin: Nguyn Th Thu Ngân - 1053012479 Trang 10
I.2.2 Tình hình bnh Vit Nam
Vit Nam cho đn nm β014, vn cha có s liu thng kê nào c th v
tình hình bnh thiu máu hng cu hình lim, điu này chng t các công trình
nghiên cu phân t v bnh này ti Vit Nam còn rt ít. Chính vì vy vic nghiên
cu này rt thit thc vƠ nên đc tin hƠnh đ tìm hiu tình hình bnh Vit Nam.
I.3 BIN CHNG CA BNH THIU MÁU HNG CU
HÌNH LIM
Bnh có ph rng gây ra rt nhiu bin chng. Ph bin nht là bin chng do
các t bào hng cu hình lim làm gim kh nng vn chuyn O
2
. tr em các
hng cu hình lim không có kh nng di chuyn đn các mô, c quan khác trong
c th ( đng trong lách). Do vy, bnh hng cu hình lim dn đn nguy c thiu
máu đt ngt có th gây t vong tr em. Tr em t 6 đn 18 tháng tui b bnh
thng b sng đau bƠn tay và/hoc bàn chân (hi chng tay-chân). Ngi trng
thành b bnh hng cu hình lim vi th HbSS có các bin chng nghiêm trng
nh đt qu, hi chng ngc cp tính và tn thng c quan.
I.3.1 t qu
t qu là mt bin chng nghiêm trng ca thiu máu hng cu hình lim
[13]. t qu do thiu máu cc b là mt trong nhng bin chng nghiêm trng
nht ca SCD vi mt t l cao giai đon sm vào la tui 7 và mt t l cao na
vƠo giai đon cui tui trng thành. Du hiu bao gm co git, tê chân tay, mt ý
thc. Mt cn đt qu có th gây t vong [48].
I.3.2 Hi chng ngc cp tính (ACS) [24]
ACS là mt bnh lý phi ph bin thng gn lin vi st, th nhanh, ho, khò
khè và khó th. Nó là mt quá trình cp tính và bin chng đe da tính mng ca
bnh nhân thiu máu hng cu hình lim. Nguyên nhơn thng gp do nhi máu
phi, các t bào hng cu hình lim chn mch máu, ty xng. ACS lƠ bin chng
ph bin th hai ca SCD, vi t l 1β,8 trng hp trên 100 bnh nhơn/nm. Bin
Chuyên đ khóa lun tt nghip GVHD: ThS. Trng Kim Phng
Sinh viên thc hin: Nguyn Th Thu Ngân - 1053012479 Trang 11
chng dng này gây ra khong β5% trng hp t vong đi vi bnh này.
I.3.3 Tn thng c quan mn tính [24]
ơy lƠ các đt đng hng cu trong lách, hoi t cp tính thn, bin chng
mt, hoi t.
đng hng cu trong lách lƠ cn đau cp tính t s phình to ca lách
do vic tn đng ca mt s lng ln hng cu hình lim. Bng s
phng lên và rt cng. Sau các đt lp đi lp li ca vic đng hng
cu trong lách, lá lách b so, x, co li và b h vnh vin.
Hoi t cp tính thn: du hiu ca tn thng thn có th bao gm
máu trong nc tiu, tiu không t ch, và thn to lên. Ngi ln b
SCD thì chc nng ca thn không tt, có th tin trin đn suy thn
mt t l nh bnh nhơn ngi ln và có th dn đn hi chng thn h.
Hoi t các vùng mang trng lng nh xng đùi ca hông và các
khp ln do kt qu ca thiu máu cc b, lp đi lp li vic nhi máu
khp, xng, vƠ các sn tng trng. Bin chng nƠy có liên quan đn
đau mn tính và tàn tt.
Bin chng mt: nhi máu trên khuôn mt có th dn đn sa mí mt,
khi nhng mch máu nh cung cp oxy cho võng mc, các mô mt
sau ca mt b chn bi các t bào hng cu hình lim, dn đn tình
trng gi là bnh võng mc, bnh võng mc tng sinh, xut huyt thy
tinh th và bong võng mc, dn đn mù lòa.
Bên cnh đó mt s bin chng gây ra bi HbSS bao gm: tng áp phi có th
gây ngt, t vong. Bin chng chi có th gây l loét, hoi t, có th dn đn nhim
trùng toàn thân và bin chng x hóa c.
I.4 TỄC NG CA BNH THIU MÁU HNG CU HÌNH
LIM
i vi tr em
Chuyên đ khóa lun tt nghip GVHD: ThS. Trng Kim Phng
Sinh viên thc hin: Nguyn Th Thu Ngân - 1053012479 Trang 12
Bnh nh hng đn sc khe ca tr em c v th cht ln trí tu. T l t
vong ca tr em di 5 tui chơu Phi lƠ 5% vƠ 16% trng hp t vong các
quc gia tây Phi.
Tr em vi SCA thng xuyên ngh hc nh hng đn quá trình tip thu kin
thc cng nh các hot đng khác. Ezenwosu và cng s (2013) đƣ ghi nhn kt
qu hc tp kém tr em vi SCA sau khi ngh hc thng xuyên do bin chng
hng cu hình lim M. SCA có th có mt tác đng trc tip vào kh nng trí tu
ca mt s tr em. Tr em vi SCA có nguy c kt qu hc tp kém vì ch s IQ
đc bit đn là nh hng đn kt qu hc tp [16]. T l đt qu do thiu máu
cc b nhng ngi có SCA lƠ cao hn bn ln tr em 2-15 tui, cao hn bt c
la tui khác [23,43]. Các trng hp b đt qu do thiu máu cc b chim 12%
các ca t vong tr em b bnh SCA [24]. Bnh nhân hng cu hình lim di 15
tui có nguy c phát trin tn thng mch máu nƣo hn so vi nhng ngi trên
15 tui [43]. Tr em SCA cng có th phát trin nhi máu não im lng, trong đó liên
quan đn suy gim nhn thc và kt qu hc tp kém [23]. Khong 11% bnh nhân
di 20 tui b đt qu [13]. 75% ca 300.000 ca sinh trên toàn cu b nh hng
[30,41], c tính 50-80% nhng bnh nhân này s cht trc khi trng thành
[30,40].
i vi ph n mang thai
S phát trin ca t cung chm, sy thai t nhiên và tin sn git có th xy ra.
Nhau thai tin đo và d bong do thiu oxy máu và nhi máu nhau thai. Khi sinh,
tr s sinh thng sinh non hoc có cân nng thp.[24]
Ngi ln
Khong 30% bnh nhơn ngi ln b thiu máu hng cu hình lim có tng áp
phi.[24]
Chuyên đ khóa lun tt nghip GVHD: ThS. Trng Kim Phng
Sinh viên thc hin: Nguyn Th Thu Ngân - 1053012479 Trang 13
I.5 CỄC PHNG PHỄP CHN OỄN BNH THIU MÁU
HNG CU HÌNH LIM
I.5.1 Xét nghim máu
Xét nghim máu có th kim tra hemoglobin S. Hoa K, xét nghim máu là
mt phn ca sàng lc s sinh thng đc thc hin ti bnh vin. ngi ln,
mu máu đc ly t tnh mch cánh tay. tr nh và tr s sinh, các mu máu
thng đc thu thp t mt ngón tay hoc gót chân. Mu nƠy đc gi đn phòng
thí nghim đ sàng lc hemoglobin S.
Xét nghim âm tính là không có t bào hng cu hình lim. Nu xét nghim là
dng tính, các xét nghim thêm cn đc thc hin đ xác đnh s có mt ca gen
t bào hng cu hình lim.[48]
I.5.2 Xét nghim cn lâm sàng
Huyt đ: th hin thiu máu hng cu bình thng. Xét nghim phiu đ máu
nhum khô có th nhìn thy vài t bào hng cu hình li lim (hình mt trng li
lim vi hai đu kéo dài và nhn). Thng hay thy tng bch cu trong thi gian
có cn.
Th nghim to hình lim: nhng hng cu hình lim s nhìn thy đc di
nh hng ca mt cht kh (nh mt git Metabisulfit Na 2% vào mt git máu),
cht kh oxy này s làm gim đ hòa tan ca hemoglobin S.
I.5.3 in di hemoglobin [47]
K thut đin di hemoglobin đc áp dng đu tiên vào thp niên 19γ0, sau đó
đc áp dng rng rãi trong chn đoán bnh ngi trong nhng nm 1950 ậ 1960.
K thut này cho phép phát hin các dng đa hình (polymorphism) ngi da trên
nguyên tc có s đt bin trên trình t DNA mã hóa cho gen có th dn đn s khác
bit trình t acid amin trong trình t protein.
K thut đin di hemoglobin giúp phân tách các th Hb khác nhau (s khác
bit mc tng amino acid).
Chuyên đ khóa lun tt nghip GVHD: ThS. Trng Kim Phng
Sinh viên thc hin: Nguyn Th Thu Ngân - 1053012479 Trang 14
I.5.4 Phng pháp PCR (Polymerase chain reaction)
Phng pháp PCR ra đi bi Karl Mullis và cng s vƠo nm 1985.[4,5]
Nguyên tc ca phng pháp PCR:
S sao chép DNA xy ra khi có s tham gia ca DNA polymerase giúp tng
hp mch DNA mi khi đon mi bt cp vi mch DNA khuôn vi vt liu là các
dNTP trong điu kin phù hp. Phn ng PCR là s khuch đi DNA mch khuôn
theo cp s nhân, mi phn ng PCR gm nhiu chu k ni tip nhau, mi chu k
gm ba bc:
Bc 1: Trong hn hp phn ng có đy đ thành phn (dNTP, Mg
2+
, Taq
polymerase, DNA mch khuôn). DNA mch khuôn b bin tính bi tác nhân nhit
đ thành mch đn. Nhit đ này phi cao hn Tm (melting temperature ậ nhit đ
nóng chy ca DNA) ca phân t DNA khuôn mu, thng vào khong 94 ậ 95
0
C
trong vòng 30 giây ậ 1 phút. ơy lƠ giai đon bin tính (denaturation).[4]
Bc 2: LƠ giai đon lai (hybridization), các mi bt cp đc hiu vi mch
khuôn nhit đ thích hp (thp hn Tm ca các mi). Nhit đ phn ng giai
đon này ph thuc vào Tm mi s dng, thng dao đng trong khong 40 ậ 70
0
C,
kéo dài t 30 giây ậ 1 phút.
Bc 3: nhit đ đc tng lên khong 72
0
C, là khong nhit đ thích hp cho
DNA polymerase hot đng giúp tng hp mch sn phm. Thi gian tùy thuc đ
dài ca trình t DNA cn khuch đi, thng kéo dài t γ0 giơy đn nhiu phút.
ơy lƠ giai đon kéo dài (elongation).
Chuyên đ khóa lun tt nghip GVHD: ThS. Trng Kim Phng
Sinh viên thc hin: Nguyn Th Thu Ngân - 1053012479 Trang 15
Hình I.2: Hình nh mô t các bc trong phn ng PCR (P1 và P2: các
đon mi-Primers) [49Error! Reference source not found.]
K thut PCR dùng đ chn đoán trc sinh ca bnh hng cu hình lim đƣ
đc các nhà khoa hc áp dng t nm 1989 [33] và hin nay vn lƠ phng pháp
thích hp đc la chn trong các phòng thí nghim nghiên cu v bnh lâm sàng.
I.5.5 Phng pháp gii trình t
K thut phân tích trình t gen bng máy t đng da trên nguyên tc Sanger
s dng 4 loi dideoxynucleotide triphosphat (ddNTP) đc đánh du bng 4 màu
hunh quang khác nhau đ kt thúc chui DNA. K thut phân tích trình t gen trc
tip bng máy t đng có th phân tích 300 ậ 1000 nucleotide trong 1 phn ng. K
thut đc ng dng ch yu đ phát hin nhanh đt bin đim hoc xóa đon ngn.
Phn ng gii trình t tng t nh PCR, nhng ch s dng mt mi duy nht
Bin tính
Bt cp
Kéo dài