Một số đặc điểm dịch tễ học hội chứng não cấp nghi ngờ do vi rút Banna tại một số địa phương ở Việt Nam

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO

BỘ Y TẾ

VIỆN VỆ SINH DỊCH TỄ TRUNG ƢƠNG
-----------------*-------------------

HOÀNG MINH ĐỨC

MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ HỌC HỘI CHỨNG
NÃO CẤP NGHI NGỜ DO VI RÚT BANNA TẠI
MỘT SỐ ĐỊA PHƢƠNG Ở VIỆT NAM

LUẬN ÁN TIẾN SỸ Y HỌC

HÀ NỘI – 2014


ii

BỘ GIÁO DỤC VÀ ĐÀO TẠO

BỘ Y TẾ

VIỆN VỆ SINH DỊCH TỄ TRUNG ƢƠNG
-----------------*-------------------

HOÀNG MINH ĐỨC

MỘT SỐ ĐẶC ĐIỂM DỊCH TỄ HỌC HỘI CHỨNG
NÃO CẤP NGHI NGỜ DO VI RÚT BANNA TẠI

MỘT SỐ ĐỊA PHƢƠNG Ở VIỆT NAM

Chuyên ngành
Mã số

: DỊCH TỄ HỌC
: 62.72.01.17

LUẬN ÁN TIẾN SỸ Y HỌC
Người hướng dẫn khoa học:
1. PGS. TS. PHAN THỊ NGÀ
2. GS. TS. VŨ SINH NAM

HÀ NỘI – 2014


iii

LỜI CẢM ƠN
Tôi xin gửi lời cảm ơn chân thành nhất tới Lãnh đạo Cục Y tế dự
phòng, Lãnh đạo Viện Vệ sinh Dịch tễ Trung ƣơng, Khoa Đào tạo và Quản lý
khoa học, và các thầy cô giáo đã tạo mọi điều kiện thuận lợi, giúp đỡ tôi trong
suốt q trình học tập và hồn thiện Luận án.
Tơi xin bày tỏ lòng biết ơn sâu sắc tới PGS.TS. Phan Thị Ngà và
GS.TS. Vũ Sinh Nam những thầy cô đã trực tiếp hƣớng dẫn, động viên khích
lệ, tận tình giúp đỡ và định hƣớng cho tôi trong suốt thời gian học tập, nghiên
cứu và thực hiện Luận án này.
Tôi xin gửi lời cảm ơn chân thành tới GS.TS. Phạm Ngọc Đính, Phó
Tổng biên tập Tạp chí Y học dự phịng đã đóng góp những ý kiến q báu để
tơi hồn thành Luận án.

Tôi xin bày tỏ lời cảm ơn chân thành tới ThS. Bùi Minh Trang, ThS.
Đặng Thị Thu Thảo, cử nhân Nguyễn Thành Ln Phịng thí nghiệm Vi sinh,
Khoa Đào tạo và Quản lý Khoa học; ThS. Đỗ Phƣơng Loan, PGS. TS.
Nguyễn Thị Hiền Thanh, Khoa vi rút; Cử nhân Nguyễn Thị n phịng thí
nghiệm Cơn trùng, Khoa Cơn trùng và Động vật Y học; ThS. Đỗ Thiện Hải,
Phó chủ nhiệm Khoa Truyền nhiễm bệnh viện Nhi Trung ƣơng; ThS. Nguyễn
Thị Tuyết, Phó chủ nhiệm Khoa Truyền nhiễm bệnh viện Đa Khoa tỉnh Bắc
Giang đã giúp đỡ tôi trong quá trình thực hiện các kỹ thuật xét nghiệm cũng
nhƣ hoàn thành việc điều tra, thu thập số liệu của nghiên cứu.
Tôi cũng xin gửi lời cảm ơn chân thành sự hợp tác và giúp đỡ của Giáo
sƣ Kouichi Morita, Khoa Vi rút, Viện Y học Nhiệt đới Trƣờng đại học
Nagasaki Nhật Bản trong nghiên cứu của đề tài.
Tôi vô cùng biết ơn sự quan tâm, động viên và giúp đỡ của gia đình,
bạn bè và các bạn đồng nghiệp trong q trình học tập, nghiên cứu và hồn
thành bản Luận án này.
Hà Nội, ngày 07 tháng 3 năm 2014
Tác giả luận án

Hoàng Minh Đức


iv

LỜI CAM ĐOAN
Đƣợc sự đồng ý của tác giả cho phép sử dụng số liệu của bài báo, của
đề tài nghiên vào nội dung luận án này. Tôi xin cam đoan đây là cơng trình
nghiên cứu của tơi, do chính tôi thực hiện dƣới sự hƣớng dẫn của các thầy cô
và Chủ nghiệm đề tài. Kết quả nêu trong Luận án là trung thực và chƣa từng
công bố trong bất kỳ một cơng trình nào khác.
Tơi xin chịu hồn tồn trách nhiệm về những lời cam đoan của tôi.

Hà Nội, ngày 07 tháng 3 năm 2014
Tác giả luận án

Hoàng Minh Đức


v

MỤC LỤC
Nội dung

Trang

Trang phụ bìa

ii

Lời cảm ơn

iii

Lời cam đoan

iv

Mục lục

v

Danh mục chữ viết tắt

viii

Danh mục hình, bảng biểu

ix

ĐẶT VẤN ĐỀ

1

CHƢƠNG I – TỔNG QUAN

3

1.1 Lịch sử hội chứng não cấp

3

1.1.1 Trên thế giới

3

1.1.2 Tại Việt Nam

6

1.2 Dịch tễ học hội chứng não cấp do vi rút Banna

7

1.2.1 Ổ chứa vi rút

7

1.2.2 Véc tơ truyền vi rút Banna

7

1.2.3 Khối cảm thụ

12

1.3 Đặc điểm hình thái, cấu trúc vi rút Banna

13

1.3.1 Đặc điểm hình thái

13

1.3.2 Đặc điểm cấu trúc của vi rút Banna

15

1.3.3 Cấu trúc genome của vi rút Banna

17

1.3.4 Cấu trúc và chức năng các protein của vi rút Banna

17

1.3.5 Phân loại và nguồn gốc vi rút Banna

19

1.3.6 Sự sao chép của vi rút

21

1.4 Đặc điểm hội chứng não cấp ở ngƣời do vi rút Banna

22

1.4.1 Sinh bệnh học

22

1.4.2 Đặc điểm lâm sàng

23


vi

Nội dung

Trang

1.4.3 Đáp ứng miễn dịch

24

1.4.4 Điều trị và dự phịng bệnh

24

1.5 Các phƣơng pháp chẩn đốn phịng thí nghiệm

25

1.5.1 Phƣơng pháp phát hiện nhanh vi rút

25

1.5.2 Phƣơng pháp phân lập vi rút

26

1.5.3 Phƣơng pháp chẩn đoán huyết thanh học

27

CHƢƠNG II - ĐỐI TƢỢNG, VẬT LIỆU VÀ PHƢƠNG PHÁP NGHIÊN
CỨU

31

2.1.

Thời gian và địa điểm nghiên cứu

31

2.2.

Đối tƣợng nghiên cứu

31

2.3.

Phƣơng pháp nghiên cứu

33

2.3.1. Thiết kế nghiên cứu
2.3.2.

Điều tra xác định các đặc điểm dịch tễ học bệnh nhân HCNC

33
33

2.4 Vật liệu và kỹ thuật xét nghiệm trong phịng thí nghiệm

35

2.4.1 Phƣơng pháp xét nghiệm kháng thể bằng kỹ thuật miễn dịch

enzyme gián tiếp phát hiện IgM kháng vi rút Banna – IgM INDIRECT
ELISA

35

2.4.2 Phƣơng pháp phân lập vi rút
2.5 Thống kê toán học và một số phần mềm tin sinh học sử dụng trong
phân tích về đặc điểm phân tử của các chủng vi rút Banna

37
50

2.5.1 Thống kê toán học

50

2.5.2 Sử dụng các phần mềm tin sinh học

50

2.6 Chấp thuận về đạo đức trong nghiên cứu y sinh

51

2.7 Hạn chế khi thiết kế nghiên cứu

52

CHƢƠNG III – KẾT QUẢ NGHIÊN CỨU

53

3.1 Mô tả một số đặc điểm dịch tễ học, lâm sàng của bệnh nhân hội chứng
não cấp nghi ngờ do vi rút Banna ở một số địa phƣơng củaViệt Nam,
2002-2012

53


vii

Nội dung

Trang

3.1.1 Mô tả tỷ lệ số mắc của bệnh nhân hội chứng não cấp do vi rút
Banna

53

3.1.2 Đặc điểm lâm sàng của bệnh nhân hội chứng não cấp do vi rút
Banna

58

3.2 Xác định tỷ lệ nhiễm vi rút Banna trong quần thể muỗi thu thập ở một
số địa phƣơng ở Việt Nam

64

3.2.1 Kết quả thu thập muỗi trong các năm 2001-2011

64

3.2.2 Kết quả phân lập vi rút Banna từ các mẫu muỗi thu thập

68

3.3 Một số đặc điểm sinh học phân tử của vi rút Banna phân lập đƣợc ở
Việt Nam

75

3.3.1 Phân bố vi rút Banna ở Việt Nam

75

3.3.2 Đặc điểm dịch tễ học vi rút Banna ở Việt Nam

77

3.3.3 Kết quả giải trình tự nucleotide của vùng gen mã hóa số 12

82

3.3.4 Đặc điểm các acid amin thay thế của vùng gen mã hóa số 12

84

CHƢƠNG IV – BÀN LUẬN

86

4.1 Mô tả một số đặc điểm dịch tễ, lâm sàng hội chứng não cấp nghi ngờ
do vi rút Banna ở một số địa phƣơng của Việt Nam, 2002 - 2012

86

4.2 Xác định tỷ lệ nhiễm vi rút Banna trong quần thể muỗi thu thập ở một
số địa phƣơng ở Việt Nam

97

4.3 Xác định một số đặc điểm sinh học phân tử của vi rút Banna phân lập
đƣợc ở Việt Nam

102

KẾT LUẬN

108

KIẾN NGHỊ

111

DANH MỤC CÁC CƠNG TRÌNH ĐÃ CƠNG BỐ

112

TÀI LIỆU THAM KHẢO

114

PHỤ LỤC

129


viii

DANH MỤC CÁC CHỮ VIẾT TẮT
BAV
BAV-Ch
BAV-In
CTFV
DENV
dsRNA
EEE
EYAV
GenBank
GenBank
Database
HCNC
HIV
KDV
LAC
MAC-ELISA
Motif
NCR

NLRV
POW
RT-PCR
RRSV
RNA
SLE
SDS-PAGE
VNNB
VIB
VP
WEE

Banna vi rút
Banna vi rút Trung Quốc
Banna vi rút Indonesia
Colorado tick f�u quả phòng bệnh bằng


lxxii

vác xin ở tỉnh Thái Bình, 2003 -2007". Tạp chí Y học dự phòng, tập
XVIII, số (3/95), tr. 54 – 59.
4.

Bộ Y tế, Viện Vệ sinh Dịch tễ Trung ƣơng (2001). Phân tích số liệu các
bệnh truyền nhiễm ở Việt Nam (1996 – 2000), tr. 9 – 15.

5.

Phạm Ngọc Đính, Phạm Thị Sửu, Lê Hồng Phong, Nguyễn Bình Nguyên

(2005). Đặc điểm dịch tễ học viêm não cấp do vi rút tại một số địa
phƣơng miền Bắc 2003 – 2004. Tạp chí Y học dự phịng, tập XV, số 4
(75), tr. 64 – 68.

6.

Trịnh Quân Huấn. Bệnh viêm não Nhật Bản. Nhà xuất bản Y học
(2010) tr. 1 – 85.

7.

Hoàng Thủy Long (1991), "Kỹ thuật xét nghiệm vi sinh vật Y học", Nhà
xuất bản Văn hóa, tr. 386-393.

8.

Đỗ Phƣơng Loan, Đặng Đình Thoảng, Bùi Minh Trang, Nguyễn Viết
Hồng, Lê Thị Hiền Thu, Phan Thị Ngà. (2008), "Phát hiện tần suất
nhiễm vi rut viêm não Nhật Bản trong quần thể lợn ở Hà Nam bằng kỹ
thuật GAC-ELISA", Tạp chí Y học dự phòng, tập 2, số 18, tr 12-17.

9.

Phan Thị Ngà, Lê Kim Phƣợng và cộng sự (1996). “Phân lập vi rút viêm
não Nhật Bản từ bệnh nhân ở miền Bắc Việt Nam trong các năm 1984 –
1993 bằng chuột ổ”. Tạp chí vệ sinh phịng dịch, tập VI số 1 (26), tr. 2529.

10. Phan Thị Ngà, Nguyễn Thị Kiều Anh, Huỳnh Phƣơng Liên, Trần Văn
Tiến (2000), "Sự thay đổi giảm tỷ lệ mắc bệnh VNNB (qua chẩn đoán
huyết thanh) ở miền Bắc Việt Nam, 1998", Tuyển tập cơng trình 1997 –

2000, Viện Vệ sinh Dịch tễ Trung ương, Nhà xuất bản Y học, Hà Nội, tr.
72-75.


lxxiii

11. Phan Thị Ngà, Nguyễn Thị Kiều Anh, Huỳnh Phƣơng Liên và cộng sự
(2000), "Giám sát huyết thanh học bệnh VNNB, 1998-1999", Tuyển tập
cơng trình 1997 - 2000 Viện Vệ sinh Dịch tễ Trung ương, Nhà xuất bản
Y học, Hà Nội, tr. 84-87.
12. Phan Thị Ngà, Nguyễn Thị Kiều Anh và cộng sự (2002), "Giám sát,
chẩn đoán VNNB ở Việt Nam, 2000 – 2001", Tạp chí Y học Dự phịng,
tập XII, số 4 (55), tr. 5 - 10.
13. Phan Thị Ngà and K. Morita (2004), "Phát hiện vi rút viêm não mới từ
dịch não tủy của bệnh nhân có hội chứng não cấp ở miền Bắc Việt
Nam", Tạp chí Nghiên cứu Y học, tập 29, số 3, tr. 13-17.
14. Phan Thị Ngà, Vũ Sinh Nam, Masahiro Takagi (2004). Nghiên cứu sự
tồn tại của vi rút viêm não Nhật Bản trong tự nhiên. Tạp chí Y học dự

phịng tập XIV, số 1 (64) tr. 21 – 26.
15. Phan Thị Ngà (2004), "Phân lập các vi rút Arbo từ muỗi bắt tại thực địa
miền bắc và miền trung Việt Nam, 9/2001-12/2003", Y học Việt Nam,
Tập 31, số 5, tr. 22 – 26.
16. Phan Thị Ngà (2004), "Viêm não Nhật Bản và các kỹ thuật chẩn đoán",
Nhà xuất bản Y học.
17. Phan Thị Ngà, Mary B. Crabtree (2004), "Ứng dụng kỹ thuật RT - PCR
để chọn mẫu dịch não tủy cho phân lập vi rút do muỗi truyền từ bệnh
nhân có hội chứng não cấp ở miền Bắc Việt Nam", Tạp chí nghiên cứu Y
học

30, số 14, tr. 5 – 10.

18. Phan Thị Ngà, Đoàn Hải Yến (2005), "Chế tạo kháng nguyên vi rút Nam
Định góp phần chẩn đốn căn ngun vi rút gây hội chứng não cấp", Tạp
chí Vệ sinh phịng dịch, tập XV, số 5(70), tr. 62-67.


lxxiv

19. Phan Thị Ngà, Nguyễn Thanh Thủy, Bùi Minh Trang, Nguyễn Thị Tuấn,
Đặng Tuấn Đạt và Nguyễn Trần Hiển (2007), "Phát hiện một thành viên
vi rút thuộc họ Reoviridae gây hội chứng não cấp ở tỉnh Gia Lai", Tạp
chí Y học dự phòng, tập XVII, số 2(87), tr. 5-10.
20.

, vi

Culex quinque fasciatus

".
21. Phan Thị

3 (88), tr.10-15.
, Đỗ Phƣơng Loan, Nguyễn Viế

, Bùi Minh Trang,

Lê Thị Hiền Thu, Trầ
, 1998 –
2007.

,t

5 (113), tr. 29- 35.

22. Phan Thị Ngà, Nguyễn Viết Hoàng, Bùi Minh Trang, Đỗ Phƣơng Loan,
Nguyễn Thanh Thuỷ, Trần Quang Huy, Hoàng Minh Đức, Đặng Đức
Anh, Nguyễn Trần Hiể
, 2007.

,t

6(114), tr. 188 - 197.
23. Phan Thị Ngà, Đỗ Phƣơng Loan, Nguyễn Hải Tuấn, Bùi Minh Trang,
Nguyễn Viết Hoàng,

, Đặng Thị Trang, Nguyễn Văn

Thơm, Lâm Văn Tuấn, Dƣơng Thị Hiển, Đặng Thanh Minh, Nguyễn
Trần Hiển (2013). Tác động của vắc xin phòng viêm não Nhật Bản đến
đặc điểm dịch tễ huyết thanh học của viêm não Nhật Bản ở Việt Nam.
Tạp chí Y học dự phịng, tập XXIII, số 11 (147), tr. 63 – 70.
24. Đặng Thị Trang, Nguyễn Văn Thơm, Phan Thị Ngà (2012). Hiệu quả
phòng bệnh bằng vacxin viêm não Nhật Bản bất hoạt để phòng bệnh cho


lxxv

trẻ 1-5 tuổi, ở tỉnh Thái Bình, 2004-2010. Tạp chí Y học dự phòng, tập 22,
số 4 (131), tr. 78 - 83.

25. Nguyễn Đỗ Quyªn (1991), "Kỹ thuật thuật sản xuất kháng thể đơn dòng,
Kỹ thuật xét nghiệm vi sinh vật y học", Nhà xuất bản Văn hóa, tr. 371374.
26. Nguyễn Thanh Thủy, Nguyễn Kim Giao, Phạm Thị Ngà (2004), "Nhận
dạng vi rút viêm não mới đƣợc phân lập từ dịch não tủy của bệnh nhân
có hội chứng não cấp bằng kỹ thuật kính hiển vi điện tử", Tạp chí Y học
thực hành, số 11, tr. 57 – 59.
27. Nguyễn Thanh Thủy, Bùi Minh Trang, Nguyễn Thị Tuấn, Phan Thị Ngà
(2008), "Đặc điểm hình thái và sự nhân lên của vi rút Banna trên tế bào
muỗi Aedes albopictus dòng C6/36", Tạp chí Y học dự phịng, tr. 35-40.
28. Nguyễn Thị Tuấn, Bùi Minh Trang, Đỗ Phƣơng Loan, Nguyễn Viết
Hoàng, Lê Thị Hiền Thu, Phan Thị Ngà (2009). "Xác định sự lƣu hành
của vi rút Banna ở Việt Nam và thử nghiệm chế tạo kháng thể kháng vi
rút", Tạp chí Y học dự phòng, tập XIX, số 8(107), tr.15-18.
29. Nguyễn Thị Hiền Thanh (2003), "Bƣớc đầu tìm hiểu căn nguyên gây
viêm màng não ở trẻ em do một số vi rút đƣờng ruột", Tạp chí Y học dự
phịng, tập 8, số 4 (6), tr. 5-12.
30. Đặng Đình Thoảng, Nguyễn Ngọc Tâm, Bùi Minh Trang, Nguyễn Thị
Yên, Phan Thị Ngà (2008), "Nghiên cứu sự biến động và xác định véc tơ
truyền vi rút viêm não Nhật Bản tại tỉnh Hà Nam, 2006 – 2007", Tạp chí
Y học dự phịng, tập XVIII, số 3 (95), tr. 45 - 52.
31. Nguyễn Thu Yến, Trần Văn Tiến, Huỳnh Phƣơng Liên, Phan Thị Ngà và
cộng sự (2000), "Hiệu quả phòng bệnh VNNB ở huyện Gia Lƣơng, Bắc
Ninh sau 5 năm gây miễn dịch bằng vác xin VNNB do Viện Vệ sinh


lxxvi

Dịch tễ Trung ƣơng sản xuất", Tuyển tập cơng trình 1997 - 2000 Viện Vệ
sinh Dịch tễ Trung ương, Nhà xuất bản Y học, Hà Nội, tr. 63-66.

TIẾNG ANH
32. Alexander J.

P., Baden L., Pallansch M.

A., Anderson L.

J

(1994). "Enterovirus 71 infections and neurologic disease - United
States, 1977 - 1991", Journal Infect Dis.169, pp. 905–908.
33.

"Arboviral

Infections of the Central Nervous System -- United States.

1996-1997", Vol 47, No. MMWR25. P. 517.
34. Atassi M Z et al (2000), "Molecular Immunology", pp. 1234-1239.
35. Attoui H., Charrel, R. N., Billoir, F., Cantaloube, J.-F., de Micco, P. &
de Lamballerie (1998), "Comparative sequence analysis of American,
European and Asian isolates of viruses in the genus Coltivirus", Gen
Virol, vol. 79, pp. 2481–2489.
36. Attoui H., Billoir F., Biagini P., de Micco P. & de Lamballerie X. s.l.
(2000), "Complete squence determination and genetic analysis of Bana
virus and Kadipiro virus: prosal for assignment to a new genus
(seadornavirus) within the faminy Reoviridae". J. Gen Virol, vol. 81, pp.
1507-1515.
37. Attoui H., et. al (2005). “Coltiviruses and seadornaviruses in North
America, Europem and Asia”. Journal Emerging Infectious diseases, 11

pp. 1673 - 1679.
38. Brown S E, B M Gorman, R B Tesh, and D L Knudson (1993),
"Coltiviruses isolated from Mosquitoes Collection in Indonesia",
Virology. J, vol 196 (89), pp. 363-367.


lxxvii

39. Bryant J. Crabtree M. B. Nam V. S., Yen N. T., Duc H. M., Miller B. R
(2003). “Isolation of arboviruses from mosquitoes collected in Northern
Vietnam”. The American Society of Medicine and Hygiene, 73, 92 pp.
470 – 473.
40. Brunel D., Leveque N., Jacques J., Renois F., Motte J., Andreoletti L.
(2008). Clinical and virological features of an aseptic meningitis
outbreak in North-Eastern France, 2005. J. Clin Virol 42 pp. 225-228.
41. Calisher C H, Shope R E and Walton T E (1998), "Cell culture for
diagnosis of Arbovirus infection in livestock and wildlife", Journal of
tissue culture method, vol 11 (3), pp. 157-163.
42. CDC (2009), "Arboviral Encephalitides".
43. Chaudhuri A., Kennedy P. G. E. s.l. (2002), "Diagnosis and treatment of
viral encephalitis", Postgrad Med J., vol. 78, pp. 575-583.
44. Chen B. San-ju TAO (2005), "Studies of Coltivirus in China", Chinese
medical Journal, Vol.118, No.7, pp. 581-586.
45. Edwin H. Lennette, PhD David D Lannette, PhD Evelyne T Lennette
(2005), "Diagnostic procedures for viral", Rickettsia and Chlamydial
infections, 7th edition, Vol. 11, pp. 189-209.
46. Fidan Jmor, Hedley CA Emsley, Marc Fischer, Tom Solomon, and
Penny Lewthwaite (2008), "The incidence of acute encephalitis
syndrome in Western industrialised and tropical countries", Viro J , Vol.
134, pp.5.

47. Field N B, Niber M L, Schiff L A, Tyler K L (1996), "Reoviridae,
Reovirus and their replication, Reovirus", Fields Virology, Third Edition,
pp. 1553-1555, 1557-1588, 1597-1617.


lxxviii

48. Field B. N. Knipe D. M, Holey P M et al (1996), "Field Virology".
Lippincott Reven Press. 3th Edition, pp. 825-885, 931-1023.
49. Goh K. J., Tan C. T., Chew N. K., Tan P. S. K., Kamarulzaman A., Sại
S. A., Wong K. T., Abdullan B. J. J., Chua K. B., Lam S. K. (2000),
"Clinical feature of Nipah virus encephalitis among pig farmers in
Malaysia", The New England Journal of Medicine, Vol. 342 (17), pp.
1229 – 1235.
50. Gong Z. D., Xu P. T., Wang Y. M., et al.(1992), "Another type of new
arboviruses recovered from mosquitoes and patients with fever of
unknown origin in Yunnan province", Chin J Virol (Chin), vol 8, pp.
152-157.
51. Ha D. Q., Calisher C. H., Tien P. H., Karabatsos N., and Gubler D. J.
(1995). “Isolation of a newly recognized Alphavirus from mosquitoes in
Vietnam and evidence for human infection and disease”. Am. J. Trop.
Med. Hyg. 53(1) pp. 100 -104.
52. Hallow E. and Lane D. (2001), "Production of antibody", 4th Edition,
pp. 10-45.
53. Hazelton P R, Gelderblon H R (2003), "Electron microscopy for rapid
diagnosis of infection agent in emergent situation", Emerging Infectious
Disease, vol 9(3), pp. 294-303.
54. Hein, J.J. (1990). “Unified approach to alignment and phylogenies.” In
Methods in Enzymology, Vol. 183, pp. 626-645.
55. Higgins, D.G. and P.M. Sharp (1989). “Fast and sensitive multiple

sequence alignments on a microcomputer.” CABIOS, Vol. 5, No. 2, pp.
151-153.


lxxix

56. Hillis, D. M & Bull, J. J. (1993). An empirical test of bootstrapping as a
method for assessing confidence in phylogenetic analysis. Syst Biol 42,
pp. 182-182.
57. Hsu C. H., Lu C.Y., Shao P. L., Lee P. I., Kao C. L., Chung M. Y.,
Chang L. Y., Huang L. M. (2011). Epidemiologic and clinical features of
non-polio enteroviral infections in northern Taiwan in 2008. J Microbiol
Immunol Infect, 44, pp. 265-273.
58. Hurk A. V., Ritchie S., and Montgomery B. (1996), "The mosquitoes of
North Queensland: Identification and Biology, includes common biting
midges, in Queensland Health", Queensland Government, pp. 174.
59. Igarashi A, Mastuo S and Hayashi K (1982), "Isolation of Japanese
encephalitis and Getah viruses from mosquitoes colected in Nagasaki
city in the year of 1980-1981, using Aedes alpopictus clone C6/36 cells",
Tro. Med J. no. 34(78), pp. 47-53.
60. Igarashi A (2000), "Technical manual of Arbovirus study", Institute of
Tropical medicine Nagasaki University- Japan, pp. 2-26.
61. Jaafar F. M., Attoui H., Mertens P. Philippe P. C. De Micco, DE
Lamballerie Xavier (2005), "Structural organization of an encephalitis
human isolate of Banna virus", Journal of General Virology, Vol.86(4),
pp.1147-1157.
62. Knipe D. M., Howley P. M. (2007) Fields Virology, Fifth Edition,
Volume 1, Section 1, General Virology, pp. 3 – 606.
63. Kuno G (1997), "Universal diagnostic RT- PCR protocol for
Arboviruses", Journal of Virology Methods, vol. 72 (89), pp.27-41.

lxxx

64. Kuno G, Gubler D J et al (1985), "Antigen capture ELISA for the
identification of dengue viruses", J. of Virolog. Meth, Vol. 12 (93), pp.
93-103.
65. Kumar R., Tripathi P., Singh S. and Bannerji G. (2006), "Clinical
features in children Hospitalized during the 2005", Epidemic of Japanese
encephalitis in Uttar Pradesh, India. Journal of Clinical infectious
díeases pp. 123 – 131.
66. Kumar A., Shukla D., Kumar R., Idris M. Z., Misra U. K., Dhole T. N.
(2011). An epidemic of encephalitis associated with human enterovirus
B in Uttar Pradesh, India, 2008. J. Clin Virol 51 pp. 142-145.
67. Kurtz J. B, Steven J Read (1999), "Laboratory diagnostics of common
viral infections of the central nervous system by using a single multiplex
PCR screening assay", J. of clinical micrology, vol. 37(5), pp.1352-1355.
68. Kupila L., Vuorinen T., Vainionpäā R., Marttila R. J., and Kotilainen P.
(2005), "Diagnosis of enteroviral meningitis by use of polymerase chain
reaction of cerebrospinal fluid, stool, and serum specimens", Clinical
Infectious Diseases, vol. 40, no. 7, pp. 982-987.
69. Kuwata R., Nga P. T., Yen N. T., Hoshino K.,Isawa H., Higa Y, Hoang
N. V., Trang B. M., Loan D. P., Phong T. V., Sasaki T., Tsuda Y.,
Kobayashi M., Sawabe K and Takagi M. (2013). Surveillance of
Japanese encephalitis virus infection in mosquitoes in Vietnam from
2006 to 2008. Am. J. Trop. Med. Hyg. 88 (4), pp. 681 – 688.
70. Lauber C. , Ziebuhr J., Junglen S., Drosten C., Zirkel F., Nga P. T.,
Morita K., Snijder E. J., and Gorbalenya A. E. (2013). “Mesoniviridae: a
new family in the order Nidovirales formed 4 by a single species of
mosquito-borne viruses”. For publication in Archives of Virology

lxxxi

71. Li QP, Xie XC, Zhi Q, et al. s.l. (1992), "First isolation of 8 strains of
new orbivirus (Banna) from patients with innominate fever in Xinjiang",
Endemic Dis Bull (Chin), Vol. 7, pp. 77-81.
72. Liu H. et al. (2010), "Banna virus in China, 1987-2007", Emerging
Infectious Diseases, Vol. 16, No. 3, pp. 514-517.
73. Lowry P. W., Truong D. H., Hinh L. D., Ladinsky J. L., Karabatsos N.,
Cropp C. B., Martin D., Gubler D. J. (1998). Japanese encephalitis
among hospitalized pediatric and adult patients with acute encephalitis
syndrome in Hanoi, Vietnam 1995. Am J Trop Med Hyg, 58, pp. 324329.
74. Mackenzie J. S., Chua K. B., Daniels P. W., Eaton B. T., field H. E.,
Hall R. A., Halpin K., Johansen C. A., Kirkland P. D., Lam S. K.,
McMinn P., Nisbet D. J., Paru R., Pyke A. T., Ritchie S. A., siba P.
Smith d. w., Smith G. a., Hurk A. F., Wang L. F., Williams D. T. (2001).
Emerging viral Diseases of Southeast Asia and the Western Pacific.
Emerging Infectious Disease, Vol. 7, No. 3, pp. 497 - 504.
75. Martin D. A., Muth D. A., Brown T, Jonhson A, Karabatos N. and
Roehrig J. T. (2000), "Standardization of Immunoglobumin M capture
enzyme- linked Immunosorbent assay for Routine diagnosis of Arboviral
infection", Journal of clinical microbiology, Vol. 89 (90), pp. 18231826.
76. Max L. N. and Leslie A. S. (2001), "Reovirus and their replication",
Fields Virology, Chapter 52, pp. 1557- 1588.
77. Mertens P, s.l, "The dsRNA viruses", Virus Res, Vol. 101, pp. 29-43
78. Mertens, P. P. C., Arella, M., Attoui, H. & 41 other authors (2000),
"Reoviridae. In Virus Taxonomy: Seventh Report of the International

lxxxii

Committee on Taxonomy of Viruses", New York: Academic Press, pp.
395–480.
79. Mohd

Jaafar

F,

Attou

(2004),

"VP9-

based

enzyme-linked

immunosorbent assay for detection of immunoglobulin G antibodies to
Banna virus (genus seadornavirus)", J.Virol Methods, Vol. 116 (89), pp.
55-61.
80. Mohd Jaafar F, Attoui H, Bahar MW, Siebold C, Sutton G, Mertens PP,
De Micco P, Stuart DI, Grimes JM, De Lamballerie X. s.l. (2005), "The
structure and function of the outer coat protein VP9 of Banna virus",
Structure, Vol. 13, pp. 17-28.
81. Mostafaie A., Roodbari F., Roustai M. H., , Soleimanjdahi H., Foroshani
R. S. and Sabahi F (2003), "Development of an enzyme-linked
immunosorbent assay for immunoglobulin M antibodies against measles

virus", Clinical and Diagnosis laboratory Immunology, Vol.10, No.3,
pp. 439-442.
82. Muller M, Montgomery B., Ingram A., and Ritchie S. (2001), "First
records of Culex gelidus from Australia", Journal of the American
Mosquito Control Association, Vol. 17, No. 1, pp. 79-80.
83. Nabeshima T, Nga P T, Guillermo P, Parquet M, C Yu F, Thuy N T,
Trang M B, Hien N T, Nam V S, Inoue S, Hasebe F and Morita K (
2008), "Isolation and molecular characterization of Banna virus derived
from mosquitoes in Northern and Central Vietnam", Emerging Infectious
Disease, Vol 14 (8), pp. 1276 - 1279.
84. Nabeshima T, Loan H.T, Inoue S., Sumiyoshi M., Haruta Y., Nga P.T.,
Huoung V.T., del Carmen Parquet M., Hasebe ,F, Morita K (2009).
Evidence of frequent introductions of Japanese encephalitis virus from


lxxxiii

south-east Asia and continental east Asia to Japan. J. Gen Virol. pp.827832.
85. Nga P. T., Partquet M. C., Cuong V. D., Ma S. P., Hasebe F., Inoue S.,
Takagi M., Makino Y. and Morita K (2004). Shift in Japanese
Encephalitis virus (JEV) genotype circulating in northern Vietnam:
Implications for frequent introductions of JEV from Southeast Asia to
East Asia. J. Gen Virol, pp. 1625 – 1631.
86. Nga P. T., Parquet Mdel C., Lauber C., Parida M., Nabeshima T., Yu
F., Thuy N. T., Inoue S., Ito T., Okamoto K., Ichinose A., Snijder E.
J., Morita K., Gorbalenya A. E. (2011). Discovery of the first insect
nidovirus, a missing evolutionary link in the emergence of the largest
RNA virus genomes. PLoS Pathog. Sep; 7(9):e1002215.
87. Norguera A. et al (2004), "Reovirus type 2 isolated from cerebrospinal
fluid", The Pediatric Infectious Disease Journal, vol 23, no 4, pp. 373 –

375.
88. Rayamajhi A., Ansari I., Ledger E., Bista K. P., Impoinvil D. E.,
Nightingale S., Kumar R., Mahaseth C., Solomon T., Griffiths M. J.
(2011). Clinical and prognostic features among children with acute
encephalitis syndrome in Nepal; a retrospective study. BMC Infect Dis
1471 – 2334/11/294 (12 pp).
89. Paireau J., Tuan N. H., Lefranỗois R., Buckwaiter M. R., Nghia N. D.,
Hien N. T., Lortholary O., Poirée S., Manuguerra J. C., Gessain A.,
Albert M. L., Brey P. T., Nga P. T., Fontanet A.. 2012. Litchi associated Acute Encephalitis in Children Northern Vietnam, 2004 2009. Journal Emerging Infectious Disease, Vol 16, No 11, pp. 1817 1824.


lxxxiv

90. Sirivanakarn S. 1976. A revision of the subgenus Culex in the Oriental
region

(Diptera:

Culicidae).

Contributions

of

the

American

Entomological Institute, Vol. 12. No. 2. pp. 1-272.
91. Sips G. J., Wilschut J., Smit J. M. (2012). Neuroinvasive flavivirus

infections. Rev Med Virol, 22 pp. 69-87.
92. Steven J. R., Katie J. M. J. and Charles R. M. B. (1997), "Aseptic
Meningitis and encephalitis: the role of PCR in the diagnostic
laboratory", J. Clinical microbiology, Vol. 56(8), pp. 691-696.
93. Tao S. J., Chen B. Q. (2005) Studies of Coltivirus in China. Clinical
Medical Journal, 118 (7) pp. 581 – 586.
94. Tan L. V., Qui P. T., Ha D. Q., Hieu N. B., Bao L. Q., Cam B.V., Khanh
T. H., Hien T. T., Chau N. V. V., Tam T. T., Hien V. M., Nga T. V. T.,
Schultsz C., Farra J., van Doorn H. R., de Jong M. D. (2010). Viral
Etiology of encephalitis in Children in Southern Vietnam: Results of a
One-Year prospective descriptive study. PLoS Negl Trop. Dis. 4 (10),
pp. 854 - 854.
95. Tamura K, Dudley J, Nei M & Kumar S (2007) MEGA4: Molecular
Evolutionary Genetics Analysis (MEGA) software version 4.0.
Molecular Biology and Evolution 24, pp. 1596-1599.
96. Thompson J. D., Higgins D. G., Gibson T. J. (1994). CLUSTAL W
Improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment
through sequence weighting, positions-specific gap penalties and weight
matrix choice. Nucleic Acids Res 2, pp. 4673–4680.
97. Yen N. T., Duffy M. R., Hong N. M., Hien N. T., Fischer M., and Hills
S. L. (2010). Survellance for Japanese encephalitis in Vietnam, 1998 2007. Am. J. Trop. Med. Hyg. 83 (4), pp. 816 - 819.


lxxxv

98. Voller A., Bidwell D. E., Bartlett A. (1982). ELISA technique in
virology. Alan Liss New York, pp. 59-81.
99. Xu P. T., Wang Y. M. (1990). New orbiviruses isolated from unknown
fever and encephalitis patients in Yunnan province. Chin J Virol, Vol.6,
pp. 27-33.

100. Weaver S. C., Powers A. M., Brault A. C. and Barret A. D. T. (1999),
"Molecular

epimiological

studies

of

veterinary

Arboviral

encephalitides", Vet journal, Vol. 157 (4), pp.123-138.
101. Weaver R. F. (1999). Molecular Biology. 1st Edited WCB/McGraw Hill,
Boston, MA.
102. WHO (1985), "Progress in enzyme immunoassay: production of
reagents, experimental design, and interpretation", Bullection of the
WHO, Vol. 63(4), pp.793-811.