bài giảng tin học ứng dụng trong hóa học chương 3 chem office đại học công nghiệp thành phố hồ chí minh

CHƢƠNG 3: CHEM OFFICE
TIN HỌC ỨNG DỤNG TRONG
HÓA HỌC
TRƢỜNG ĐẠI HỌC CÔNG NGHIỆP TP.HCM
KHOA CÔNG NGHỆ HOÁ HỌC
NỘI DUNG
1. CHEMBIODRAW 2D
2. CHEMBIO 3D
3. BÀI TẬP THỰC HÀNH
1.CHEMBIODRAW 2D
NỘI DUNG
1.1 KHỞI ĐỘNG CHEMBIODRAW 2D
1.2 GIAO DIỆN - THANH CÔNG CỤ
1.3 HƢỚNG DẪN SỬ DỤNG
CHEMBIODRAW 2D
1.CHEMBIODRAW 2D
1.1 KHỞI ĐỘNG CHEMBIODRAW 2D
B1. Nhấp chuột nút Start.
B2. Chọn All Programs Chembio office
2008

Chembiodraw.
B3. Nhấp chuột vào biểu tượng
1.CHEMBIODRAW 2D
1.2 GIAO DIỆN – THANH CÔNG CỤ
Thanh Menu
Thanh thông
dụng
Thanh kiểu
chữ
Thanh công cụ

vẽ sinh học
Thanh công cụ
vẽ chính
1.CHEMBIODRAW 2D
1.2 THANH CÔNG CỤ
 Thanh Menu
 Thanh kiểu chữ : (text style toolbar)
 Thanh thông dụng (general toolbar)
 Thanh đối tượng (object toolbar)
 Thanh công cụ vẽ sinh học (biodraw tool)
1.CHEMBIODRAW 2D
1.2 THANH CÔNG CỤ
Thanh công
cụ vẽ chính
(main tool
palette)
1.CHEMBIODRAW 2D
1.2 THANH CÔNG CỤ
Để bật/tắt các thanh
công cụ: Vào View
chọn các thanh công
cụ tương ứng cần
muốn mở.

1.CHEMBIODRAW 2D
1.2 THANH CÔNG CỤ
Bảng thông tin tọa độ (info window)
 Bảng hệ thống tuần hoàn các nguyên tố hoá
học (periodic table)
Bảng tính chất hoá – lý của các chất (chemical

properties):
 Bảng phân tích chi tiết (analysis)
 Bảng đồ các ký tự (character map)
1.CHEMBIODRAW 2D
1.2 THANH CÔNG CỤ
Info Window
Chemical
Properties Window
Analysis Window
1.CHEMBIODRAW 2D
1.2 THANH CÔNG CỤ
Periodic
Table Window
1.CHEMBIODRAW 2D
1.2 THANH CÔNG CỤ
Character
Map Window
1.CHEMBIODRAW 2D
1.3 HƢỚNG DẪN SỬ DỤNG
a. Vẽ một cấu trúc:
Trong phần này ta vẽ cấu trúc phân tử 2-
propanone và thêm tên vào


Các bƣớc thực hiện nhƣ sau:
 Tạo liên kết:
 Từ menu Object, chọn Fixed Lengths và
Fixed Angles.
 Chọn View > Show Main Toolbar.
Từ thanh công cụ Main Toolbar, chọn công cụ

Solid Bond
 Con trỏ biến thành dấu cộng (+), click chuột và
kéo sang phải, đường liên kết xuất hiện, liên kết
được mở rộng với chiều dài được cố định và ở một
góc 30
0
.
 Click vào điểm cuối bên phải của liên kết mới vừa
tạo để thêm liên kết thứ 2. Liên kết thứ 2 được vẽ và
tạo thành một góc 120
0
giữa 2 liên kết.



 Để tạo cacbon thứ 3, ta thực hiện giống như
bước trên.
 Thay đổi bậc liên kết:
 Để tạo liên kết đôi, double click vào liên kết vừa tạo
hoặc click chuột phải vào liên kết chọn Double >
Plain.
 Thêm tên nguyên tử vào cấu trúc:
 Dùng công cụ Text , click vào cuối liên kết đôi,
hộp text box xuất hiện ở cuối liên kết
 Gõ „O‟ vào hộp text box (chữ O hoa).
 Đóng hộp text bot bằng cách nhấn phím Esc hoặc
chọn công cụ khác.
 Thêm tên chú thích vào phân tử:
 Dùng công cụ Text , click vào phía dưới cấu
trúc, hộp text box xuất hiện.

 Trong hộp text box, gõ “2-propanone”.
 Nhấn Esc hoặc chọn công cụ khác.

b. Vẽ cấu trúc phân tử phức tạp bằng cách dùng
vòng:





 Tạo vòng:
 Click và công cụ vòng Cyclohexane .
 Click vào vùng trống trên cửa sổ để thêm vòng.
 Click hợp nhất với các vòng theo hình biểu diễn
dưới đây.



 Di chuyển các nguyên tử và các nối liên kết từ
vòng:
 Click vào công cụ Eraser
 Trỏ vào nguyên tử được biểu diễn ở dưới:


 Click vào nguyên tử và liên kết cần xóa
 Kết quả xóa được biểu diễn dưới đây:

 Click vào công cụ Solid Bond
 Double click vào chổ liên kết cần thêm vào, liên kết
đơn sẽ chuyển thành liên kết đôi



 Thêm tên nguyên tử carbon:
 Clich vào công cụ Text
 Trỏ đến chổ nguyên tử cần được thêm vào
 Gõ phím “CH” vào trong hộp thoại (lưu ý: phải gõ
chữ hoa đúng biểu tượng tên nguyên tố).
 Tiếp tục gõ “O” vào nơi cần thêm vào. Kết quả
được biểu diễn ở phía dưới.

 Lƣu và đóng cửa sổ làm việc:
 Chọn File>Save As.
 Gõ huongdan1, vào hộp text box thích hợp.
 Chọn folder nơi lưu file.
 Click Save.
c. Vẽ cấu trúc phân tử theo cách biểu diển Fischer
 Chọn File > Open Special chọn ACS Document
1996
 Click chọn công cụ Solid Bond
 Trỏ vào cửa sổ làm việc, kéo thẳng xuống để vẽ
liên kết thứ nhất.
 Trỏ vào điểm cuối của nguyên tử, kéo thẳng xuống
để vẽ liên kết thứ 2 (hộp gợn sóng màu đỏ xuất hiện
bởi vì Show Chemical Warnings được chọn, bây giờ
ta giữ chọn nó).
 Tiếp tục như bước trên để vẽ các liên kết còn lại

(tổng cộng 5 liên kết).




 Thêm liên kết nằm ngang của nguyên tử thứ hai
trong mạch phân tử bạn tạo:
 Thêm liên kết nằm ngang, trỏ vào hộp đầu tiên
Chemical Warning và click nó (hộp cảnh báo màu đỏ
sẽ mất đi ngay khi bạn thêm liên kết vào).
 Click lần nữa để thêm liên kết đối diện nằm ngang.
 Lặp lại các bước như ban đầu để thêm các liên kết
nằm ngang còn lại





 Gán thêm các nhóm vào đầu và cuối của chuổi
mạch phân tử:
 Chọn công cụ Text
 Click vào nguyên tử carbon ở hàng đầu tiên, hộp
text box xuất hiện và gõ vào “CHO”.
 Click vào nguyên tử cacbon thấp nhất và gõ vào
“CH
2
OH”.
25

 Click vào nơi nguyên tử cacbon cần thêm hydro,
sauđó gõ “H”.